当前蛋白身份:O35464
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3AFC Mouse Semaphorin 6A extracellular domain 提交 2010-02-26 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
19–570(552 aa)
片段:sema and PSI domain (UNP residues 19-570)
链 B
19–570(552 aa)
片段:sema and PSI domain (UNP residues 19-570)
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;22-24% (wt/vol) PEG 1500, 0.1M Tris-Cl pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.278 |
| 3AL8 Plexin A2 / Semaphorin 6A complex 提交 2010-07-28 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
19–570(552 aa)
片段:sema and PSI domain (UNP RESIDUES 19-570)
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;18-25% (wt./vol.) PEG 1000, 0.2-0.3M MgCl2, 0.1M Na-cacodylate pH 5.5-6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 3.60 Å R-free 0.287 |
| 3AL8 Plexin A2 / Semaphorin 6A complex 提交 2010-07-28 | Assembly 2 其他组合 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
19–570(552 aa)
片段:sema and PSI domain (UNP RESIDUES 19-570)
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;18-25% (wt./vol.) PEG 1000, 0.2-0.3M MgCl2, 0.1M Na-cacodylate pH 5.5-6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 3.60 Å R-free 0.287 |
| 3OKW Mouse Semaphorin 6A, extracellular domains 1-2 提交 2010-08-25 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
19–571(553 aa)
链 B
19–571(553 aa)
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CIT CITRIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.4;293 K;Polyethylene Glycol 3350 20% w/v, di-ammonium Hydrogen Citrate 200mM, 6% D-galactose, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.30 Å R-free 0.219 |