当前蛋白身份:G1TYL6 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:83-meric(83) 与全部聚合物一致
链 R 1–196(196 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:84-meric(84) 与全部聚合物一致
链 AL19 2–181(180 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 79 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致
链 AL19 2–181(180 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 73 PDB 声明:79-meric(79) 与全部聚合物一致
链 R 2–181(180 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 73 PDB 声明:79-meric(79) 与全部聚合物一致
链 R 2–181(180 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 48 PDB 声明:51-meric(51) 与全部聚合物一致
链 R 1–196(196 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 80 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致
链 E1 2–181(180 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 82 PDB 声明:88-meric(88) 与全部聚合物一致
链 BR 1–196(196 aa)
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8RJD Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 2 提交 2023-12-20 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:56-meric(56) 与全部聚合物一致
链 R 1–196(196 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 75 PDB 声明:82-meric(82) 与全部聚合物一致
链 AL19 2–181(180 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 77 PDB 声明:85-meric(85) 与全部聚合物一致
链 AL19 2–181(180 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:86-meric(86) 与全部聚合物一致
链 AL19 2–181(180 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 78 PDB 声明:84-meric(84) 与全部聚合物一致
链 R 1–196(196 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 81 PDB 声明:88-meric(88) 与全部聚合物一致
链 N2 1–196(196 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å