当前蛋白身份：I2XAW2
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6VU3 Cryo-EM structure of Escherichia coli transcription-translation complex A (TTC-A) containing mRNA with a 12 nt long spacer 提交 2020-02-14 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric（66） 与全部聚合物一致 |
链 y
2–115（114 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6VYU Escherichia coli transcription-translation complex C2 (TTC-C2) containing a 27 nt long mRNA spacer 提交 2020-02-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：65-meric（65） 与全部聚合物一致 |
链 y
1–115（115 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 6WD2 Cryo-EM of elongating ribosome with EF-Tu*GTP elucidates tRNA proofreading (Cognate Structure II-A) 提交 2020-03-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：59-meric（59） 与全部聚合物一致 |
链 p
2–115（114 aa）
|
未记录 | FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 6WD7 Cryo-EM of elongating ribosome with EF-Tu*GTP elucidates tRNA proofreading (Cognate Structure II-D) 提交 2020-03-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：59-meric（59） 与全部聚合物一致 |
链 p
2–115（114 aa）
|
未记录 | FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 6WD9 Cryo-EM of elongating ribosome with EF-Tu*GTP elucidates tRNA proofreading (Cognate Structure III-B) 提交 2020-03-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：59-meric（59） 与全部聚合物一致 |
链 p
2–115（114 aa）
|
未记录 | FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6WDA Cryo-EM of elongating ribosome with EF-Tu*GTP elucidates tRNA proofreading (Cognate Structure III-C) 提交 2020-03-31 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：59-meric（59） 与全部聚合物一致 |
链 p
2–115（114 aa）
|
未记录 | FME N-FORMYLMETHIONINE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7M5D Cryo-EM structure of a non-rotated E.coli 70S ribosome in complex with RF3-GTP, RF1 and P-tRNA (state I) 提交 2021-03-23 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：59-meric（59） 与全部聚合物一致 |
链 P
2–115（114 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7NSO Structure of ErmDL-Erythromycin-stalled 70S E. coli ribosomal complex with P-tRNA 提交 2021-03-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 P
2–115（114 aa）
|
未记录 | ERY ERYTHROMYCIN A × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7NSP Structure of ErmDL-Erythromycin-stalled 70S E. coli ribosomal complex with A and P-tRNA 提交 2021-03-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 P
2–115（114 aa）
|
未记录 | ERY ERYTHROMYCIN A × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7NSQ Structure of ErmDL-Telithromycin-stalled 70S E. coli ribosomal complex with A and P-tRNA 提交 2021-03-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：56-meric（56） 与全部聚合物一致 |
链 P
2–115（114 aa）
|
未记录 | TEL TELITHROMYCIN × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7NWW CspA-27 cotranslational folding intermediate 1 提交 2021-03-17 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 O
2–115（114 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 413 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM Tris-HCl, 70 mM NH4Cl, 30 mM KCl, 3.5 mM MgCl2, 8 mM putrescine, 0.5 mM spermidine, 1 mM DTT, 1 mM GTP, pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.05 Å |
| 7OIF CspA-27 cotranslational folding intermediate 2 提交 2021-05-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 O
2–115（114 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 416 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM Tris-HCl, 70 mM NH4Cl, 30 mM KCl, 3.5 mM MgCl2, 8 mM putrescine, 0.5 mM spermidine, 1 mM DTT, 1 mM GTP, pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7OIG CspA-27 cotranslational folding intermediate 3 提交 2021-05-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 O
2–115（114 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 400 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM Tris-HCl, 70 mM NH4Cl, 30 mM KCl, 3.5 mM MgCl2, 8 mM putrescine, 0.5 mM spermidine, 1 mM DTT, 1 mM GTP, pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 7OII CspA-70 cotranslational folding intermediate 2 提交 2021-05-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 O
2–115（114 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 422 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM Tris-HCl, 70 mM NH4Cl, 30 mM KCl, 3.5 mM MgCl2, 8 mM putrescine, 0.5 mM spermidine, 1 mM DTT, 1 mM GTP, pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7OT5 CspA-70 cotranslational folding intermediate 1 提交 2021-06-09 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 O
2–115（114 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 394 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；50 mM Tris-HCl, 70 mM NH4Cl, 30 mM KCl, 3.5 mM MgCl2, 8 mM putrescine, 0.5 mM spermidine, 1 mM DTT, 1 mM GTP, pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |