当前蛋白身份:G3XD49 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
8CR9 Cryo-EM structure of PcrV/Fab(30-B8) 提交 2023-03-08 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 2–294(293 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;1xPBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.20 Å
8CRB Cryo-EM structure of PcrV/Fab(11-E5) 提交 2023-03-08 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 2–294(293 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;1xPBS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9FM0 Human antibody (Fab) and P. aeruginosa (T3SS) protein PcrV-fragment complex 提交 2024-06-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 E 132–249(118 aa)
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;293 K;Micro-seeding, 0.1 M Sodium Acetate pH 5, 25% PEG 1000, 0.001M ZnCl2
分辨率 2.56 Å R-free 0.237
9FM0 Human antibody (Fab) and P. aeruginosa (T3SS) protein PcrV-fragment complex 提交 2024-06-05 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 132–249(118 aa)
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;293 K;Micro-seeding, 0.1 M Sodium Acetate pH 5, 25% PEG 1000, 0.001M ZnCl2
分辨率 2.56 Å R-free 0.237