当前蛋白身份:O60667 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7YSG Cryo-EM structure of human FcmR bound to sIgM 提交 2022-08-12 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致
链 R 18–124(107 aa)
链 S 18–124(107 aa)
链 U 18–124(107 aa)
链 V 18–124(107 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
7YTC Cryo-EM structure of human FcmR bound to IgM-Fc/J 提交 2022-08-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 R 18–124(107 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
7YTD Cryo-EM structure of four human FcmR bound to IgM-Fc/J 提交 2022-08-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致
链 R 18–124(107 aa)
链 S 18–124(107 aa)
链 U 18–124(107 aa)
链 V 18–124(107 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.71 Å
7YTE crystal structure of human FcmR-D1 bound to IgM C4-domain 提交 2022-08-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 18–124(107 aa)
链 D 18–124(107 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;1:1 ratio of protein:reservoir solution containing 0.1 M Ammonium citrate tribasic (pH 7.0) and 12% (w/v) PEG 3,350
分辨率 3.00 Å R-free 0.269
8BPE 8:1 binding of FcMR on IgM pentameric core 提交 2022-11-16 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:nonadecameric(19) 与蛋白数一致
链 I 18–251(234 aa)
链 M 18–251(234 aa)
链 N 18–251(234 aa)
链 O 18–251(234 aa)
链 P 18–251(234 aa)
链 Q 18–251(234 aa)
链 R 18–251(234 aa)
链 S 18–251(234 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.63 Å
8BPF FcMR binding at subunit Fcu1 of IgM pentamer 提交 2022-11-16 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 I 18–251(234 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8BPG FcMR binding at subunit Fcu3 of IgM pentamer 提交 2022-11-16 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 18–251(234 aa)
链 B 18–251(234 aa)
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å