当前蛋白身份:G0F552 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6VU3 Cryo-EM structure of Escherichia coli transcription-translation complex A (TTC-A) containing mRNA with a 12 nt long spacer 提交 2020-02-14 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 58 PDB 声明:66-meric(66) 与全部聚合物一致
链 o 2–65(64 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6VZ2 Escherichia coli transcription-translation complex D1 (TTC-D1) containing mRNA with a 27 nt long spacer, NusG, and fMet-tRNAs at E-site and P-site 提交 2020-02-27 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:65-meric(65) 与全部聚合物一致
链 o 2–65(64 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 10.00 Å
6VZ3 Escherichia coli transcription-translation complex D2 (TTC-D2) containing mRNA with a 27 nt long spacer 提交 2020-02-27 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:65-meric(65) 与全部聚合物一致
链 o 2–65(64 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.90 Å
6WD0 Cryo-EM of elongating ribosome with EF-Tu*GTP elucidates tRNA proofreading (Cognate Structure I-A) 提交 2020-03-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 51 PDB 声明:57-meric(57) 与全部聚合物一致
链 E 2–65(64 aa)
未记录 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6WD2 Cryo-EM of elongating ribosome with EF-Tu*GTP elucidates tRNA proofreading (Cognate Structure II-A) 提交 2020-03-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:59-meric(59) 与全部聚合物一致
链 E 2–65(64 aa)
未记录 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6WD3 Cryo-EM of elongating ribosome with EF-Tu*GTP elucidates tRNA proofreading (Cognate Structure II-B1) 提交 2020-03-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:59-meric(59) 与全部聚合物一致
链 E 2–65(64 aa)
未记录 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6WD4 Cryo-EM of elongating ribosome with EF-Tu*GTP elucidates tRNA proofreading (Cognate Structure II-B2) 提交 2020-03-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:59-meric(59) 与全部聚合物一致
链 E 2–65(64 aa)
未记录 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6WD5 Cryo-EM of elongating ribosome with EF-Tu*GTP elucidates tRNA proofreading (Cognate Structure II-C1) 提交 2020-03-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:59-meric(59) 与全部聚合物一致
链 E 2–65(64 aa)
未记录 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6WD7 Cryo-EM of elongating ribosome with EF-Tu*GTP elucidates tRNA proofreading (Cognate Structure II-D) 提交 2020-03-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:59-meric(59) 与全部聚合物一致
链 E 2–65(64 aa)
未记录 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6WD9 Cryo-EM of elongating ribosome with EF-Tu*GTP elucidates tRNA proofreading (Cognate Structure III-B) 提交 2020-03-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:59-meric(59) 与全部聚合物一致
链 E 2–65(64 aa)
未记录 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6WDA Cryo-EM of elongating ribosome with EF-Tu*GTP elucidates tRNA proofreading (Cognate Structure III-C) 提交 2020-03-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:59-meric(59) 与全部聚合物一致
链 E 2–65(64 aa)
未记录 FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å