当前蛋白身份:O35464 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3AFC Mouse Semaphorin 6A extracellular domain 提交 2010-02-26 Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 19–570(552 aa) 片段:sema and PSI domain (UNP residues 19-570)
链 B 19–570(552 aa) 片段:sema and PSI domain (UNP residues 19-570)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;22-24% (wt/vol) PEG 1500, 0.1M Tris-Cl pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.278
3AL8 Plexin A2 / Semaphorin 6A complex 提交 2010-07-28 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 19–570(552 aa) 片段:sema and PSI domain (UNP RESIDUES 19-570)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;18-25% (wt./vol.) PEG 1000, 0.2-0.3M MgCl2, 0.1M Na-cacodylate pH 5.5-6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.60 Å R-free 0.287
3AL8 Plexin A2 / Semaphorin 6A complex 提交 2010-07-28 Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 19–570(552 aa) 片段:sema and PSI domain (UNP RESIDUES 19-570)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;18-25% (wt./vol.) PEG 1000, 0.2-0.3M MgCl2, 0.1M Na-cacodylate pH 5.5-6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.60 Å R-free 0.287
3OKW Mouse Semaphorin 6A, extracellular domains 1-2 提交 2010-08-25 Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 19–571(553 aa)
链 B 19–571(553 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CIT CITRIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.4;293 K;Polyethylene Glycol 3350 20% w/v, di-ammonium Hydrogen Citrate 200mM, 6% D-galactose, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.219