当前蛋白身份:E7FEV5
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3WXE Crystal structure of CYLD USP domain (C596S) in complex with Met1-linked diubiquitin 提交 2014-07-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
578–780(203 aa)
片段:USP domain, UNP residues 578-780, Linker, 850-951
链 A
850–951(102 aa)
片段:USP domain, UNP residues 578-780, Linker, 850-951
|
突变:C596S, B-box deletion 突变:C596S, B-box deletion | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;50mM Tris-HCl buffer, 9% PEG4000, 100mM magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.247 |
| 3WXF Crystal structure of CYLD USP domain (C596S E674Q) in complex with Met1-linked diubiquitin 提交 2014-07-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
578–780(203 aa)
片段:USP domain, UNP residues 578-780, Linker, 850-951
链 A
850–951(102 aa)
片段:USP domain, UNP residues 578-780, Linker, 850-951
|
突变:C596S, E674Q, B-box deletion 突变:C596S, E674Q, B-box deletion | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M Tris-HCl buffer, 23% PEG3350, 0.2M ammonium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.229 |
| 3WXF Crystal structure of CYLD USP domain (C596S E674Q) in complex with Met1-linked diubiquitin 提交 2014-07-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
578–780(203 aa)
片段:USP domain, UNP residues 578-780, Linker, 850-951
链 C
850–951(102 aa)
片段:USP domain, UNP residues 578-780, Linker, 850-951
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突变:C596S, E674Q, B-box deletion 突变:C596S, E674Q, B-box deletion | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M Tris-HCl buffer, 23% PEG3350, 0.2M ammonium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.229 |
| 3WXG Crystal structure of CYLD USP domain (C596A) in complex with Lys63-linked diubiquitin 提交 2014-07-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
578–780(203 aa)
片段:USP domain, UNP residues 578-780, Linker, 850-951
链 A
850–951(102 aa)
片段:USP domain, UNP residues 578-780, Linker, 850-951
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突变:C596A, B-box deletion 突变:C596A, B-box deletion | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.2M sodium malonate buffer, 18% PEG3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 3.10 Å R-free 0.246 |
| 3WXG Crystal structure of CYLD USP domain (C596A) in complex with Lys63-linked diubiquitin 提交 2014-07-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 D
578–780(203 aa)
片段:USP domain, UNP residues 578-780, Linker, 850-951
链 D
850–951(102 aa)
片段:USP domain, UNP residues 578-780, Linker, 850-951
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突变:C596A, B-box deletion 突变:C596A, B-box deletion | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;0.2M sodium malonate buffer, 18% PEG3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 3.10 Å R-free 0.246 |