当前蛋白身份：F6YRW4
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4QWN Histone demethylase KDM2A-H3K36ME1-alpha-KG complex structure 提交 2014-07-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
36–364（329 aa）
片段：UNP residues 36-364
链 B
450–517（68 aa）
片段：UNP residues 450-517
|
未记录 | AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M Sodium citrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.264 |
| 4QWN Histone demethylase KDM2A-H3K36ME1-alpha-KG complex structure 提交 2014-07-16 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
36–364（329 aa）
片段：UNP residues 36-364
链 D
450–517（68 aa）
片段：UNP residues 450-517
|
未记录 | AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG 3350, 0.2 M Sodium citrate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.264 |
| 4QX7 Crystal structure of histone demethylase kdm2a-h3k36me2 with alpha-kg 提交 2014-07-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
36–364（329 aa）
片段：UNP residues 36-364
链 B
450–517（68 aa）
片段：UNP residues 450-517
|
未记录 | AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.15 M Na citrate, 18-22% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.258 |
| 4QX7 Crystal structure of histone demethylase kdm2a-h3k36me2 with alpha-kg 提交 2014-07-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
36–364（329 aa）
片段：UNP residues 36-364
链 D
450–517（68 aa）
片段：UNP residues 450-517
|
未记录 | AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.15 M Na citrate, 18-22% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.258 |
| 4QX8 Crystal structure of histone demethylase kdm2a-h3k36me3 complex with alpha-kg 提交 2014-07-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
36–364（329 aa）
片段：UNP residues 36-364
链 B
450–517（68 aa）
片段：UNP residues 450-517
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 1 AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Na Citrate,
18-20% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.227 |
| 4QX8 Crystal structure of histone demethylase kdm2a-h3k36me3 complex with alpha-kg 提交 2014-07-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
36–364（329 aa）
片段：UNP residues 36-364
链 D
450–517（68 aa）
片段：UNP residues 450-517
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 1 AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M Na Citrate,
18-20% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.227 |
| 4QXB crystal structure of histone demethylase KDM2A-H3K36ME3 with NOG 提交 2014-07-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
36–364（329 aa）
片段：UNP residues 36-364
链 B
450–517（68 aa）
片段：UNP residues 450-517
|
未记录 | OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.15 M CITRATE NA
20% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.207 |
| 4QXB crystal structure of histone demethylase KDM2A-H3K36ME3 with NOG 提交 2014-07-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
36–364（329 aa）
片段：UNP residues 36-364
链 D
450–517（68 aa）
片段：UNP residues 450-517
|
未记录 | OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.15 M CITRATE NA
20% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.207 |
| 4QXC Crystal structure of histone demethylase KDM2A-H3K36ME2 with NOG 提交 2014-07-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
36–364（329 aa）
片段：UNP residues 36-364
链 B
450–517（68 aa）
片段：UNP residues 450-517
|
未记录 | OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M CITRATE NA
18% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.204 |
| 4QXC Crystal structure of histone demethylase KDM2A-H3K36ME2 with NOG 提交 2014-07-19 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
36–364（329 aa）
片段：UNP residues 36-364
链 D
450–517（68 aa）
片段：UNP residues 450-517
|
未记录 | OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M CITRATE NA
18% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.204 |
| 4QXH Crystal structure of histone demethylase KDM2A-H3K36ME1 with NOG 提交 2014-07-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
36–364（329 aa）
片段：UNP residues 36-364
链 B
450–517（68 aa）
片段：UNP residues 450-517
|
未记录 | OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.15 M CITRATE NA,
20% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.243 |
| 4QXH Crystal structure of histone demethylase KDM2A-H3K36ME1 with NOG 提交 2014-07-20 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
36–364（329 aa）
片段：UNP residues 36-364
链 D
450–517（68 aa）
片段：UNP residues 450-517
|
未记录 | OGA N-OXALYLGLYCINE × 1 NI NICKEL (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.15 M CITRATE NA,
20% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.243 |