当前蛋白身份：P01344
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1IGL SOLUTION STRUCTURE OF HUMAN INSULIN-LIKE GROWTH FACTOR II RELATIONSHIP TO RECEPTOR AND BINDING PROTEIN INTERACTIONS 提交 1994-12-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
25–91（67 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 2L29 Complex structure of E4 mutant human IGF2R domain 11 bound to IGF-II 提交 2010-08-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
25–91（67 aa）
片段：residues 25-91
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 4.2；310 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.5-1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] IGF2R, 1.-1.5 mM IGF2, 5 % D2O, 100 uM sodium azide, 5 mM sodium acetate, 0.1 mM EDTA, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.5-1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] IGF2, 1.-1.5 mM IGF2R, 5 % D2O, 100 uM sodium azide, 5 mM sodium acetate, 0.1 mM EDTA, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.5-1 mM [U-98% 15N; U-95% 2H] IGF2, 1.-1.5 mM IGF2R, 5 % D2O, 100 uM sodium azide, 5 mM sodium acetate, 0.1 mM EDTA, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2V5P COMPLEX STRUCTURE OF HUMAN IGF2R DOMAINS 11-13 BOUND TO IGF-II 提交 2007-07-06 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
25–91（67 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9；0.1 M TRIS-HCL PH 9.0, 15% (V/V) MPD
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分辨率 4.10 Å R-free 0.327 |
| 2V5P COMPLEX STRUCTURE OF HUMAN IGF2R DOMAINS 11-13 BOUND TO IGF-II 提交 2007-07-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
25–91（67 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9；0.1 M TRIS-HCL PH 9.0, 15% (V/V) MPD
|
分辨率 4.10 Å R-free 0.327 |
| 3E4Z Crystal structure of human insulin degrading enzyme in complex with insulin-like growth factor II 提交 2008-08-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
25–91（67 aa）
片段：UNP residues 25-91
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未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；10-13% PEG MME 5000, 100 mM HEPES pH 7.0, 4-14% Tacsimate, 10% dioxane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.230 |
| 3E4Z Crystal structure of human insulin degrading enzyme in complex with insulin-like growth factor II 提交 2008-08-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
25–91（67 aa）
片段：UNP residues 25-91
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；10-13% PEG MME 5000, 100 mM HEPES pH 7.0, 4-14% Tacsimate, 10% dioxane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.28 Å R-free 0.230 |
| 3KR3 Crystal structure of IGF-II antibody complex 提交 2009-11-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
25–91（67 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.3；293 K；18.5% PEG 6000, 118mM CaCl2, 10% (v/v) PCB buffer (propionate-cacodylate-bis-tris propane buffer), pH 5.3, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.251 |
| 5L3L D11 bound IGF-II 提交 2016-05-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
25–91（67 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 4.2；308 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR样品组成
20 uM d4 acetic acid, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 5L3M D11 bound [S39_PQ]-IGF-II 提交 2016-05-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
25–91（67 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 4.2；308 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR样品组成
20 mM d4 acetic acid, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 5L3N D11 bound [N29, S39_PQ]-IGF-II 提交 2016-05-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
25–91（67 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 4.2；308 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR样品组成
20 mM d4 acetic acid, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6UM2 Structure of M-6-P/IGFII Receptor and IGFII complex 提交 2019-10-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
25–91（67 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.32 Å |
| 6VWG Head region of the open conformation of the human type 1 insulin-like growth factor receptor ectodomain in complex with human insulin-like growth factor II. 提交 2020-02-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
25–91（67 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.21 Å |
| 6VWI Head region of the closed conformation of the human type 1 insulin-like growth factor receptor ectodomain in complex with human insulin-like growth factor II. 提交 2020-02-19 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 I
25–91（67 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 8U4C Cryo-EM structure of long form insulin receptor (IR-B) with four IGF2 bound, symmetric conformation. 提交 2023-09-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
1–180（180 aa）
链 D
1–180（180 aa）
链 E
1–180（180 aa）
链 F
1–180（180 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8U4E Cryo-EM structure of long form insulin receptor (IR-B) with three IGF2 bound, asymmetric conformation. 提交 2023-09-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
1–180（180 aa）
链 D
1–180（180 aa）
链 E
1–180（180 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 8VJB Cryo-EM structure of short form insulin receptor (IR-A) with four IGF2 bound, symmetric conformation. 提交 2024-01-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
1–180（180 aa）
链 D
1–180（180 aa）
链 E
1–180（180 aa）
链 F
1–180（180 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8VJC Cryo-EM structure of short form insulin receptor (IR-A) with three IGF2 bound, asymmetric conformation. 提交 2024-01-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
1–180（180 aa）
链 D
1–180（180 aa）
链 E
1–180（180 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8YSZ Cryo-EM structure of the complex IR with three IGF-II 提交 2024-03-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–180（180 aa）
链 D
1–180（180 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.38 Å |