当前蛋白身份:F4SQ36
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6VU3 Cryo-EM structure of Escherichia coli transcription-translation complex A (TTC-A) containing mRNA with a 12 nt long spacer 提交 2020-02-14 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:66-meric(66) 与全部聚合物一致 |
链 3
2–104(103 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 7M5D Cryo-EM structure of a non-rotated E.coli 70S ribosome in complex with RF3-GTP, RF1 and P-tRNA (state I) 提交 2021-03-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 54 PDB 声明:59-meric(59) 与全部聚合物一致 |
链 U
2–104(103 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7NSO Structure of ErmDL-Erythromycin-stalled 70S E. coli ribosomal complex with P-tRNA 提交 2021-03-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 U
2–103(102 aa)
|
未记录 | ERY ERYTHROMYCIN A × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7NSP Structure of ErmDL-Erythromycin-stalled 70S E. coli ribosomal complex with A and P-tRNA 提交 2021-03-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致 |
链 U
2–103(102 aa)
|
未记录 | ERY ERYTHROMYCIN A × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7NSQ Structure of ErmDL-Telithromycin-stalled 70S E. coli ribosomal complex with A and P-tRNA 提交 2021-03-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致 |
链 U
2–103(102 aa)
|
未记录 | TEL TELITHROMYCIN × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7NWW CspA-27 cotranslational folding intermediate 1 提交 2021-03-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 T
2–104(103 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 413 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;50 mM Tris-HCl, 70 mM NH4Cl, 30 mM KCl, 3.5 mM MgCl2, 8 mM putrescine, 0.5 mM spermidine, 1 mM DTT, 1 mM GTP, pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.05 Å |
| 7OIF CspA-27 cotranslational folding intermediate 2 提交 2021-05-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 T
2–104(103 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 416 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;50 mM Tris-HCl, 70 mM NH4Cl, 30 mM KCl, 3.5 mM MgCl2, 8 mM putrescine, 0.5 mM spermidine, 1 mM DTT, 1 mM GTP, pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7OIG CspA-27 cotranslational folding intermediate 3 提交 2021-05-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 T
2–104(103 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 400 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;50 mM Tris-HCl, 70 mM NH4Cl, 30 mM KCl, 3.5 mM MgCl2, 8 mM putrescine, 0.5 mM spermidine, 1 mM DTT, 1 mM GTP, pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7OII CspA-70 cotranslational folding intermediate 2 提交 2021-05-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 50 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 T
2–104(103 aa)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 422 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;50 mM Tris-HCl, 70 mM NH4Cl, 30 mM KCl, 3.5 mM MgCl2, 8 mM putrescine, 0.5 mM spermidine, 1 mM DTT, 1 mM GTP, pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |