当前蛋白身份：O95863
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2Y48 Crystal structure of LSD1-CoREST in complex with a N-terminal SNAIL peptide 提交 2011-01-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
2–21（20 aa）
片段：N-TERMINAL 20 AMINO ACIDS TAIL, RESIUDES 2-21
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未记录 | FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
1.2 M SODIUM/POTASSIUM TARTRATE, 100 MM ADA BUFFER PH 6.5
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分辨率 3.00 Å R-free 0.246 |
| 3W5K Crystal structure of Snail1 and importin beta complex 提交 2013-01-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–264（264 aa）
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未记录 | ZN ZINC ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.60 Å R-free 0.264 |
| 4QLI A novel phospho-switch in the linker region of the snail zinc finger protein which regulates 14-3-3 association, DNA binding and epithelial-mesenchymal differentiation 提交 2014-06-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
175–180（6 aa）
片段：phosphopeptide (UNP residues 175-180)
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277.15 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 0.2 M calcium chloride, 28% PEG400, 5% glycerol, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K
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分辨率 1.45 Å R-free 0.203 |
| 8BOX LSD1-CoREST in complex with AW4 and SNAG peptide 提交 2022-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
2–10（9 aa）
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未记录 | SV9 [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{S},4~{S})-5-[7,8-dimethyl-2,4-bis(oxidanylidene)-5-[3-[4-(3-phenylphenyl)phenyl]propanoyl]-1~{H}-benzo[g]pteridin-10-yl]-2,3,4-tris(oxidanyl)pentyl] hydrogen phosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2 Na/K Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5
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分辨率 2.82 Å R-free 0.229 |
| 8F59 LSD1-CoREST in complex with AW2 and SNAG peptide 提交 2022-11-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
2–10（9 aa）
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未记录 | XB6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-5-{5-[3-([1,1'-biphenyl]-4-yl)propanoyl]-7,8-dimethyl-2,4-dioxo-1,3,4,5-tetrahydrobenzo[g]pteridin-10(2H)-yl}-2,3,4-trihydroxypentyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2 Na/K Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5
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分辨率 2.80 Å R-free 0.234 |
| 8FDV LSD1-CoREST in complex N-formyl FAD and SNAG peptide 提交 2022-12-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
2–10（9 aa）
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未记录 | HUF [[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2R,3S,4S)-5-[5-methanoyl-7,8-dimethyl-2,4-bis(oxidanylidene)-1H-benzo[g]pteridin-10-yl]-2,3,4-tris(oxidanyl)pentyl] hydrogen phosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2 Na/K Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5
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分辨率 2.95 Å R-free 0.252 |
| 8FJ7 LSD1-CoREST in complex with T108 and SNAG peptide 提交 2022-12-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
2–10（9 aa）
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未记录 | Y0Z [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-5-[7,8-dimethyl-2,4-dioxo-5-{3-[3-(phenylcarbamoyl)phenyl]propanoyl}-1,3,4,5-tetrahydrobenzo[g]pteridin-10(2H)-yl]-2,3,4-trihydroxypentyl dihydrogen diphosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2 Na/K Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5
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分辨率 2.80 Å R-free 0.243 |
| 8ULZ LSD1-CoREST in complex with T18 and SNAG peptide 提交 2023-10-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
2–10（9 aa）
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未记录 | YAO [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-5-[(1R,3S,3aS,13R)-3-(3-benzamidophenyl)-1-hydroxy-10,11-dimethyl-4,6-dioxo-2,3,5,6-tetrahydro-1H-benzo[g]pyrrolo[2,1-e]pteridin-8(4H)-yl]-2,3,4-trihydroxypentyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.2 Sodium Potassium Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5
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分辨率 3.32 Å R-free 0.231 |