当前蛋白身份：O94907
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3S2K Structural basis of Wnt signaling inhibition by Dickkopf binding to LRP5/6. 提交 2011-05-16 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
178–266（89 aa）
片段：C-terminal domain, UNP residues 178-266
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；10-15% PEG3350, 100 mM Tris-Cl (pH 8.5), 100 mM Lithium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.251 |
| 3S8V Crystal structure of LRP6-Dkk1 complex 提交 2011-05-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 X
183–266（84 aa）
片段：Dkk1c, residues 184-266
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；298 K；20mM citric acid, 80mM Bis-tris propane pH 8.8, 19-20% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.292 |
| 3SOQ The structure of the first YWTD beta propeller domain of LRP6 in complex with a DKK1 peptide 提交 2011-06-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Z
38–44（7 aa）
片段：UNP residues 38-44
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 FUC alpha-L-fucopyranose × 1 GOL GLYCEROL × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.1M potassium thiocyanate and 30% (w/v) PEG MME 2000, pH 8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
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分辨率 1.90 Å R-free 0.221 |
| 5FWW Wnt modulator Kremen in complex with DKK1 (CRD2) and LRP6 (PE3PE4) 提交 2016-02-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
182–266（85 aa）
片段：CRD2, RESIDUES 182-266
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；20 %W/V PEG3350 0.2 M NA/K-PHOSPHATE, pH 7.5
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分辨率 3.50 Å R-free 0.355 |
| 5GJE Three-dimensional reconstruction of human LRP6 ectodomain complexed with Dkk1 提交 2016-06-29 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
182–266（85 aa）
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未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 GOL GLYCEROL × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
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分辨率 21.00 Å |