当前蛋白身份:O75604 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2HD5 USP2 in complex with ubiquitin 提交 2006-06-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 258–605(348 aa) 片段:residues 258-605
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 LIQUID DIFFUSION;pH 6.5;295 K;200 mM MgCl2, 25% PEG 3550, 100 mM Bis-Tris, Protein at 11.8 mg/ml, pH 6.5, LIQUID DIFFUSION, temperature 295K
分辨率 1.85 Å R-free 0.229
2IBI Covalent Ubiquitin-USP2 Complex 提交 2006-09-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 250–605(356 aa) 片段:CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 251-605
突变:E472A, K473A ZN ZINC ION × 1 NEH ETHANAMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9;298 K;22% PEG1500, 0.1 M Bicine, 0.2 M NaCl, 1 mM DTT, pH 9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K, pH 9.00
分辨率 2.20 Å R-free 0.259
3NHE High Resolution Structure (1.26A) of USP2a in Complex with Ubiquitin 提交 2010-06-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 258–605(348 aa) 片段:UNP residues 258-605
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.8;295 K;5% PEG4000, 0.1M Hepes, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.26 Å R-free 0.189
3V6C Crystal Structure of USP2 in complex with mutated ubiquitin 提交 2011-12-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 258–605(348 aa)
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;21% PEG 3350,0.2 M CaCl, 0.1 Bis-Tris pH 7.0, glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.70 Å R-free 0.220
3V6E Crystal Structure of USP2 and a mutant form of Ubiquitin 提交 2011-12-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 258–605(348 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;21% PEG3350, 0.2 M Calcium Chloride,0.1 Bis-Tris pH 7.0, glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.234
5XU8 Crystal structure of human USP2 in complex with ubiquitin and 6-thioguanine 提交 2017-06-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 258–605(348 aa) 片段:UNP residues 258-605
未记录 DX4 2-amino-1,9-dihydro-6H-purine-6-thione × 1 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 5 NA SODIUM ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;295 K;24.5% PEG3350, 0.2 M MgC12, 0.1 M Bis-Tris
分辨率 1.81 Å R-free 0.238
5XVE Crystal structure of human USP2 C276S mutant in complex with ubiquitin 提交 2017-06-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 258–605(348 aa) 片段:UNP residues 258-605
突变:C276S ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;295 K;21% PEG3350, 8% Tacsimate (pH8.0)
分辨率 1.24 Å R-free 0.164
6DGF Ubiquitin Variant bound to USP2 提交 2018-05-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 250–605(356 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;0.1 M MES buffer pH 6, 12% (w/v) PEG3350, 0.2M sodium sulfate
分辨率 2.34 Å R-free 0.224