当前蛋白身份:G1TWL4 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6P4G Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-27 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 34 PDB 声明:36-meric(36) 与全部聚合物一致
链 B 1–295(295 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 34 PDB 声明:36-meric(36) 与全部聚合物一致
链 B 1–295(295 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 41 PDB 声明:43-meric(43) 与全部聚合物一致
链 B 1–295(295 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 42 PDB 声明:44-meric(44) 与全部聚合物一致
链 B 1–295(295 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å