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蛋白结构与聚集状态

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46PDB条目
46Biological assembly
46链与assembly记录
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

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PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric（85） 与全部聚合物一致
链 F 8–249（242 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric（85） 与全部聚合物一致
链 F 1–249（249 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric（85） 与全部聚合物一致
链 F 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric（58） 待复核
链 F 25–249（225 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric（60） 待复核
链 F 25–249（225 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric（58） 待复核
链 F 25–249（225 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric（82） 与全部聚合物一致
链 F 25–249（225 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric（84） 与全部聚合物一致
链 F 25–249（225 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric（83） 与全部聚合物一致
链 F 25–249（225 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric（81） 与全部聚合物一致
链 AF 1–249（249 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric（81） 与全部聚合物一致
链 AF 1–249（249 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric（81） 与全部聚合物一致
链 AF 1–249（249 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric（82） 与全部聚合物一致
链 AF 1–249（249 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric（85） 与全部聚合物一致
链 F 25–249（225 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric（92） 与全部聚合物一致
链 F 25–249（225 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric（85） 与全部聚合物一致
链 F 25–249（225 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric（88） 与全部聚合物一致
链 F 25–249（225 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric（85） 与全部聚合物一致
链 U2 25–249（225 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric（85） 与全部聚合物一致
链 U2 25–249（225 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致
链 F 25–249（225 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致
链 F3 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric（84） 与全部聚合物一致
链 F 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric（84） 与全部聚合物一致
链 F 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致
链 F 25–249（225 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric（83） 与全部聚合物一致
链 F 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric（52） 与全部聚合物一致
链 F 25–249（225 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物一致
链 F 25–249（225 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric（49） 与全部聚合物一致
链 F 25–249（225 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致
链 AL07 25–249（225 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric（79） 与全部聚合物一致
链 F 25–249（225 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric（79） 与全部聚合物一致
链 F 25–249（225 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物一致
链 F 25–249（225 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物一致
链 F 25–249（225 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致
链 o3 25–249（225 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric（92） 与全部聚合物一致
链 BF 8–249（242 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric（88） 与全部聚合物一致
链 F 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric（88） 与全部聚合物一致
链 F 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric（88） 与全部聚合物一致
链 F 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric（88） 与全部聚合物一致
链 F 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致
链 F 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric（83） 与全部聚合物一致
链 F 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric（82） 与全部聚合物一致
链 AL07 25–249（225 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric（85） 与全部聚合物一致
链 AL07 25–249（225 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致
链 AL07 25–249（225 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric（84） 与全部聚合物一致
链 F 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric（88） 与全部聚合物一致
链 B2 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å

页面展示的是PDB/mmCIF中的结构证据。“未记录非水小分子”不等于实验样品绝对无配体； 实验环境属于整个PDB实验记录，配体与拷贝数按具体biological assembly展示。