当前蛋白身份：P00970
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5WFY Crystal structure of DNA-binding domain of the bacteriophage T4 ligase 提交 2017-07-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–129（129 aa）
片段：DNA binding domain (UNP residues 1-129)
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG3350
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分辨率 1.40 Å R-free 0.181 |
| 6DRT Crystal structure of the processivity clamp GP45 complexed with recognition peptide of ligase from bacteriophage T4 提交 2018-06-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
225–237（13 aa）
链 E
225–237（13 aa）
链 F
225–237（13 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；PEG3350
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分辨率 2.12 Å R-free 0.240 |
| 6DT1 Crystal structure of the ligase from bacteriophage T4 complexed with DNA intermediate 提交 2018-06-14 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–487（487 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 12 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 5 CL CHLORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350
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分辨率 2.75 Å R-free 0.219 |