当前蛋白身份:E7FEV5 重新检索
本组结构的主要差异维度
突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3WXE Crystal structure of CYLD USP domain (C596S) in complex with Met1-linked diubiquitin 提交 2014-07-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 578–780(203 aa) 片段:USP domain, UNP residues 578-780, Linker, 850-951
链 A 850–951(102 aa) 片段:USP domain, UNP residues 578-780, Linker, 850-951
突变:C596S, B-box deletion 突变:C596S, B-box deletion 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;50mM Tris-HCl buffer, 9% PEG4000, 100mM magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.247
3WXF Crystal structure of CYLD USP domain (C596S E674Q) in complex with Met1-linked diubiquitin 提交 2014-07-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 578–780(203 aa) 片段:USP domain, UNP residues 578-780, Linker, 850-951
链 A 850–951(102 aa) 片段:USP domain, UNP residues 578-780, Linker, 850-951
突变:C596S, E674Q, B-box deletion 突变:C596S, E674Q, B-box deletion 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M Tris-HCl buffer, 23% PEG3350, 0.2M ammonium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.229
3WXF Crystal structure of CYLD USP domain (C596S E674Q) in complex with Met1-linked diubiquitin 提交 2014-07-30 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 578–780(203 aa) 片段:USP domain, UNP residues 578-780, Linker, 850-951
链 C 850–951(102 aa) 片段:USP domain, UNP residues 578-780, Linker, 850-951
突变:C596S, E674Q, B-box deletion 突变:C596S, E674Q, B-box deletion SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M Tris-HCl buffer, 23% PEG3350, 0.2M ammonium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.229
3WXG Crystal structure of CYLD USP domain (C596A) in complex with Lys63-linked diubiquitin 提交 2014-07-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 578–780(203 aa) 片段:USP domain, UNP residues 578-780, Linker, 850-951
链 A 850–951(102 aa) 片段:USP domain, UNP residues 578-780, Linker, 850-951
突变:C596A, B-box deletion 突变:C596A, B-box deletion 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.2M sodium malonate buffer, 18% PEG3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.10 Å R-free 0.246
3WXG Crystal structure of CYLD USP domain (C596A) in complex with Lys63-linked diubiquitin 提交 2014-07-30 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 D 578–780(203 aa) 片段:USP domain, UNP residues 578-780, Linker, 850-951
链 D 850–951(102 aa) 片段:USP domain, UNP residues 578-780, Linker, 850-951
突变:C596A, B-box deletion 突变:C596A, B-box deletion 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.2M sodium malonate buffer, 18% PEG3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 3.10 Å R-free 0.246