当前蛋白身份:O75604
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2HD5 USP2 in complex with ubiquitin 提交 2006-06-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
258–605(348 aa)
片段:residues 258-605
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
LIQUID DIFFUSION;pH 6.5;295 K;200 mM MgCl2, 25% PEG 3550, 100 mM Bis-Tris, Protein at 11.8 mg/ml, pH 6.5, LIQUID DIFFUSION, temperature 295K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.229 |
| 2IBI Covalent Ubiquitin-USP2 Complex 提交 2006-09-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
250–605(356 aa)
片段:CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 251-605
|
突变:E472A, K473A | ZN ZINC ION × 1 NEH ETHANAMINE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9;298 K;22% PEG1500, 0.1 M Bicine, 0.2 M
NaCl, 1 mM DTT, pH 9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K, pH 9.00
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.259 |
| 3NHE High Resolution Structure (1.26A) of USP2a in Complex with Ubiquitin 提交 2010-06-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
258–605(348 aa)
片段:UNP residues 258-605
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.8;295 K;5% PEG4000, 0.1M Hepes, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.189 |
| 3V6C Crystal Structure of USP2 in complex with mutated ubiquitin 提交 2011-12-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
258–605(348 aa)
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;21% PEG 3350,0.2 M CaCl,
0.1 Bis-Tris pH 7.0,
glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.220 |
| 3V6E Crystal Structure of USP2 and a mutant form of Ubiquitin 提交 2011-12-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
258–605(348 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;21% PEG3350, 0.2 M Calcium Chloride,0.1 Bis-Tris pH 7.0,
glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.234 |
| 5XU8 Crystal structure of human USP2 in complex with ubiquitin and 6-thioguanine 提交 2017-06-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
258–605(348 aa)
片段:UNP residues 258-605
|
未记录 | DX4 2-amino-1,9-dihydro-6H-purine-6-thione × 1 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 5 NA SODIUM ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;295 K;24.5% PEG3350, 0.2 M MgC12, 0.1 M Bis-Tris
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.238 |
| 5XVE Crystal structure of human USP2 C276S mutant in complex with ubiquitin 提交 2017-06-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
258–605(348 aa)
片段:UNP residues 258-605
|
突变:C276S | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;295 K;21% PEG3350, 8% Tacsimate (pH8.0)
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分辨率 1.24 Å R-free 0.164 |
| 6DGF Ubiquitin Variant bound to USP2 提交 2018-05-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
250–605(356 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;0.1 M MES buffer pH 6, 12% (w/v) PEG3350, 0.2M sodium sulfate
|
分辨率 2.34 Å R-free 0.224 |