当前蛋白身份：O14933
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1WZV Crystal Structure of UbcH8 提交 2005-03-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–152（152 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；298 K；PEG 3350, calcium acetate, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.267 |
| 1WZV Crystal Structure of UbcH8 提交 2005-03-10 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–152（152 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；298 K；PEG 3350, calcium acetate, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.267 |
| 1WZW Crystal Structure of UbcH8 提交 2005-03-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–152（152 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；298 K；PEG 3350, calcium acetate, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.274 |
| 2KJH NMR based structural model of the UBCH8-UBIQUITIN complex 提交 2009-05-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–152（152 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）250；压力 ambient
NMR样品组成
0.35 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] UbcH8-1, 0.35 mM Ubiquitin-2, 20 mM sodium phosphate-3, 1 mM EDTA-4, 250 mM sodium chloride-5, 50 mM Arginine-6, 50 mM Glutamic Acid-7, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.35 mM UbcH8-8, 0.35 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ubiquitin-9, 20 mM sodium phosphate-10, 1 mM EDTA-11, 250 mM sodium chloride-12, 50 mM Arginine-13, 50 mM Glutamic Acid-14, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.35 mM [U-100% 15N; U-99% 2H] UbcH8-15, 0.35 mM Ubiquitin-16, 20 mM sodium phosphate-17, 1 mM EDTA-18, 250 mM sodium chloride-19, 50 mM Arginine-20, 50 mM Glutamic Acid-21, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.35 mM UbcH8-22, 0.35 mM [U-100% 15N; U-99% 2H] Ubiquitin-23, 20 mM sodium phosphate-24, 1 mM EDTA-25, 250 mM sodium chloride-26, 50 mM Arginine-27, 50 mM Glutamic Acid-28, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 8OIF Structure of the UBE1L activating enzyme bound to ISG15 and UBE2L6 提交 2023-03-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 L
1–153（153 aa）
|
未记录 | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8SE9 Cryo-EM structure of a double loaded human UBA7-UBE2L6-ISG15 thioester mimetic complex (Form 2) 提交 2023-04-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
2–153（152 aa）
|
突变：C98S,C102S,L121K | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8SEA Cryo-EM structure of a double loaded human UBA7-UBE2L6-ISG15 thioester mimetic complex (Form 1) 提交 2023-04-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
2–153（152 aa）
|
突变：C98S,C102S,L121K | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8SEB Cryo-EM structure of a single loaded human UBA7-UBE2L6-ISG15 adenylate complex 提交 2023-04-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
2–153（152 aa）
|
突变：C98S,C102S,L121K | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.24 Å |
| 8SV8 Cryo-EM structure of a double loaded human UBA7-UBE2L6-ISG15 thioester mimetic complex from a composite map 提交 2023-05-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
2–153（152 aa）
|
突变：C98S/C102S/L121K | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.38 Å |