当前蛋白身份：O77059
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4GU5 Structure of Full-length Drosophila Cryptochrome 提交 2012-08-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–539（539 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；298 K；50 MM HEPES PH 8.0; 150 MM NACL 5MG/ML PROTEIN MIXED 1:1 WITH 18% PDG 4K, 150 MM MGACETATE, 100 MM TRIS
PH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.247 |
| 4GU5 Structure of Full-length Drosophila Cryptochrome 提交 2012-08-29 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–539（539 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；298 K；50 MM HEPES PH 8.0; 150 MM NACL 5MG/ML PROTEIN MIXED 1:1 WITH 18% PDG 4K, 150 MM MGACETATE, 100 MM TRIS
PH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.247 |
| 4JZY Crystal structures of Drosophila Cryptochrome 提交 2013-04-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–540（540 aa）
链 B
1–540（540 aa）
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未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 NH4 AMMONIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；293 K；0.2 M NH4OAc, 20% PEG 3350 , pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.34 Å R-free 0.222 |
| 4K03 Crystal structure of Drosophila Cryprochrome 提交 2013-04-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–542（542 aa）
链 B
1–542（542 aa）
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；100 mM TrisHCl pH 8.0, 17% PEG 3350, 120 mM Mg-Acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 3.20 Å R-free 0.269 |
| 6WTB Sort-Tagged Drosophila Cryptochrome 提交 2020-05-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–539（539 aa）
链 B
1–539（539 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 3 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；298 K；4 microliter drop (2 microliter protein solution, 2 microliter well solution)
100 mM Tris (pH 9)
150 mM Magneisum Acetate Tetrahydrate
17% PEG-4000
8 mg/mL sort-tagged WT Drosophila Cryptochrome
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分辨率 2.58 Å R-free 0.287 |
| 7UD0 Room Temperature Drosophila Cryptochrome 提交 2022-03-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–539（539 aa）
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未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 8.5；298 K；5 mg/mL twin-strep tagged dCRY (1-539)
100 mM Tris (pH 8.5)
150 mM Magnesium acetate tetrahydrate
18% PEG-4000
Mixed 1:1 in Eppendorf tube; no vortexing
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分辨率 3.50 Å R-free 0.294 |
| 7UD0 Room Temperature Drosophila Cryptochrome 提交 2022-03-17 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–539（539 aa）
|
未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
BATCH MODE；pH 8.5；298 K；5 mg/mL twin-strep tagged dCRY (1-539)
100 mM Tris (pH 8.5)
150 mM Magnesium acetate tetrahydrate
18% PEG-4000
Mixed 1:1 in Eppendorf tube; no vortexing
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分辨率 3.50 Å R-free 0.294 |
| 8DD7 The Cryo-EM structure of Drosophila Cryptochrome in complex with Timeless 提交 2022-06-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–520（520 aa）
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未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 3.30 Å |