当前蛋白身份：O00329
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5DXU p110delta/p85alpha with GDC-0326 提交 2015-09-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–1044（1043 aa）
|
未记录 | 5H5 (2S)-2-({2-[1-(propan-2-yl)-1H-1,2,4-triazol-5-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}oxy)propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG
|
分辨率 2.64 Å R-free 0.284 |
| 5M6U HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH LASW1579 提交 2016-10-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
17–1027（1011 aa）
片段：N-terminal truncated
|
未记录 | 7KA 4-azanyl-6-[[(1~{S})-1-(4-oxidanylidene-3-phenyl-pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-2-yl)ethyl]amino]pyrimidine-5-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；NULL
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.309 |
| 5T8F p110delta/p85alpha with taselisib (GDC-0032) 提交 2016-09-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
17–1031（1015 aa）
|
未记录 | 799 2-methyl-2-(4-{2-[3-methyl-1-(propan-2-yl)-1H-1,2,4-triazol-5-yl]-5,6-dihydroimidazo[1,2-d][1,4]benzoxazepin-9-yl}-1H-pyrazol-1-yl)propanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG
|
分辨率 2.91 Å R-free 0.304 |
| 5UBT CRYSTAL STRUCTURE OF PI3K DELTA IN COMPLEX WITH A 7-(3-(PIPERAZIN-1-YL)PHENYL)PYRROLO[2,1-F][1,2,4] TRIAZIN-4-AMINE DERIVIATINE 提交 2016-12-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
17–1029（1013 aa）
|
未记录 | 85S 1-[4-(3-{4-amino-5-[1-(oxan-4-yl)-1H-pyrazol-5-yl]pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl}phenyl)piperazin-1-yl]ethan-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；NULL
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.268 |
| 5VLR CRYSTAL STRUCTURE OF PI3K DELTA IN COMPLEX WITH A TRIFLUORO-ETHYL-PYRAZOL-PYROLOTRIAZINE INHIBITOR 提交 2017-04-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
17–1029（1013 aa）
|
未记录 | 9EM 4-acetyl-1-(3-{4-amino-5-[1-(2,2,2-trifluoroethyl)-1H-pyrazol-5-yl]pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl}phenyl)-3,3-dimethylpiperazin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；300 K；NULL, VAPOR DIFFUSION, TEMPERATURE
293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.279 |
| 5VLR CRYSTAL STRUCTURE OF PI3K DELTA IN COMPLEX WITH A TRIFLUORO-ETHYL-PYRAZOL-PYROLOTRIAZINE INHIBITOR 提交 2017-04-26 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
17–1029（1013 aa）
|
未记录 | 9EM 4-acetyl-1-(3-{4-amino-5-[1-(2,2,2-trifluoroethyl)-1H-pyrazol-5-yl]pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-7-yl}phenyl)-3,3-dimethylpiperazin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；300 K；NULL, VAPOR DIFFUSION, TEMPERATURE
293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.279 |
| 6G6W HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH LIGAND LASW1976 提交 2018-04-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1044（1044 aa）
片段：N-terminal truncated
|
未记录 | EO5 ~{N}-[3-[4-[[(1~{S})-1-(5-methyl-4-oxidanylidene-3-phenyl-pyrrolo[2,1-f][1,2,4]triazin-2-yl)ethyl]amino]-7~{H}-pyrrolo[ 2,3-d]pyrimidin-5-yl]-5-oxidanyl-phenyl]methanesulfonamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG
|
分辨率 2.72 Å R-free 0.260 |
| 6OCO HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH COMPOUND 6 提交 2019-03-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
17–1031（1015 aa）
片段：PI3-KINASE P110 DELTA AND P85 FRAGMENT
|
未记录 | M5V 4-[(1S,4S)-5-(3-chlorophenyl)-2,5-diazabicyclo[2.2.1]heptan-2-yl]-2-(pyridin-3-yl)pyrimidine-5-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；16.60 % PEG6000
0.10 M KCl
0.10 M MES pH=6.00
|
分辨率 2.58 Å R-free 0.296 |
| 6OCU HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH COMPOUND 29 提交 2019-03-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1044（1044 aa）
片段：PI3-KINASE P110 DELTA AND P85 FRAGMENT
|
未记录 | M5D 5-{(3R)-3-methyl-4-[(1R,2R)-2-methylcyclopropane-1-carbonyl]piperazin-1-yl}-3-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)pyrazine-2-carbonitrile × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；16% PEG6000
0.10 M KCl
0.10 M MES pH 6.0
|
分辨率 2.77 Å R-free 0.287 |
| 6PYR Human PI3Kdelta in complex with Compound 2-10 ((3S)-3-benzyl-3-methyl-5-[5-(2-methylpyrimidin-5-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]-1,3-dihydro-2H-indol-2-one) 提交 2019-07-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
17–1034（1018 aa）
片段：UNP residues 17-1034
|
未记录 | P5J (3S)-3-benzyl-3-methyl-5-[5-(2-methylpyrimidin-5-yl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；12-14% PEG6000, 100 mM MES/NaOH, pH 5.75, 5 mM DTT
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.259 |
| 6PYU Human PI3Kdelta in complex with Compound 4-2 ((3S)-1'-(cyclopropanecarbonyl)-5-(quinoxalin-6-yl)spiro[indole-3,2'-pyrrolidin]-2(1H)-one) 提交 2019-07-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
17–1034（1018 aa）
片段：UNP residues 17-1034
|
未记录 | P5V (3S)-1'-(cyclopropanecarbonyl)-5-(quinoxalin-6-yl)spiro[indole-3,2'-pyrrolidin]-2(1H)-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；not available
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.292 |
| 7JIS HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH COMPOUND 2F 提交 2020-07-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
17–1034（1018 aa）
片段：PI3-KINASE P110 DELTA AND P85 FRAGMENT, residues 17-1034
|
未记录 | VBS (3S)-3-benzyl-5-[9-ethyl-8-(2-methylpyrimidin-5-yl)-9H-purin-6-yl]-3-methyl-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；16% PEG6000, 0.10 M KCL, 0.10 M MES pH 6.0
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.267 |
| 7LM2 HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH COMPOUND 3C 提交 2021-02-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
12–1031（1020 aa）
片段：PI3-KINASE P110 DELTA AND P85 FRAGMENT
|
未记录 | Y5Y cyclopropyl[(3S)-3-{[9-ethyl-8-(2-methylpyrimidin-5-yl)-9H-purin-6-yl]amino}pyrrolidin-1-yl]methanone × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；12-14% PEG6000, 100 MM MES/NAOH, PH 5.75, 5 MM DTT
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.289 |
| 7LQ1 HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH COMPOUND 28 提交 2021-02-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1044（1044 aa）
片段：PI3-KINASE P110 DELTA AND P85 FRAGMENT
|
未记录 | YA7 N-(5-(6-(2-((2S,6R)-2,6-dimethylmorpholino)pyridin-4-yl)-1-oxoisoindolin-4-yl)-2-methoxypyridin-3-yl)methanesulfonamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；16% PEG6000, 0.10 M KCL, 0.10 M MES PH 6.0
|
分辨率 2.96 Å R-free 0.281 |
| 8BCY HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH COMPOUND 13 提交 2022-10-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
17–1034（1018 aa）
片段：PI3-KINASE P110 DELTA AND P85 FRAGMENT
|
未记录 | I3H 9-[2-(3,4-dichlorophenyl)ethyl]-2-(3-hydroxyphenyl)-8-oxidanylidene-7~{H}-purine-6-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；16% PEG6000, 0.10 M KCL, 0.10 M MES
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.263 |
| 8S3R HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH PYRIDAZINONE INHIBITOR 7 提交 2024-02-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
17–1034（1018 aa）
片段：PI3-KINASE P110 DELTA AND P85 FRAGMENT
|
未记录 | A1H48 5-[(1~{S})-1-[4-azanyl-3-(5-oxidanylpyridin-3-yl)pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]ethyl]-4-cyclopentyl-2-(phenylmethyl)pyridazin-3-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；16% PEG6000, 0.10 M KCL, 0.10 M MES
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.270 |
| 9GCF HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH ISOCUMARIN INHIBITOR CHF-6523 提交 2024-08-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1044（1044 aa）
|
未记录 | A1IJ5 3-[(1S)-1-[4-azanyl-3-(5-oxidanylpyridin-3-yl)pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]ethyl]-4-[3-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]phenyl]isochromen-1-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；16% PEG6000, 0.10 M KCL, 0.10 M MES
|
分辨率 2.89 Å R-free 0.296 |
| 9GDI HUMAN PI3KDELTA IN COMPLEX WITH ISOCUMARIN INHIBITOR 10 提交 2024-08-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1044（1044 aa）
|
未记录 | A1IJ1 3-[(1S)-1-[4-azanyl-3-(3-fluoranyl-5-oxidanyl-phenyl)pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]ethyl]-4-(1-methyl-3,6-dihydro-2H-pyridin-4-yl)isochromen-1-one × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；16% PEG6000, 0.10 M KCL, 0.10 M MES
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.299 |
| 9L3R Human PI3KDELTA in complex with Zandelisib 提交 2024-12-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1044（1044 aa）
|
未记录 | A1L62 Zandelisib × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；283.15 K；10% PEG 4000, 100 mM KCl, 1 mM TCEP neutral pH, 10 mM CaCl2, 100 mM MES pH 5.8
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.278 |