当前蛋白身份:O85040 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1SVD The structure of Halothiobacillus neapolitanus RuBisCo 提交 2004-03-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–473(473 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.8;298 K;ammonium sulfate, citrate, cobalt chloride, glycerol, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.166
1SVD The structure of Halothiobacillus neapolitanus RuBisCo 提交 2004-03-29 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致
链 A 1–473(473 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 16 GOL GLYCEROL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.8;298 K;ammonium sulfate, citrate, cobalt chloride, glycerol, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.166
1SVD The structure of Halothiobacillus neapolitanus RuBisCo 提交 2004-03-29 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–473(473 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.8;298 K;ammonium sulfate, citrate, cobalt chloride, glycerol, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.166
1SVD The structure of Halothiobacillus neapolitanus RuBisCo 提交 2004-03-29 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 1–473(473 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.8;298 K;ammonium sulfate, citrate, cobalt chloride, glycerol, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.166
6UEW Rubisco / CsoS2 N-peptide complex responsible for alpha-carboxysome cargo loading 提交 2019-09-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致
链 A 2–473(472 aa)
链 C 2–473(472 aa)
链 E 2–473(472 aa)
链 G 2–473(472 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;PEG 400, magnesium chloride, HEPES
分辨率 2.40 Å R-free 0.259
7SMK H. neapolitanus carboxysomal rubisco/CsoSCA-peptide (1-50)complex 提交 2021-10-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致
链 A 2–473(472 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot for 3 seconds
分辨率 1.98 Å
7SNV H. neapolitanus carboxysomal rubisco/CsoSCA-peptide (1-50)complex 提交 2021-10-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致
链 A 2–473(472 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;blot for 3 seconds
分辨率 2.07 Å
7ZBT Subtomogram averaging of Rubisco from native Halothiobacillus carboxysomes 提交 2022-03-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致
链 A 1–473(473 aa)
链 B 1–473(473 aa)
链 C 1–473(473 aa)
链 D 1–473(473 aa)
链 E 1–473(473 aa)
链 F 1–473(473 aa)
链 G 1–473(473 aa)
链 H 1–473(473 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å