当前蛋白身份：O60502
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2YDQ CpOGA D298N in complex with hOGA-derived O-GlcNAc peptide 提交 2011-03-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 T
402–408（7 aa）
片段：HOGA O-GLCNAC PEPTIDE, RESIDUES 402-408
|
未记录 | CD CADMIUM ION × 19 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.6M NAAC, 0.175M CDSO4, 0.1M HEPES PH 7.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.231 |
| 5M7R Structure of human O-GlcNAc hydrolase 提交 2016-10-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–916（916 aa）
链 B
1–916（916 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；292 K；0.14 - 0.2 M triammonium citrate pH 7.5, 16-20 % PEG 3350
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.249 |
| 5M7S Structure of human O-GlcNAc hydrolase with bound transition state analog ThiametG 提交 2016-10-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–916（916 aa）
链 B
1–916（916 aa）
|
未记录 | NHT (3AR,5R,6S,7R,7AR)-2-(ETHYLAMINO)-5-(HYDROXYMETHYL)-5,6,7,7A-TETRAHYDRO-3AH-PYRANO[3,2-D][1,3]THIAZOLE-6,7-DIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；292 K；0.1-0.2 M tri ammonium citrate pH 7.5
16-20 % PEG 3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.232 |
| 5M7T Structure of human O-GlcNAc hydrolase with PugNAc type inhibitor 提交 2016-10-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–916（916 aa）
链 B
1–916（916 aa）
|
未记录 | GDV (5R,6R,7R,8S)-8-(ACETYLAMINO)-6,7-DIHYDROXY-5-(HYDROXYMETHYL)-N-PHENYL-1,5,6,7,8,8A-HEXAHYDROIMIDAZO[1,2-A]PYRIDINE-2-CARBOXAMIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；292 K；0.1-0.2 M tri Ammonium citrate 16-20 % PEG 3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.235 |
| 5M7U Structure of human O-GlcNAc hydrolase with new iminocyclitol type inhibitor 提交 2016-10-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–916（916 aa）
链 B
1–916（916 aa）
|
未记录 | XHA 2-[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(hydroxymethyl)-3,4-bis(oxidanyl)-1-[3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]propyl]pyrrolidin-2-yl]-~{N}-methyl-ethanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；292 K；0.1-0.2 M tri Ammonium citrate pH 7.5 16-20 % PEG 3350
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.227 |
| 5TKE Crystal Structure of Eukaryotic Hydrolase 提交 2016-10-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
60–400（341 aa）
片段：unp residues 60-542; unp residues 553-704
链 A
553–704（152 aa）
片段：unp residues 60-542; unp residues 553-704
链 B
60–400（341 aa）
片段：unp residues 60-542; unp residues 553-704
链 B
553–704（152 aa）
片段：unp residues 60-542; unp residues 553-704
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 7；293 K；0.032 M ammonium citrate tribasic (pH 7.0), 0.02 M MES monohydrate, 0.016 M imidazole, 0.002 M zinc sulfate heptahydrate, 0.128 M potassium thiocyanate, 12.8% w/v polyethylene glycol 3,350, 3.2% w/v polyethylene glycol monomethyl ether 2,000, and 5% w/v polyethylene glycol monomethyl ether 550
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.236 |
| 5UHK Crystal structure of the core catalytic domain of Human O-GlcNAcase 提交 2017-01-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
56–400（345 aa）
链 B
544–705（162 aa）
链 C
56–400（345 aa）
链 D
544–705（162 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；14-17% PEG 3350, 0.2 M Mg Formate
|
分辨率 2.97 Å R-free 0.251 |
| 5UHL Crystal structure of the core catalytic domain of human O-GlcNAcase complexed with Thiamet G 提交 2017-01-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
56–400（345 aa）
链 B
544–705（162 aa）
链 C
56–400（345 aa）
链 D
544–705（162 aa）
|
未记录 | 8BJ (2Z,3aR,5R,6S,7R,7aR)-2-(ethylimino)-5-(hydroxymethyl)hexahydro-3aH-pyrano[3,2-d][1,3]thiazole-6,7-diol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；14-17% PEG 3350, 0.2 M Mg Formate
|
分辨率 3.14 Å R-free 0.257 |
| 5UHO Crystal structure of the core catalytic domain of human O-GlcNAcase complexed with PUGNAc 提交 2017-01-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
56–400（345 aa）
链 B
544–705（162 aa）
链 C
56–400（345 aa）
链 D
544–705（162 aa）
|
未记录 | OAN O-(2-ACETAMIDO-2-DEOXY D-GLUCOPYRANOSYLIDENE) AMINO-N-PHENYLCARBAMATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；14-17% PEG 3350, 0.2 M Mg Formate
|
分辨率 3.21 Å R-free 0.259 |
| 5UHP Crystal structure of the core catalytic domain of human O-GlcNAcase 提交 2017-01-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
14–400（387 aa）
链 B
14–400（387 aa）
链 F
554–705（152 aa）
链 G
554–705（152 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M K Na tartrate tetrahydrate, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.292 |
| 5UHP Crystal structure of the core catalytic domain of human O-GlcNAcase 提交 2017-01-11 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
14–400（387 aa）
链 D
14–400（387 aa）
链 E
554–705（152 aa）
链 H
554–705（152 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M K Na tartrate tetrahydrate, 20% PEG 3350
|
分辨率 2.79 Å R-free 0.292 |
| 5UN8 Crystal Structure of human O-GlcNAcase in complex with glycopeptide p53 提交 2017-01-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
60–400（341 aa）
片段：UNP residues 60-400 and 553-704
链 A
553–704（152 aa）
片段：UNP residues 60-400 and 553-704
链 C
60–400（341 aa）
片段：UNP residues 60-400 and 553-704
链 C
553–704（152 aa）
片段：UNP residues 60-400 and 553-704
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；0.032 M ammonium citrate tribasic (pH 7.0), 0.02 M MES monohydrate, 0.016 M imidazole, 0.002 M zinc sulfate heptahydrate, 0.128 M potassium thiocyanate, 12.8% w/v polyethylene glycol 3,350, 3.2% w/v polyethylene glycol monomethyl ether 2,000, and 5% w/v polyethylene glycol monomethyl ether 550.
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.229 |
| 5UN8 Crystal Structure of human O-GlcNAcase in complex with glycopeptide p53 提交 2017-01-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
60–400（341 aa）
片段：UNP residues 60-400 and 553-704
链 B
553–704（152 aa）
片段：UNP residues 60-400 and 553-704
链 D
60–400（341 aa）
片段：UNP residues 60-400 and 553-704
链 D
553–704（152 aa）
片段：UNP residues 60-400 and 553-704
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；0.032 M ammonium citrate tribasic (pH 7.0), 0.02 M MES monohydrate, 0.016 M imidazole, 0.002 M zinc sulfate heptahydrate, 0.128 M potassium thiocyanate, 12.8% w/v polyethylene glycol 3,350, 3.2% w/v polyethylene glycol monomethyl ether 2,000, and 5% w/v polyethylene glycol monomethyl ether 550.
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.229 |
| 5UN9 The crystal structure of human O-GlcNAcase in complex with Thiamet-G 提交 2017-01-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
60–400（341 aa）
片段：UNP residues 60-400 and 553-704
链 A
553–704（152 aa）
片段：UNP residues 60-400 and 553-704
链 B
60–400（341 aa）
片段：UNP residues 60-400 and 553-704
链 B
553–704（152 aa）
片段：UNP residues 60-400 and 553-704
|
未记录 | NHT (3AR,5R,6S,7R,7AR)-2-(ETHYLAMINO)-5-(HYDROXYMETHYL)-5,6,7,7A-TETRAHYDRO-3AH-PYRANO[3,2-D][1,3]THIAZOLE-6,7-DIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；0.128 M potassium thiocyanate, 0.032 M ammonium citrate tribasic (pH 7.0), 0.016 M imidazole (pH 7.0), 0.002 M zinc sulfate heptahydrate, 0.02 M MES monohydrate (pH 6.5), 12.8% w/v polyethylene glycol 3,350, 3.2% w/v polyethylene glycol monomethyl ether 2,000, 5% v/v polyethylene glycol monomethyl ether 550
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.260 |
| 5VVO Structural Investigations of the Substrate Specificity of Human O-GlcNAcase 提交 2017-05-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
60–400（341 aa）
片段：UNP residues 60-400, 553-704
链 A
553–704（152 aa）
片段：UNP residues 60-400, 553-704
链 B
60–400（341 aa）
片段：UNP residues 60-400, 553-704
链 B
553–704（152 aa）
片段：UNP residues 60-400, 553-704
|
突变：D175N 突变：D175N 突变：D175N 突变：D175N | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；0.024 M ammonium citrate tribasic (pH 7.0), 0.015 M MES monohydrate, 0.096 M potassium thiocyanate, 0.25 M Sodium acetate trihydrate, 0.037 M imidazole, 0.002 M zinc sulfate heptahydrate, 9.6 % w/v polyethylene glycol 3,350, 2.4 % w/v polyethylene glycol monomethyl ether 2,000, and 4% w/v polyethylene glycol monomethyl ether 550
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.259 |
| 5VVT Structural Investigations of the Substrate Specificity of Human O-GlcNAcase 提交 2017-05-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
60–400（341 aa）
链 A
553–704（152 aa）
链 C
60–400（341 aa）
链 C
553–704（152 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；0.024 M ammonium citrate tribasic (pH 7.0), 0.015 M MES monohydrate, 0.096 M potassium thiocyanate, 0.25 M Sodium acetate trihydrate, 0.037 M imidazole, 0.002 M zinc sulfate heptahydrate, 9.6 % w/v polyethylene glycol 3,350, 2.4 % w/v polyethylene glycol monomethyl ether 2,000, and 4% w/v polyethylene glycol monomethyl ether 550
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.291 |
| 5VVU Structural Investigations of the Substrate Specificity of Human O-GlcNAcase 提交 2017-05-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
60–400（341 aa）
片段：UNP residues 60-400, 553-704
链 A
553–704（152 aa）
片段：UNP residues 60-400, 553-704
链 C
60–400（341 aa）
片段：UNP residues 60-400, 553-704
链 C
553–704（152 aa）
片段：UNP residues 60-400, 553-704
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；0.024 M ammonium citrate tribasic (pH 7.0), 0.015 M MES monohydrate, 0.096 M potassium thiocyanate, 0.25 M Sodium acetate trihydrate, 0.037 M imidazole, 0.002 M zinc sulfate heptahydrate, 9.6 % w/v polyethylene glycol 3,350, 2.4 % w/v polyethylene glycol monomethyl ether 2,000, and 4% w/v polyethylene glycol monomethyl ether 550
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.275 |
| 5VVV Structural Investigations of the Substrate Specificity of Human O-GlcNAcase 提交 2017-05-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
60–400（341 aa）
片段：UNP residues 60-400, 553-704
链 A
553–704（152 aa）
片段：UNP residues 60-400, 553-704
链 C
60–400（341 aa）
片段：UNP residues 60-400, 553-704
链 C
553–704（152 aa）
片段：UNP residues 60-400, 553-704
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；0.024 M ammonium citrate tribasic (pH 7.0), 0.015 M MES monohydrate, 0.096 M potassium thiocyanate, 0.25 M Sodium acetate trihydrate, 0.037 M imidazole, 0.002 M zinc sulfate heptahydrate, 9.6 % w/v polyethylene glycol 3,350, 2.4 % w/v polyethylene glycol monomethyl ether 2,000, and 4% w/v polyethylene glycol monomethyl ether 550
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.257 |
| 5VVX Structural Investigations of the Substrate Specificity of Human O-GlcNAcase 提交 2017-05-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
60–400（341 aa）
片段：UNP residues 60-400, 553-704
链 A
553–704（152 aa）
片段：UNP residues 60-400, 553-704
链 C
60–400（341 aa）
片段：UNP residues 60-400, 553-704
链 C
553–704（152 aa）
片段：UNP residues 60-400, 553-704
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；0.024 M ammonium citrate tribasic (pH 7.0), 0.015 M MES monohydrate, 0.096 M potassium thiocyanate, 0.25 M Sodium acetate trihydrate, 0.037 M imidazole, 0.002 M zinc sulfate heptahydrate, 9.6 % w/v polyethylene glycol 3,350, 2.4 % w/v polyethylene glycol monomethyl ether 2,000, and 4% w/v polyethylene glycol monomethyl ether 550
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.282 |
| 6HKI Crystal structure of surface entropy mutant of human O-GlcNAc hydrolase 提交 2018-09-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–916（916 aa）
链 B
1–916（916 aa）
|
突变：E602A, E605A 突变：E602A, E605A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.2 M sodium citrate tribasic, 17% polyethylene glycol 3350
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.234 |
| 6PM9 Crystal structure of the core catalytic domain of human O-GlcNAcase bound to MK-8719 提交 2019-07-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
14–400（387 aa）
链 B
14–400（387 aa）
链 F
554–705（152 aa）
链 G
554–705（152 aa）
|
未记录 | OQ1 (3aR,5S,6S,7R,7aR)-5-(difluoromethyl)-2-(ethylamino)-5,6,7,7a-tetrahydro-3aH-pyrano[3,2-d][1,3]thiazole-6,7-diol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M K-Na-tartrate tetrahydrate, 20% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.86 Å R-free 0.309 |
| 6PM9 Crystal structure of the core catalytic domain of human O-GlcNAcase bound to MK-8719 提交 2019-07-01 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
14–400（387 aa）
链 D
14–400（387 aa）
链 E
554–705（152 aa）
链 H
554–705（152 aa）
|
未记录 | OQ1 (3aR,5S,6S,7R,7aR)-5-(difluoromethyl)-2-(ethylamino)-5,6,7,7a-tetrahydro-3aH-pyrano[3,2-d][1,3]thiazole-6,7-diol × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M K-Na-tartrate tetrahydrate, 20% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.86 Å R-free 0.309 |
| 7OU6 Human O-GlcNAc hydrolase in complex with DNJNAc-thiazolidines 提交 2021-06-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 AAA
1–916（916 aa）
链 BBB
1–916（916 aa）
|
未记录 | 1XI ~{N}-[(3~{Z},6~{S},7~{R},8~{R},8~{a}~{S})-7,8-bis(oxidanyl)-3-(phenylmethyl)imino-1,5,6,7,8,8~{a}-hexahydro-[1,3]thiazolo[3,4-a]pyridin-6-yl]ethanamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291.15 K；0.14 - 0.2 M triammonium citrate pH 7.5, 16-20 % PEG 3350
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.271 |
| 7YEH Cryo-EM structure of human OGT-OGA complex 提交 2022-07-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–916（916 aa）
链 D
1–916（916 aa）
|
未记录 | UDP URIDINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.92 Å |
| 8P0L Crystal structure of human O-GlcNAcase in complex with an S-linked CKII peptide 提交 2023-05-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–916（916 aa）
链 B
1–916（916 aa）
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未记录 | CYS CYSTEINE × 1 SER SERINE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.14 - 0.2 M triammonium citrate pH 7.5, 16-20 % PEG 3350
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分辨率 2.50 Å R-free 0.271 |
| 9BA8 O-GlcNAcase (OGA) inhibitor complex for the Treatment of Alzheimer's Disease 提交 2024-04-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
55–713（659 aa）
链 B
55–713（659 aa）
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未记录 | A1AKM N-[4-fluoro-5-({(2S,4S)-2-methyl-4-[(5-methyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)methoxy]piperidin-1-yl}methyl)-1,3-thiazol-2-yl]acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；294 K；15% PEG 3350, 200mM Magnesium Chloride, 100mM Hepes pH 7.0, 5% DMSO
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分辨率 2.54 Å R-free 0.231 |
| 9BA9 O-GlcNAcase (OGA) inhibitor complex for the Treatment of Alzheimer's Disease 提交 2024-04-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
55–713（659 aa）
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未记录 | A1AKL N-{5-[(piperidin-1-yl)methyl]-1,3-thiazol-2-yl}acetamide × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；281 K；33% PEG 300, 100mM Hepes pH 8.5
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分辨率 2.75 Å R-free 0.260 |
| 9NE2 cryoEM structure of the human OGA-L Catalytic Dimer 提交 2025-02-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–916（916 aa）
链 B
1–916（916 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.63 Å |
| 9NE4 cryoEM structure of the A-chain of the human OGA-L Catalytic Dimer 提交 2025-02-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–916（916 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.98 Å |
| 9NE5 cryoEM structure of the B-chain of the human OGA-L Catalytic Dimer 提交 2025-02-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–916（916 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.05 Å |
| 9QEN Cryo-EM structure of human O-GlcNAcase 提交 2025-03-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
11–420（410 aa）
链 A
553–916（364 aa）
链 B
11–420（410 aa）
链 B
553–916（364 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.08 Å |