当前蛋白身份：O75832
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1QYM X-ray structure of human gankyrin 提交 2003-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–226（225 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；3.5M Na Formate , pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293.0K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.233 |
| 1TR4 Solution structure of human oncogenic protein gankyrin 提交 2004-06-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）< 10 mM salt；压力 ambient
NMR样品组成
~0.4 mM gankyrin U-15N,13C,70% 2H | 5mM HEPES, 1 uM EDTA, 1mM DTT
NMR样品组成
~0.4 mM gankyrin U-15N, 13C | 5mM HEPES, 1 uM EDTA, 1mM DTT
NMR样品组成
~0.4 mM gankyrin U-15N | 5mM HEPES, 1 uM EDTA, 1mM DTT
|
分辨率未提供 |
| 1UOH HUMAN GANKYRIN 提交 2003-09-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.4；24% PEG 5000 MONOMETHYL ETHER, 0.1 M MES PH 6.4
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分辨率 2.00 Å R-free 0.253 |
| 4NIK Structure of human Gankyrin in complex to the single chain antibody F5 提交 2013-11-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；290 K；8% PEG8000, 0.1M Hepes, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
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分辨率 2.50 Å R-free 0.208 |
| 5VHF Conformational Landscape of the p28-Bound Human Proteasome Regulatory Particle 提交 2017-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric（19） 与蛋白数一致 |
链 G
4–226（223 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.70 Å |
| 5VHH Conformational Landscape of the p28-Bound Human Proteasome Regulatory Particle 提交 2017-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric（19） 与蛋白数一致 |
链 G
4–226（223 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.10 Å |
| 5VHI Conformational Landscape of the p28-Bound Human Proteasome Regulatory Particle 提交 2017-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric（19） 与蛋白数一致 |
链 G
1–226（226 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.80 Å |
| 5VHJ Conformational Landscape of the p28-Bound Human Proteasome Regulatory Particle 提交 2017-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 G
4–226（223 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.50 Å |
| 5VHM Conformational Landscape of the p28-Bound Human Proteasome Regulatory Particle 提交 2017-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 G
4–226（223 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.30 Å |
| 5VHN Conformational Landscape of the p28-Bound Human Proteasome Regulatory Particle 提交 2017-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 G
4–226（223 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.30 Å |
| 5VHO Conformational Landscape of the p28-Bound Human Proteasome Regulatory Particle 提交 2017-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 G
4–226（223 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.30 Å |
| 5VHP Conformational Landscape of the p28-Bound Human Proteasome Regulatory Particle 提交 2017-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 G
3–226（224 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.90 Å |
| 5VHQ Conformational Landscape of the p28-Bound Human Proteasome Regulatory Particle 提交 2017-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 G
4–226（223 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.90 Å |
| 5VHR Conformational Landscape of the p28-Bound Human Proteasome Regulatory Particle 提交 2017-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 G
4–226（223 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.70 Å |
| 7VO6 High resolution crystal structure of human PSMD10 (Gankyrin) 提交 2021-10-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
|
突变：0 | MLA MALONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；60% v/v Tacsimate pH 7.0 (Hampton Research)
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分辨率 1.71 Å R-free 0.231 |
| 7VXV Snapshots of Human PSMD10(Gankyrin) unfolding by urea: 0 hours incubation / Native 提交 2021-11-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；60% Tacsimate pH 7.0
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.243 |
| 7VXW Snapshots of Human PSMD10(Gankyrin) unfolding by urea: 1 hour incubation 提交 2021-11-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
|
未记录 | URE UREA × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；60% Tacsimate pH7
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.327 |
| 7VY4 Snapshots of Human PSMD10(Gankyrin) unfolding by urea: 2 hours incubation 提交 2021-11-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
|
未记录 | URE UREA × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；60% Tacsimate pH7
|
分辨率 2.22 Å R-free 0.312 |
| 7VY7 Snapshots of Human PSMD10(Gankyrin) unfolding by urea: 3 hours incubation 提交 2021-11-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
|
未记录 | URE UREA × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；60% Tacsimate pH 7
|
分辨率 2.23 Å R-free 0.313 |