当前蛋白身份:F5H388
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6NN6 Structure of Dot1L-H2BK120ub nucleosome complex 提交 2019-01-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:dodecameric(12) 与全部聚合物一致 |
链 L
75–151(77 aa)
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突变:G76S | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.90 Å |
| 6UPU Crystal structure of the Orientia tsutsugamushi OtDUB in complex with three molecules of ubiquitin 提交 2019-10-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 B
1–76(76 aa)
链 C
1–76(76 aa)
链 D
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 7.5;298 K;150 mM potassium thiocyanate, 32.5% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.209 |
| 6UPU Crystal structure of the Orientia tsutsugamushi OtDUB in complex with three molecules of ubiquitin 提交 2019-10-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 F
1–76(76 aa)
链 G
1–76(76 aa)
链 H
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 7.5;298 K;150 mM potassium thiocyanate, 32.5% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.209 |
| 6UPU Crystal structure of the Orientia tsutsugamushi OtDUB in complex with three molecules of ubiquitin 提交 2019-10-18 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 J
1–76(76 aa)
链 K
1–76(76 aa)
链 L
1–76(76 aa)
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 7.5;298 K;150 mM potassium thiocyanate, 32.5% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.209 |
| 6UPU Crystal structure of the Orientia tsutsugamushi OtDUB in complex with three molecules of ubiquitin 提交 2019-10-18 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 N
1–76(76 aa)
链 O
1–76(76 aa)
链 P
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 7.5;298 K;150 mM potassium thiocyanate, 32.5% (w/v) PEG 3350
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分辨率 2.20 Å R-free 0.209 |