当前蛋白身份:O95402 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
5ODD HUMAN MED26 N-TERMINAL DOMAIN (1-92) 提交 2017-07-05 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–92(92 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.1;压力 AMBIENT
NMR样品组成 1.2 mM [U-13C; U-15N] MED26-NTD, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 1.2 mM [U-99% 15N] MED26-NTD, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
6ZV3 TFIIS N-terminal domain (TND) from human MED26 提交 2020-07-23 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–87(87 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4;298 K;离子强度(mmCIF原始值)225;压力 1
NMR样品组成 0.5 mM [U-13C; U-15N] MED26, 25 mM [U-2H] TRIS, 200 mM sodium chloride, 1 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
7EMF Human Mediator (deletion of MED1-IDR) in a Tail-extended conformation 提交 2021-04-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白数一致
链 Z 1–600(600 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 74 PDB 声明:76-meric(76) 与全部聚合物一致
链 z 1–600(600 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 74 PDB 声明:76-meric(76) 与全部聚合物一致
链 z 1–600(600 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.13 Å
7ENJ Human Mediator (deletion of MED1-IDR) in a Tail-bent conformation (MED-B) 提交 2021-04-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:26-meric(26) 与蛋白数一致
链 Z 1–600(600 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 83 PDB 声明:87-meric(87) 与全部聚合物一致
链 z 1–600(600 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 83 PDB 声明:87-meric(87) 与全部聚合物一致
链 z 1–600(600 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.16 Å