当前蛋白身份:O75843 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2E9G Solution structure of the alpha adaptinC2 domain from human Adapter-related protein complex 1 gamma 2 subunit 提交 2007-01-25 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 662–785(124 aa) 片段:Alpha adaptinC2 domain, GAE
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7;296 K;离子强度(mmCIF原始值)120mM;压力 ambient
NMR样品组成 0.54mM alpha adaptinC2 domain U-15N,13C; 20mM d-Tris-HCl(pH 7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 10% D2O, 90% H2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2YMT gamma 2 adaptin EAR domain crystal structure with phage peptide GEEWGPWV 提交 2012-10-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 665–785(121 aa) 片段:EAR DOMAIN, RESIDUES 665-785
未记录 PDO 1,3-PROPANDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5;100 MM MES/IMIDAZOLE PH 6.5, 0.02 M 1,6-HEXANEDIOL, 0.02 M 1-BUTANOL, 0.02 M (RS)-1,2- PROPANEDIOL, 0.02 M 2-PROPANOL, 0.02 M 1,4-BUTANEDIOL, 0.02 M 1,3-PROPANEDIOL, 10% (W/V) PEG 20000 AND 24% (V/V) PEG400 (USING A 2:1 RATIO OF PROTEIN TO MOTHER LIQUOR)
分辨率 1.80 Å R-free 0.242
3ZHF gamma 2 adaptin EAR domain crystal structure with preS1 site1 peptide NPDWDFN 提交 2012-12-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 665–785(121 aa) 片段:EAR DOMAIN, RESIDUES 665-785
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5;100 MM MES/IMIDAZOLE PH 6.5, 0.02 M 1,6-HEXANEDIOL, 0.02 M 1-BUTANOL, 0.02 M (RS)-1, 2-PROPANEDIOL, 0.02 M 2-PROPANOL, 0.02 M 1,4-BUTANEDIOL, 0.02 M 1,3-PROPANEDIOL, 10% (W/V) PEG 20000 AND 24% (V/V) PEG400 (USING A 2:1 RATIO OF PROTEIN TO MOTHER LIQUOR), PEPTIDE WAS AT ABOUT 50 FOLD MOLAR EXCESS
分辨率 1.70 Å R-free 0.226
4BCX gamma 2 adaptin EAR domain crystal structure 提交 2012-10-03 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 665–785(121 aa) 片段:EAR DOMAIN, RESIDUES 665-785
未记录 IMD IMIDAZOLE × 1 PDO 1,3-PROPANDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5;100 MM MES/IMIDAZOLE BUFFER PH 6.5, 0.03 M EACH OF DI-, TRI-, TETRA- AND PENTA-ETHYLENEGLYCOL, 10% (W/V) PEG 20000 AND 24% (V/V) PEG400 (USING A 2:1 RATIO OF PROTEIN TO MOTHER LIQUOR)
分辨率 2.00 Å R-free 0.268