当前蛋白身份：I2CMD3
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5VPK CRYSTAL STRUCTURE OF MITE ALLERGEN DER F 1 提交 2017-05-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
83–305（223 aa）
片段：SEQUENCE DATABASE RESIDUES 99-321
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 10.5；293 K；PROTEIN SOLUTION: 0.5M L-ARGININE,
0.12M LI SULFATE, 0.004M EDTA, 0.1M CAPS, PH 10.5, VAPOR
DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K, PH 10.50
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.210 |
| 5VPK CRYSTAL STRUCTURE OF MITE ALLERGEN DER F 1 提交 2017-05-05 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
83–305（223 aa）
片段：SEQUENCE DATABASE RESIDUES 99-321
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 10.5；293 K；PROTEIN SOLUTION: 0.5M L-ARGININE,
0.12M LI SULFATE, 0.004M EDTA, 0.1M CAPS, PH 10.5, VAPOR
DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K, PH 10.50
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.210 |
| 5VPK CRYSTAL STRUCTURE OF MITE ALLERGEN DER F 1 提交 2017-05-05 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
83–305（223 aa）
片段：SEQUENCE DATABASE RESIDUES 99-321
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 10.5；293 K；PROTEIN SOLUTION: 0.5M L-ARGININE,
0.12M LI SULFATE, 0.004M EDTA, 0.1M CAPS, PH 10.5, VAPOR
DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K, PH 10.50
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.210 |
| 5VPL CRYSTAL STRUCTURE OF DER F 1 COMPLEXED WITH FAB 4C1 提交 2017-05-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
83–305（223 aa）
片段：UNP RESIDUES 99-321
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；0.1M HEPES, 18% W/V PEG12K, PH 7.0,
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K
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分辨率 1.90 Å R-free 0.194 |