当前蛋白身份:O88522 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2V4H NEMO CC2-LZ domain - 1D5 DARPin complex 提交 2008-09-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 251–337(87 aa) 片段:CC2-LZ DOMAIN, RESIDUES 251-337
链 B 251–337(87 aa) 片段:CC2-LZ DOMAIN, RESIDUES 251-337
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5;5% MPD, 5% ETHANOL, 100 MM HEPES, PH 7.5
分辨率 2.90 Å R-free 0.268
2ZVN NEMO CoZi domain incomplex with diubiquitin in P212121 space group 提交 2008-11-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 253–337(85 aa) 片段:CC2-LZ, CoZi domain
链 D 253–337(85 aa) 片段:CC2-LZ, CoZi domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.00 Å R-free 0.303
2ZVN NEMO CoZi domain incomplex with diubiquitin in P212121 space group 提交 2008-11-12 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 F 253–337(85 aa) 片段:CC2-LZ, CoZi domain
链 H 253–337(85 aa) 片段:CC2-LZ, CoZi domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.00 Å R-free 0.303
2ZVO NEMO CoZi domain in complex with diubiquitin in C2 space group 提交 2008-11-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 250–339(90 aa) 片段:CC2-LZ, CoZi domain
链 D 250–339(90 aa) 片段:CC2-LZ, CoZi domain
突变:E282A, K285A 突变:E282A, K285A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
分辨率 2.90 Å R-free 0.277
3F89 NEMO CoZi domain 提交 2008-11-11 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 250–339(90 aa) 片段:CC2-LZ, CoZi domain
链 B 250–339(90 aa) 片段:CC2-LZ, CoZi domain
突变:K285N 突变:K285N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.80 Å R-free 0.310
3JSV Crystal structure of mouse NEMO CoZi in complex with Lys63-linked di-ubiquitin 提交 2009-09-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 250–343(94 aa) 片段:residues 250-343
链 D 250–343(94 aa) 片段:residues 250-343
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.294
4OWF Crystal structure of the NEMO CoZi in complex with HOIP NZF1 domain 提交 2014-01-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 250–339(90 aa)
链 B 250–339(90 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;Co-crystals were obtained after 6 days in 20% (w/v) PEG-3350 and 0.2 M DL-malic acid
分辨率 2.00 Å R-free 0.313