当前蛋白身份:O75496 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1T6F Crystal Structure of the Coiled-coil Dimerization Motif of Geminin 提交 2004-05-06 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 109–145(37 aa) 片段:COILED-COIL DOMAIN
链 B 109–145(37 aa) 片段:COILED-COIL DOMAIN
突变:A1T 突变:A1T 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;291 K;10% PEG 6000, 5% MPD, 100 mM Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.47 Å R-free 0.221
1UII Crystal structure of Geminin coiled-coil domain 提交 2003-07-16 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 70–152(83 aa) 片段:coiled-coil domain
链 B 70–152(83 aa) 片段:coiled-coil domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION;pH 8.5;293 K;0.36M Sodium Acetate, 0.1M TRIS, 30% PEG 4000, pH 8.5, EVAPORATION, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.239
2LP0 The solution structure of homeodomain-protein complex 提交 2012-01-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 171–190(20 aa) 片段:UNP residues 171-190
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;296 K;离子强度(mmCIF原始值)0.125;压力 ambient
NMR样品组成 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Hox-C9-1, 1.0 mM Geminin-2, 25 mM potassium phosphate-3, 100 mM sodium chloride-4, 5 mM DTT-5, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1.0 mM Hox-C9-6, 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Geminin-7, 25 mM potassium phosphate-8, 100 mM sodium chloride-9, 5 mM DTT-10, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Hox-C9-11, 1.0 mM Geminin-12, 25 mM potassium phosphate-13, 100 mM sodium chloride-14, 5 mM DTT-15, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 1.0 mM Hox-C9-16, 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Geminin-17, 25 mM potassium phosphate-18, 100 mM sodium chloride-19, 5 mM DTT-20, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2WVR Human Cdt1:Geminin complex 提交 2009-10-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–209(209 aa)
链 B 1–209(209 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;PH 7.5 100-150 MM NACL CAPILLARY GRADIENT
分辨率 3.30 Å R-free 0.301
4BRY The Idas:Geminin heterodimeric parallel coiled-coil 提交 2013-06-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 83–160(78 aa) 片段:COILED-COIL, RESIDUES 83-160
未记录 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;0.1 M SPG PH 7.5, 10 % ISOPROPANOL
分辨率 2.89 Å R-free 0.226
7KLZ Structure of SPOP MATH domain in complex with a Geminin peptide 提交 2020-11-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 195–209(15 aa)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;One microliter of the protein complex in 20 mM Tris-HCl, pH 7.6, 50 mM NaCl and 5 mM dithiothreitol was mixed with on microliter of 0.2 M ammonium citrate dibasic and 20% (W/V) PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.241
7KLZ Structure of SPOP MATH domain in complex with a Geminin peptide 提交 2020-11-01 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 195–209(15 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;One microliter of the protein complex in 20 mM Tris-HCl, pH 7.6, 50 mM NaCl and 5 mM dithiothreitol was mixed with on microliter of 0.2 M ammonium citrate dibasic and 20% (W/V) PEG 3350
分辨率 3.40 Å R-free 0.241