当前蛋白身份：E7EWM1
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4CSJ The discovery of potent selective glucocorticoid receptor modulators, suitable for inhalation 提交 2014-03-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
741–753（13 aa）
片段：RESIDUES 741-753
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NN7 N-[(2S)-1-[[1-(4-fluorophenyl)indazol-4-yl]amino]propan-2-yl]-2,4,6-trimethyl-benzenesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；10% PEG8000, 20% ETHYLENE GLYCOL AND 0.1 M HEPES PH7.5
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.234 |
| 4NIE Crystal structure of the orphan nuclear receptor ROR(gamma)t ligand-binding domain in complex with small molecule ligand 提交 2013-11-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
686–697（12 aa）
片段：UNP residues 684-697
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未记录 | NBH N-(4-{[benzyl(propyl)amino]methyl}phenyl)-2-[4-(ethylsulfonyl)phenyl]acetamide × 1 DMX 3-[BENZYL(DIMETHYL)AMMONIO]PROPANE-1-SULFONATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2M Ammonium Sulfate, 0.1M Bis-Tris, pH 6.5, 14% (w/v) PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.247 |
| 4NIE Crystal structure of the orphan nuclear receptor ROR(gamma)t ligand-binding domain in complex with small molecule ligand 提交 2013-11-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
686–697（12 aa）
片段：UNP residues 684-697
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未记录 | NBH N-(4-{[benzyl(propyl)amino]methyl}phenyl)-2-[4-(ethylsulfonyl)phenyl]acetamide × 1 DMX 3-[BENZYL(DIMETHYL)AMMONIO]PROPANE-1-SULFONATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；0.2M Ammonium Sulfate, 0.1M Bis-Tris, pH 6.5, 14% (w/v) PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.247 |
| 5APH Ligand complex of RORg LBD 提交 2015-09-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
686–697（12 aa）
片段：UNP RESIDUES 686-697
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未记录 | VYI N-(2-FLUOROPHENYL)-4-[(4-FLUOROPHENYL)SULFONYL]-2,3,4,5-TETRAHYDRO-1,4-BENZOXAZEPIN-6-AMINE × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.54 Å R-free 0.242 |
| 5APJ Ligand complex of RORg LBD 提交 2015-09-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
686–697（12 aa）
片段：UNP RESIDUES 686-697
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未记录 | 76E 2-CHLORO-6-FLUORO-N-[4-[3-(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL]SULFONYL-3,5-DIHYDRO-2H-1,4-BENZOXAZEPIN-7-YL]BENZAMIDE × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.08 Å R-free 0.237 |
| 5UAN Crystal structure of multi-domain RAR-beta-RXR-alpha heterodimer on DNA 提交 2016-12-19 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 C
687–696（10 aa）
片段：UNP residues 687-696
链 D
687–696（10 aa）
片段：UNP residues 687-696
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 9CR (9cis)-retinoic acid × 1 REA RETINOIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；MES, PEG300
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分辨率 3.51 Å R-free 0.270 |
| 5YXB A ligand binding to FXR 提交 2017-12-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
741–751（11 aa）
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未记录 | 93O 2-methoxyethyl (2E)-3-phenylprop-2-en-1-yl 2,6-dimethyl-4-(3-nitrophenyl)pyridine-3,5-dicarboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297 K；200mM NaSCN, 25% (W/V) PEG 600
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.282 |
| 5YXJ FXR ligand binding domain 提交 2017-12-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
741–751（11 aa）
|
未记录 | 93U 2-[benzyl(methyl)amino]ethyl methyl 2,6-dimethyl-4-(3-nitrophenyl)pyridine-3,5-dicarboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2M Lithium sulfate monohydrate, 0.1M Tris pH 8.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.248 |
| 5YXJ FXR ligand binding domain 提交 2017-12-05 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
741–751（11 aa）
|
未记录 | 93U 2-[benzyl(methyl)amino]ethyl methyl 2,6-dimethyl-4-(3-nitrophenyl)pyridine-3,5-dicarboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.2M Lithium sulfate monohydrate, 0.1M Tris pH 8.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.62 Å R-free 0.248 |
| 5YXL A ligand M binding to FXR 提交 2017-12-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
743–750（8 aa）
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未记录 | NIW 2-methoxyethyl propan-2-yl 2,6-dimethyl-4-(3-nitrophenyl)pyridine-3,5-dicarboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2% v/v Tacsimate pH 7.0, 0.1M HEPES pH 7.5, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.24 Å R-free 0.223 |
| 5YXL A ligand M binding to FXR 提交 2017-12-05 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
743–750（8 aa）
|
未记录 | NIW 2-methoxyethyl propan-2-yl 2,6-dimethyl-4-(3-nitrophenyl)pyridine-3,5-dicarboxylate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2% v/v Tacsimate pH 7.0, 0.1M HEPES pH 7.5, 20% w/v Polyethylene glycol 3350
|
分辨率 2.24 Å R-free 0.223 |
| 7APO Crystal structure of RARalpha ligand binding domain in complex with a fragment of the TIF2 coactivator 提交 2020-10-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
686–713（28 aa）
链 D
686–713（28 aa）
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未记录 | EQN 4-{[(5,5,8,8-tetramethyl-5,6,7,8-tetrahydronaphthalen-2-yl)carbonyl]amino}benzoic acid × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M Lithium Chloride, 0.1M MES pH6.0, 20% PEG6000
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分辨率 2.40 Å R-free 0.241 |
| 7BK4 Crystal structure of RXRalpha ligand binding domain in complex with a fragment of the TIF2 coactivator 提交 2021-01-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
686–713（28 aa）
链 D
686–713（28 aa）
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未记录 | LG2 6-[1-(3,5,5,8,8-PENTAMETHYL-5,6,7,8-TETRAHYDRONAPHTHALEN-2-YL)CYCLOPROPYL]PYRIDINE-3-CARBOXYLIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M Na Hepes, 0.2 M sodium acetate pH 7.5, 27% PEG 3350
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.265 |
| 7RKE Estrogen Receptor Alpha Ligand Binding Domain Y537S in Complex with 4-(((2-chloro-5-phenylthieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino)methyl)phenol and GRIP Peptide 提交 2021-07-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
687–696（10 aa）
|
未记录 | 5VP 4-{[(2-chloro-5-phenylthieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}phenol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；PEG 3,350, MgCl2, pH 8
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.273 |
| 7RKE Estrogen Receptor Alpha Ligand Binding Domain Y537S in Complex with 4-(((2-chloro-5-phenylthieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino)methyl)phenol and GRIP Peptide 提交 2021-07-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
687–696（10 aa）
|
未记录 | 5VP 4-{[(2-chloro-5-phenylthieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}phenol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；PEG 3,350, MgCl2, pH 8
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.273 |
| 7RNM Estrogen Receptor Alpha Ligand Binding Domain Y537S Mutant in Complex with 2-(2-Chloro-5-phenylthieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl)isoindolin-5-ol and GRIP Peptide 提交 2021-07-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
687–696（10 aa）
链 D
687–696（10 aa）
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未记录 | 61Z 2-(2-chloro-5-phenylthieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-2,3-dihydro-1H-isoindol-5-ol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；PEG 3350, MgCl2
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分辨率 1.90 Å R-free 0.221 |
| 7SFO Estrogen Receptor Alpha Ligand Binding Domain Y537S in Complex with 3-(((2-chloro-5-phenylthieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino)methyl)phenol and GRIP Peptide 提交 2021-10-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
687–696（10 aa）
链 D
687–696（10 aa）
|
未记录 | 98L 3-{[(2-chloro-5-phenylthieno[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]methyl}phenol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；PEG 8,000, HEPES pH 8.0, MgCl2
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分辨率 1.90 Å R-free 0.226 |