当前蛋白身份：P01023
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AYO RECEPTOR BINDING DOMAIN OF BOVINE ALPHA-2-MACROGLOBULIN 提交 1997-11-07 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1338–1468（131 aa）
片段：RECEPTOR-BINDING DOMAIN
链 B
1338–1468（131 aa）
片段：RECEPTOR-BINDING DOMAIN
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.9；38% PEGMMES 2000, 25 MM CACL2, 100 MM HEPES, PH 6.9
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.239 |
| 1BV8 RECEPTOR DOMAIN FROM ALPHA-2-MACROGLOBULIN 提交 1998-09-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1337–1474（138 aa）
片段：RECEPTOR BINDING DOMAIN
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.1；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.4；压力 1
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分辨率未提供 |
| 2P9R Human alpha2-macroglogulin is composed of multiple domains, as predicted by homology with complement component C3 提交 2007-03-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
126–227（102 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；295 K；11% PEG 3350, 200mM di-ammonium hydrogen citrate, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.281 |
| 2P9R Human alpha2-macroglogulin is composed of multiple domains, as predicted by homology with complement component C3 提交 2007-03-26 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
126–227（102 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；295 K；11% PEG 3350, 200mM di-ammonium hydrogen citrate, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.281 |
| 6TAV Crystal structure of endopeptidase-induced alpha2-macroglobulin 提交 2019-10-30 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1474（1474 aa）
链 B
1–1474（1474 aa）
链 C
1–1474（1474 aa）
链 D
1–1474（1474 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Equivolumetric drops consisting of 0.2M tribasic ammonium citrate, pH6.4, 15% (w/v) polyethylene glycol 3350, plus 0.05M sodium fluoride as an additive, and protein solution at 4.9 absorption units at lambda=280nm yielded a single large well-shaped monocrystal after several months. This crystal could not be reproduced despite extensive trials.
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分辨率 4.20 Å R-free 0.282 |
| 7O7L (h-alpha2M)4 native I 提交 2021-04-13 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1474（1474 aa）
链 B
1–1474（1474 aa）
链 C
1–1474（1474 aa）
链 D
1–1474（1474 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7O7M (h-alpha2M)4 native II 提交 2021-04-13 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1474（1474 aa）
链 B
1–1474（1474 aa）
链 C
1–1474（1474 aa）
链 D
1–1474（1474 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.60 Å |
| 7O7N (h-alpha2M)4 semiactivated I state 提交 2021-04-13 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1474（1474 aa）
链 B
1–1474（1474 aa）
链 C
1–1474（1474 aa）
链 D
1–1474（1474 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 26 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.30 Å |
| 7O7O (h-alpha2M)4 semiactivated II state 提交 2021-04-13 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1474（1474 aa）
链 B
1–1474（1474 aa）
链 C
1–1474（1474 aa）
链 D
1–1474（1474 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 18 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 7O7P (h-alpha2M)4 activated state 提交 2021-04-13 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1474（1474 aa）
链 B
1–1474（1474 aa）
链 C
1–1474（1474 aa）
链 D
1–1474（1474 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 7O7Q (h-alpha2M)4 trypsin-activated state 提交 2021-04-13 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1474（1474 aa）
链 B
1–1474（1474 aa）
链 C
1–1474（1474 aa）
链 D
1–1474（1474 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 7O7R (h-alpha2M)4 plasmin-activated I state 提交 2021-04-13 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1474（1474 aa）
链 B
1–1474（1474 aa）
链 C
1–1474（1474 aa）
链 D
1–1474（1474 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 7O7S (h-alpha2M)4 plasmin-activated II state 提交 2021-04-13 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1474（1474 aa）
链 B
1–1474（1474 aa）
链 C
1–1474（1474 aa）
链 D
1–1474（1474 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.30 Å |
| 7VON Native alpha-2-macroglobulin monomer 提交 2021-10-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
27–1468（1442 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.20 Å |
| 7VOO Induced alpha-2-macroglobulin monomer 提交 2021-10-14 | Assembly 1 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
27–1335（1309 aa）
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |