当前蛋白身份：P01391
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CTX THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE-LONG-NEUROTOXIN FROM COBRA VENOM 提交 1982-04-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–71（71 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.80 Å |
| 1LXG Solution structure of alpha-cobratoxin complexed with a cognate peptide (structure ensemble) 提交 2002-06-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–71（71 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 4；308 K；压力 AMBIENT
NMR样品组成
1.6 mM alpha-cobratoxin/alpha18-mer complex, alpha18-mer is U-15N,
50 mM perdeuterated potassium acetate buffer (pH 4.0) with 5% D2O and 0.05% sodium azide | 95% H2O/5% D2O
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分辨率未提供 |
| 1LXH Solution structure of alpha-cobratoxin complexed with a cognate peptide (minimized average structure) 提交 2002-06-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–71（71 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 4；308 K；离子强度（mmCIF原始值）NULL；压力 AMBIENT
NMR样品组成
1.6 mM alpha-cobratoxin/alpha18-mer complex, alpha18-mer is U-15N, 50 mM perdeuterated potassium acetate buffer (pH 4.0) with 5% D2O and 0.05% sodium azide | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1YI5 Crystal structure of the a-cobratoxin-AChBP complex 提交 2005-01-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 F
1–71（71 aa）
链 G
1–71（71 aa）
链 H
1–71（71 aa）
链 I
1–71（71 aa）
链 J
1–71（71 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；0.9M NA-CITRATE, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
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分辨率 4.20 Å R-free 0.378 |
| 4AEA Dimeric alpha-cobratoxin X-ray structure: Localization of intermolecular disulfides and possible mode of binding to nicotinic acetylcholine receptors 提交 2012-01-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–71（71 aa）
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未记录 | GLY GLYCINE × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 2；60% (V/V) 2-METHYL-2,4- PENTANEDIOL, 0.1 M GLYCINE-HCL PH 2
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分辨率 1.94 Å R-free 0.251 |
| 4AEA Dimeric alpha-cobratoxin X-ray structure: Localization of intermolecular disulfides and possible mode of binding to nicotinic acetylcholine receptors 提交 2012-01-09 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–71（71 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 2；60% (V/V) 2-METHYL-2,4- PENTANEDIOL, 0.1 M GLYCINE-HCL PH 2
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.251 |
| 6ZFM Structure of alpha-Cobratoxin with a peptide inhibitor 提交 2020-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–71（71 aa）
链 B
1–71（71 aa）
链 D
1–71（71 aa）
链 E
1–71（71 aa）
|
未记录 | QJE 3-[2-[2-[2-[2-[2-(2-azanylethoxy)ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]propan-1-ol × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Carboxylic acids (sodium formate / ammonium acetate / sodium citrate / sodium potassium tartrate / sodium oxamate), 0.1 M HEPES / MOPS pH7.5, 30.0 % v/v PEG 500 MME / PEG 20000
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分辨率 1.90 Å R-free 0.230 |
| 7PC0 GABA-A receptor bound by a-Cobratoxin 提交 2021-08-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 K
1–71（71 aa）
链 L
1–71（71 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 HSM HISTAMINE × 1 ZN ZINC ION × 1 HEX HEXANE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.00 Å |
| 7ULG recombinant alpha cobra toxin 提交 2022-04-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–71（71 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；291.15 K；110 mg/ml in 200 mM NH4Ac (pH 7.0/25 DC), 1:1 with 0.1 M HEPES (pH 7.9), 30% Jeffamine M-600 (pH 7.0), 18 DC
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.181 |
| 7ULG recombinant alpha cobra toxin 提交 2022-04-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–71（71 aa）
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未记录 | EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；291.15 K；110 mg/ml in 200 mM NH4Ac (pH 7.0/25 DC), 1:1 with 0.1 M HEPES (pH 7.9), 30% Jeffamine M-600 (pH 7.0), 18 DC
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.181 |
| 7ULG recombinant alpha cobra toxin 提交 2022-04-04 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–71（71 aa）
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未记录 | ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；291.15 K；110 mg/ml in 200 mM NH4Ac (pH 7.0/25 DC), 1:1 with 0.1 M HEPES (pH 7.9), 30% Jeffamine M-600 (pH 7.0), 18 DC
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.181 |
| 7ULG recombinant alpha cobra toxin 提交 2022-04-04 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–71（71 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；291.15 K；110 mg/ml in 200 mM NH4Ac (pH 7.0/25 DC), 1:1 with 0.1 M HEPES (pH 7.9), 30% Jeffamine M-600 (pH 7.0), 18 DC
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.181 |
| 9BK5 Structure of LNG binder complex 提交 2024-04-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–71（71 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；1.5 M Ammonium Sulfate and 25% (v/v) glycerol
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分辨率 2.68 Å R-free 0.268 |
| 9FYT mAbs in complex with cobratoxin at pH 4.5 提交 2024-07-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–71（71 aa）
链 B
1–71（71 aa）
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未记录 | CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 5 SO4 SULFATE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293 K；0.1 M Bis-Tris pH 6.5, 0.2 M Ammonium Sulfate, 25% PEG 3350
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.237 |
| 9GCN Co-crystal VHH (TPL1158_01_C09) - alpha-cobratoxin (Naja kaouthia) 提交 2024-08-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Z
1–71（71 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；1.5 mM Tris and 6.5 mM NaCl, 17% (w/v) PEG1500.
20% (v/v) glycerol as cryopreservative.
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分辨率 3.00 Å R-free 0.292 |
| 9GCN Co-crystal VHH (TPL1158_01_C09) - alpha-cobratoxin (Naja kaouthia) 提交 2024-08-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Y
1–71（71 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；1.5 mM Tris and 6.5 mM NaCl, 17% (w/v) PEG1500.
20% (v/v) glycerol as cryopreservative.
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.292 |
| 9GCN Co-crystal VHH (TPL1158_01_C09) - alpha-cobratoxin (Naja kaouthia) 提交 2024-08-02 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 V
1–71（71 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；1.5 mM Tris and 6.5 mM NaCl, 17% (w/v) PEG1500.
20% (v/v) glycerol as cryopreservative.
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.292 |
| 9GCN Co-crystal VHH (TPL1158_01_C09) - alpha-cobratoxin (Naja kaouthia) 提交 2024-08-02 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 X
1–71（71 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；1.5 mM Tris and 6.5 mM NaCl, 17% (w/v) PEG1500.
20% (v/v) glycerol as cryopreservative.
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分辨率 3.00 Å R-free 0.292 |
| 9HUO A01 mAbs bound to cobratoxin at pH 5.5 提交 2024-12-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–71（71 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；25% PEG3350, 0.1M Bis-Tris pH5.5, 0.25 M AmS
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分辨率 1.60 Å R-free 0.225 |
| 9HUO A01 mAbs bound to cobratoxin at pH 5.5 提交 2024-12-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–71（71 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 3 NA SODIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；25% PEG3350, 0.1M Bis-Tris pH5.5, 0.25 M AmS
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.225 |
| 9HXO A01 mAbs bound to cobratoxin at pH 6.0 提交 2025-01-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–71（71 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；25% PEG3350, 0.1M Bis-Tris pH 6.0, 0.3 M Ammonium Sulphate
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分辨率 1.49 Å R-free 0.248 |
| 9HXO A01 mAbs bound to cobratoxin at pH 6.0 提交 2025-01-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–71（71 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；25% PEG3350, 0.1M Bis-Tris pH 6.0, 0.3 M Ammonium Sulphate
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分辨率 1.49 Å R-free 0.248 |