当前蛋白身份:F5H388 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6NN6 Structure of Dot1L-H2BK120ub nucleosome complex 提交 2019-01-14 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致
链 L 75–151(77 aa)
突变:G76S 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6UPU Crystal structure of the Orientia tsutsugamushi OtDUB in complex with three molecules of ubiquitin 提交 2019-10-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 1–76(76 aa)
链 C 1–76(76 aa)
链 D 1–76(76 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH;pH 7.5;298 K;150 mM potassium thiocyanate, 32.5% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.209
6UPU Crystal structure of the Orientia tsutsugamushi OtDUB in complex with three molecules of ubiquitin 提交 2019-10-18 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 F 1–76(76 aa)
链 G 1–76(76 aa)
链 H 1–76(76 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH;pH 7.5;298 K;150 mM potassium thiocyanate, 32.5% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.209
6UPU Crystal structure of the Orientia tsutsugamushi OtDUB in complex with three molecules of ubiquitin 提交 2019-10-18 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 J 1–76(76 aa)
链 K 1–76(76 aa)
链 L 1–76(76 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH;pH 7.5;298 K;150 mM potassium thiocyanate, 32.5% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.209
6UPU Crystal structure of the Orientia tsutsugamushi OtDUB in complex with three molecules of ubiquitin 提交 2019-10-18 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 N 1–76(76 aa)
链 O 1–76(76 aa)
链 P 1–76(76 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH;pH 7.5;298 K;150 mM potassium thiocyanate, 32.5% (w/v) PEG 3350
分辨率 2.20 Å R-free 0.209