当前蛋白身份：O67198
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1NY5 Crystal structure of sigm54 activator (AAA+ ATPase) in the inactive state 提交 2003-02-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–387（387 aa）
片段：Regulatory and Central domain
链 B
1–387（387 aa）
片段：Regulatory and Central domain
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；sodium/potasium phosphate, citric acid,imidazole,methanol,glycerol,, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 1NY6 Crystal structure of sigm54 activator (AAA+ ATPase) in the active state 提交 2003-02-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
122–387（266 aa）
片段：residues 122-387
链 B
122–387（266 aa）
片段：residues 122-387
链 C
122–387（266 aa）
片段：residues 122-387
链 D
122–387（266 aa）
片段：residues 122-387
链 E
122–387（266 aa）
片段：residues 122-387
链 F
122–387（266 aa）
片段：residues 122-387
链 G
122–387（266 aa）
片段：residues 122-387
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；diammonium tartrate, PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.329 |
| 1NY6 Crystal structure of sigm54 activator (AAA+ ATPase) in the active state 提交 2003-02-11 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 H
122–387（266 aa）
片段：residues 122-387
链 I
122–387（266 aa）
片段：residues 122-387
链 J
122–387（266 aa）
片段：residues 122-387
链 K
122–387（266 aa）
片段：residues 122-387
链 L
122–387（266 aa）
片段：residues 122-387
链 M
122–387（266 aa）
片段：residues 122-387
链 N
122–387（266 aa）
片段：residues 122-387
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；diammonium tartrate, PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.329 |
| 1ZY2 Crystal structure of the phosphorylated receiver domain of the transcription regulator NtrC1 from Aquifex aeolicus 提交 2005-06-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–136（136 aa）
链 B
1–136（136 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；310 K；PEG-3350, AMMONIUM CHLORIDE, GLYCEROL, CITRIC ACID, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 310K
|
分辨率 3.03 Å R-free 0.283 |
| 3M0E Crystal structure of the ATP-bound state of Walker B mutant of NtrC1 ATPase domain 提交 2010-03-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
122–387（266 aa）
片段：ATP-ase domain
链 B
122–387（266 aa）
片段：ATP-ase domain
链 C
122–387（266 aa）
片段：ATP-ase domain
链 D
122–387（266 aa）
片段：ATP-ase domain
链 E
122–387（266 aa）
片段：ATP-ase domain
链 F
122–387（266 aa）
片段：ATP-ase domain
链 G
122–387（266 aa）
片段：ATP-ase domain
|
突变：E239A 突变：E239A 突变：E239A 突变：E239A 突变：E239A 突变：E239A 突变：E239A | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M SODIUM CITRATE, 0.01 M FECL3, 0-5% (V/V) JEFFAMINE M-600, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.63 Å R-free 0.241 |
| 4BT0 MuB is an AAAplus ATPase that forms helical filaments to control target selection for DNA transposition 提交 2013-06-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：helical（14） 与蛋白数一致 |
链 A
312–384（73 aa）
片段：AAAPLUS DOMAIN, RESIDUES 312-384
链 B
137–309（173 aa）
片段：AAAPLUS DOMAIN, RESIDUES 137-309
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
30 MM TRISHCL PH 8.0, 0.3 M KCL, 5MM MGCL2, 1MM DTT, 1 MM ATP OR ATP-GAMMA-S；pH 8；30 MM TRISHCL PH 8.0, 0.3 M KCL, 5MM MGCL2, 1MM DTT, 1 MM ATP OR ATP-GAMMA-S
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 17.00 Å |
| 4BT0 MuB is an AAAplus ATPase that forms helical filaments to control target selection for DNA transposition 提交 2013-06-12 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
312–384（73 aa）
片段：AAAPLUS DOMAIN, RESIDUES 312-384
链 B
137–309（173 aa）
片段：AAAPLUS DOMAIN, RESIDUES 137-309
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
30 MM TRISHCL PH 8.0, 0.3 M KCL, 5MM MGCL2, 1MM DTT, 1 MM ATP OR ATP-GAMMA-S；pH 8；30 MM TRISHCL PH 8.0, 0.3 M KCL, 5MM MGCL2, 1MM DTT, 1 MM ATP OR ATP-GAMMA-S
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 17.00 Å |
| 4BT0 MuB is an AAAplus ATPase that forms helical filaments to control target selection for DNA transposition 提交 2013-06-12 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
312–384（73 aa）
片段：AAAPLUS DOMAIN, RESIDUES 312-384
链 B
137–309（173 aa）
片段：AAAPLUS DOMAIN, RESIDUES 137-309
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
30 MM TRISHCL PH 8.0, 0.3 M KCL, 5MM MGCL2, 1MM DTT, 1 MM ATP OR ATP-GAMMA-S；pH 8；30 MM TRISHCL PH 8.0, 0.3 M KCL, 5MM MGCL2, 1MM DTT, 1 MM ATP OR ATP-GAMMA-S
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 17.00 Å |
| 4BT1 MuB is an AAAplus ATPase that forms helical filaments to control target selection for DNA transposition 提交 2013-06-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 14 PDB 声明：helical（14） 与蛋白数一致 |
链 A
312–384（73 aa）
片段：AAAPLUS DOMAIN, RESIDUES 312-384
链 B
137–309（173 aa）
片段：AAAPLUS DOMAIN, RESIDUES 137-309
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
30 MM TRISHCL PH 8.0, 0.3 M KCL, 5MM MGCL2, 1MM DTT, 1 MM ATP OR ATP-GAMMA-S；pH 8；30 MM TRISHCL PH 8.0, 0.3 M KCL, 5MM MGCL2, 1MM DTT, 1 MM ATP OR ATP-GAMMA-S
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 16.00 Å |
| 4BT1 MuB is an AAAplus ATPase that forms helical filaments to control target selection for DNA transposition 提交 2013-06-12 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
312–384（73 aa）
片段：AAAPLUS DOMAIN, RESIDUES 312-384
链 B
137–309（173 aa）
片段：AAAPLUS DOMAIN, RESIDUES 137-309
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
30 MM TRISHCL PH 8.0, 0.3 M KCL, 5MM MGCL2, 1MM DTT, 1 MM ATP OR ATP-GAMMA-S；pH 8；30 MM TRISHCL PH 8.0, 0.3 M KCL, 5MM MGCL2, 1MM DTT, 1 MM ATP OR ATP-GAMMA-S
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 16.00 Å |
| 4BT1 MuB is an AAAplus ATPase that forms helical filaments to control target selection for DNA transposition 提交 2013-06-12 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
312–384（73 aa）
片段：AAAPLUS DOMAIN, RESIDUES 312-384
链 B
137–309（173 aa）
片段：AAAPLUS DOMAIN, RESIDUES 137-309
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
30 MM TRISHCL PH 8.0, 0.3 M KCL, 5MM MGCL2, 1MM DTT, 1 MM ATP OR ATP-GAMMA-S；pH 8；30 MM TRISHCL PH 8.0, 0.3 M KCL, 5MM MGCL2, 1MM DTT, 1 MM ATP OR ATP-GAMMA-S
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 16.00 Å |
| 4L4U Crystal structure of construct containing A. aeolicus NtrC1 receiver, central and DNA binding domains 提交 2013-06-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–439（439 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å R-free 0.248 |
| 4L5E Crystal structure of A. aeolicus NtrC1 DNA binding domain 提交 2013-06-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
393–438（46 aa）
片段：unp residues 393-438
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.34 Å R-free 0.206 |
| 4LY6 Nucleotide-induced asymmetry within ATPase activator ring drives s54-RNAP interaction and ATP hydrolysis 提交 2013-07-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
链 B
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
链 C
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
链 D
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
链 E
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
链 F
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
|
未记录 | 08T [[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-tris(fluoranyl)beryllium × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；277 K；20% ethylene glycol, pH 7.9, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.308 |
| 4LY6 Nucleotide-induced asymmetry within ATPase activator ring drives s54-RNAP interaction and ATP hydrolysis 提交 2013-07-30 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 G
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
链 H
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
链 I
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
链 J
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
链 K
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
链 L
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
|
未记录 | 08T [[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-tris(fluoranyl)beryllium × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；277 K；20% ethylene glycol, pH 7.9, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.308 |
| 4LY6 Nucleotide-induced asymmetry within ATPase activator ring drives s54-RNAP interaction and ATP hydrolysis 提交 2013-07-30 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 M
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
链 N
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
链 O
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
链 P
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
链 Q
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
链 R
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
|
未记录 | 08T [[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-tris(fluoranyl)beryllium × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；277 K；20% ethylene glycol, pH 7.9, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.308 |
| 4LY6 Nucleotide-induced asymmetry within ATPase activator ring drives s54-RNAP interaction and ATP hydrolysis 提交 2013-07-30 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 S
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
链 T
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
链 U
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
链 V
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
链 W
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
链 X
121–387（267 aa）
片段：UNP residues 121-387
|
未记录 | 08T [[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-tris(fluoranyl)beryllium × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；277 K；20% ethylene glycol, pH 7.9, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.308 |
| 4LZZ Nucleotide-induced asymmetry within atpase activator ring drives s54-RNAP interaction and ATP hydrolysis 提交 2013-08-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
链 B
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
链 C
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
链 D
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
链 E
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
链 F
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
|
未记录 | 08T [[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-tris(fluoranyl)beryllium × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；277 K；20% ethylene glycol, crystal soaked in fresh mother liquor prior to flash cooling, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.21 Å R-free 0.322 |
| 4LZZ Nucleotide-induced asymmetry within atpase activator ring drives s54-RNAP interaction and ATP hydrolysis 提交 2013-08-01 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 G
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
链 H
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
链 I
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
链 J
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
链 K
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
链 L
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
|
未记录 | 08T [[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-tris(fluoranyl)beryllium × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；277 K；20% ethylene glycol, crystal soaked in fresh mother liquor prior to flash cooling, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.21 Å R-free 0.322 |
| 4LZZ Nucleotide-induced asymmetry within atpase activator ring drives s54-RNAP interaction and ATP hydrolysis 提交 2013-08-01 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 M
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
链 N
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
链 O
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
链 P
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
链 Q
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
链 R
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
|
未记录 | 08T [[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-tris(fluoranyl)beryllium × 6 MG MAGNESIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；277 K；20% ethylene glycol, crystal soaked in fresh mother liquor prior to flash cooling, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.21 Å R-free 0.322 |
| 4LZZ Nucleotide-induced asymmetry within atpase activator ring drives s54-RNAP interaction and ATP hydrolysis 提交 2013-08-01 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 S
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
链 T
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
链 U
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
链 V
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
链 W
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
链 X
121–387（267 aa）
片段：ATPase Domain (UNP residues 121-387)
|
未记录 | 08T [[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-tris(fluoranyl)beryllium × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；277 K；20% ethylene glycol, crystal soaked in fresh mother liquor prior to flash cooling, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.21 Å R-free 0.322 |
| 9MSE de novo SigN RNA polymerase transcription initiation intermediate with pre-catalytic bEBP state (RPi1 open ring) 提交 2025-01-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：16-meric（16） 与全部聚合物一致 |
链 A
121–387（267 aa）
链 B
121–387（267 aa）
链 C
121–387（267 aa）
链 D
121–387（267 aa）
链 E
121–387（267 aa）
链 F
121–387（267 aa）
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未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 3 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.70 Å |
| 9MSF de novo SigN RNA polymerase transcription initiation intermediate with post-catalytic bEBP state (RPi1 closed ring) 提交 2025-01-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：16-meric（16） 与全部聚合物一致 |
链 A
121–387（267 aa）
链 B
121–387（267 aa）
链 C
121–387（267 aa）
链 D
121–387（267 aa）
链 E
121–387（267 aa）
链 F
121–387（267 aa）
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未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.60 Å |
| 9MSG De novo SigN RNA polymerase transcription initiation intermediate with bound SigN-RII 提交 2025-01-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric（14） 与全部聚合物一致 |
链 A
121–387（267 aa）
链 B
121–387（267 aa）
链 C
121–387（267 aa）
链 D
121–387（267 aa）
链 E
121–387（267 aa）
链 F
121–387（267 aa）
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未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.70 Å |