当前蛋白身份:G0SEI5
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5OQL Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome from Chaetomium thermophilum 提交 2017-08-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 53 PDB 声明:55-meric(55) 与全部聚合物一致 |
链 L
1–557(557 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6L3Q Crystal structure of Chaetomium thermophilum Utp15 C terminal domain 提交 2019-10-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
419–557(139 aa)
链 B
419–557(139 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 6.5;293.15 K;1.6M MgSO4, 0.1M Mes
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.241 |
| 6RXT Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state A 提交 2019-06-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 55 PDB 声明:57-meric(57) 与全部聚合物一致 |
链 UO
1–557(557 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 6RXU Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state B1 提交 2019-06-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 64 PDB 声明:66-meric(66) 与全部聚合物一致 |
链 UO
1–557(557 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6RXV Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state B2 提交 2019-06-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 66 PDB 声明:68-meric(68) 与全部聚合物一致 |
链 UO
1–557(557 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 6RXX Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state C, Poly-Ala 提交 2019-06-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 66 PDB 声明:68-meric(68) 与全部聚合物一致 |
链 UO
1–557(557 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 6RXY Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state a 提交 2019-06-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 57 PDB 声明:59-meric(59) 与全部聚合物一致 |
链 UO
1–557(557 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.70 Å |
| 6RXZ Cryo-EM structure of the 90S pre-ribosome (Kre33-Noc4) from Chaetomium thermophilum, state b 提交 2019-06-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 66 PDB 声明:68-meric(68) 与全部聚合物一致 |
链 UO
1–557(557 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |