当前蛋白身份：O76094
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5M72 Structure of the human SRP68-72 protein-binding domain complex 提交 2016-10-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
10–166（157 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 K POTASSIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2 M K2SO4
20% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.184 |
| 5M73 Structure of the human SRP S domain with SRP72 RNA-binding domain 提交 2016-10-26 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 D
512–668（157 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 30 K POTASSIUM ION × 5 GOL GLYCEROL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；17 % (w/v) PEG3350
0.1 M KF
0.1 M Tris pH 8.5
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.280 |
| 5M73 Structure of the human SRP S domain with SRP72 RNA-binding domain 提交 2016-10-26 | Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 H
512–668（157 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 15 K POTASSIUM ION × 5 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；17 % (w/v) PEG3350
0.1 M KF
0.1 M Tris pH 8.5
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.280 |
| 5WRV Complex structure of human SRP72/SRP68 提交 2016-12-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–163（163 aa）
片段：UNP residues 1-163
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未记录 | ACT ACETATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 5 SO4 SULFATE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；(NH4)2SO4
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.189 |
| 5WRW Structure of human apo-SRP72 提交 2016-12-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–163（163 aa）
片段：UNP residues 1-163
链 B
1–163（163 aa）
片段：UNP residues 1-163
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；(NH4)2SO4
|
分辨率 2.91 Å R-free 0.266 |
| 5WRW Structure of human apo-SRP72 提交 2016-12-04 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–163（163 aa）
片段：UNP residues 1-163
链 D
1–163（163 aa）
片段：UNP residues 1-163
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；(NH4)2SO4
|
分辨率 2.91 Å R-free 0.266 |
| 5WRW Structure of human apo-SRP72 提交 2016-12-04 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
1–163（163 aa）
片段：UNP residues 1-163
链 F
1–163（163 aa）
片段：UNP residues 1-163
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；(NH4)2SO4
|
分辨率 2.91 Å R-free 0.266 |
| 7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric（55） 与全部聚合物一致 |
链 z
1–671（671 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8QVW Cryo-EM structure of the peptide binding domain of human SRP68/72 提交 2023-10-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–671（671 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8QVX Structure of the PBD of human SRP68/72 (cryoSPARC 3DFlex) 提交 2023-10-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–671（671 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å |