当前蛋白身份：K4DIE3
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3U0K Crystal Structure of the genetically encoded calcium indicator RCaMP 提交 2011-09-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
204–432（229 aa）
链 B
1–203（203 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ACT ACETATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M ammonium acetate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.239 |
| 4IK1 High resolution structure of GCaMPJ at pH 8.5 提交 2012-12-25 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–48（48 aa）
链 A
284–432（149 aa）
|
突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T, D362Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T, D362Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；Tris pH 8.5, (NH4)2SO4, 25% PEG 3350, 0.5% DDAO, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.205 |
| 4IK3 High resolution structure of GCaMP3 at pH 8.5 提交 2012-12-25 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–48（48 aa）
链 A
284–432（149 aa）
|
突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；Tris pH 8.5, (NH4)2SO4, 23% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.214 |
| 4IK4 High resolution structure of GCaMP3 at pH 5.0 提交 2012-12-25 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–48（48 aa）
链 A
284–432（149 aa）
|
突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；289 K；Bis-Tris pH 5.0, (NH4)2SO4 and 25% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.212 |
| 4IK5 High resolution structure of Delta-REST-GCaMP3 提交 2012-12-25 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
25–48（24 aa）
链 A
284–432（149 aa）
|
突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；289 K；Tris pH 8.5, NH4OAc, 23% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.228 |
| 4IK8 High resolution structure of GCaMP3 dimer form 1 at pH 7.5 提交 2012-12-25 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–48（48 aa）
链 A
284–432（149 aa）
|
突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；HEPES pH 7.5, (NH4)2SO4, 25% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.209 |
| 4IK9 High resolution structure of GCaMP3 dimer form 2 at pH 7.5 提交 2012-12-25 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–48（48 aa）
链 A
284–432（149 aa）
|
突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：M153K, V163A, S175G, D180Y, T203V, A206K, H231L, F64L, V93I, I354T 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 8 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；289 K；HEPES pH 7.5, (NH4)2SO4, 21% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.195 |
| 6ZSM Crystal structure of rsGCaMP double mutant Ile80His/Val116Ile in the ON state (non-illuminated) 提交 2020-07-16 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
284–432（149 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 5 FMT FORMIC ACID × 14 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；292 K；0.20 M sodium formate, 0.1 M Bis-Tris-Propane buffer pH 8.5, 19% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.198 |
| 6ZSN Crystal structure of rsGCaMP double mutant Ile80His/Val116Ile in the OFF state (illuminated) 提交 2020-07-16 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
284–432（149 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | FMT FORMIC ACID × 6 CA CALCIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；0.20 M sodium formate, 0.1 M Bis-Tris-Propane buffer pH 8.5, 19% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.259 |