当前蛋白身份：G1U001
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric（85） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
|
分辨率 3.75 Å |
| 6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致 |
链 k2
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 k3
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.11 Å |
| 6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric（85） 与全部聚合物一致 |
链 p2
2–70（69 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.49 Å |
| 7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric（85） 与全部聚合物一致 |
链 p2
2–70（69 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric（81） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
|
分辨率 3.20 Å |
| 7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致 |
链 Bk
1–70（70 aa）
|
未记录 | SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.20 Å |
| 7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致 |
链 Bk
1–70（70 aa）
|
未记录 | SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric（88） 与全部聚合物一致 |
链 Bk
1–70（70 aa）
|
未记录 | SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric（87） 与全部聚合物一致 |
链 Bk
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric（83） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
|
分辨率 3.25 Å |
| 7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
|
分辨率 3.88 Å |
| 8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.86 Å |
| 8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致 |
链 X1
2–70（69 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物一致 |
链 j2
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric（92） 与全部聚合物一致 |
链 Bk
1–70（70 aa）
|
未记录 | SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
|
分辨率 3.50 Å |
| 8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric（88） 与全部聚合物一致 |
链 Bk
1–70（70 aa）
|
未记录 | N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.69 Å |
| 8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8RJD Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 2 提交 2023-12-20 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.79 Å |
| 8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric（87） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric（85） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric（88） 与全部聚合物一致 |
链 JA
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric（88） 与全部聚合物一致 |
链 JA
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |
| 8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric（88） 与全部聚合物一致 |
链 JA
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric（88） 与全部聚合物一致 |
链 JA
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric（84） 与全部聚合物一致 |
链 JA
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致 |
链 JA
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric（82） 与全部聚合物一致 |
链 AL38
2–70（69 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric（85） 与全部聚合物一致 |
链 AL38
2–70（69 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致 |
链 AL38
2–70（69 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric（89） 与全部聚合物一致 |
链 Bk
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric（90） 与全部聚合物一致 |
链 Bk
1–70（70 aa）
|
未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.78 Å |
| 9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric（91） 与全部聚合物一致 |
链 Bk
1–70（70 aa）
|
未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.26 Å |
| 9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric（84） 与全部聚合物一致 |
链 k
1–70（70 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.65 Å |
| 9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric（86） 与全部聚合物一致 |
链 Bk
1–70（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric（89） 与全部聚合物一致 |
链 Bk
1–70（70 aa）
|
未记录 | SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 3.43 Å |
| 9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric（88） 与全部聚合物一致 |
链 g2
1–70（70 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.65 Å |