当前蛋白身份:I3ZN84 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5VVP HLA-B*57:03 presenting LSSPVTKSW 提交 2017-05-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 25–300(276 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.4;298 K;12 -20 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate and 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.4
分辨率 2.00 Å R-free 0.202
5VWD HLA-B*57:03 presenting LTVQVARVW 提交 2017-05-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 25–300(276 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.4;298 K;12 -20 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate and 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.4
分辨率 1.80 Å R-free 0.208
5VWF HLA-B*58:03 presenting LTVQVARVY 提交 2017-05-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 25–300(276 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.4;298 K;12 -20 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate and 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.4
分辨率 1.80 Å R-free 0.196
6V2P HLA-B*57:03 presenting the peptide ASLNLPAVSW 提交 2019-11-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 25–300(276 aa)
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.4;294 K;20 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.4
分辨率 1.30 Å R-free 0.163
6V2Q HLA-B*57:03 presenting the peptide LSSPVTKSF 提交 2019-11-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 25–300(276 aa)
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.4;294 K;20 % PEG 4000, 0.2 M ammonium acetate, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.4
分辨率 1.60 Å R-free 0.194
6V3J KIR3DL1 in complex with HLA-B*57:03 presenting the peptide LSSPVTKSF 提交 2019-11-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 25–299(275 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;294 K;14% PEG 3350, 2% tacsimate, pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 1.98 Å R-free 0.236
9BL2 KIR3DL1*001 in complex with HLA-B*57:03 presenting the AW10 peptide 提交 2024-04-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 25–300(276 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;294 K;18% PEG-3350, 2% tacsimate pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 2.10 Å R-free 0.231
9BL3 KIR3DL1*114 in complex with HLA-B*57:03 presenting the AW10 peptide 提交 2024-04-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 25–300(276 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;294 K;16% PEG 3350, 2% tacsimate pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 2.00 Å R-free 0.229
9BL4 KIR3DL1*086 in complex with HLA-B*57:03 presenting the AW10 peptide 提交 2024-04-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 25–300(276 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;294 K;16% PEG 3350, 2% tacsimate pH 5.0, 0.1 M tri-sodium citrate pH 5.6
分辨率 1.75 Å R-free 0.227