当前蛋白身份：P01871
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2AGJ Crystal Structure of a glycosylated Fab from an IgM cryoglobulin with properties of a natural proteolytic antibody 提交 2005-07-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
1–183（183 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 15000-20000, sodium chloride, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.279 |
| 6KXS Cryo-EM structure of human IgM-Fc in complex with the J chain and the ectodomain of pIgR 提交 2019-09-12 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
106–453（348 aa）
链 B
106–453（348 aa）
链 C
106–453（348 aa）
链 D
106–453（348 aa）
链 E
106–453（348 aa）
链 F
106–453（348 aa）
链 G
106–453（348 aa）
链 H
106–453（348 aa）
链 K
106–453（348 aa）
链 L
106–453（348 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7K0C Structure of Secretory IgM Core 提交 2020-09-04 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
103–453（351 aa）
链 B
103–453（351 aa）
链 E
103–453（351 aa）
链 F
103–453（351 aa）
链 G
103–453（351 aa）
链 H
103–453（351 aa）
链 I
103–453（351 aa）
链 J
103–453（351 aa）
链 K
103–453（351 aa）
链 L
103–453（351 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 3.5 seconds before plunging with blot force 7.
|
分辨率 3.30 Å |
| 7WSP Structure of a membrane protein M 提交 2022-01-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
106–471（366 aa）
链 D
106–472（367 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 4.09 Å |
| 7Y09 Cryo-EM structure of human IgM-Fc in complex with the J chain and the DBL domain of DBLMSP 提交 2022-06-03 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
106–453（348 aa）
链 B
106–453（348 aa）
链 C
106–453（348 aa）
链 D
106–453（348 aa）
链 E
106–453（348 aa）
链 F
106–453（348 aa）
链 G
106–453（348 aa）
链 H
106–453（348 aa）
链 K
106–453（348 aa）
链 L
106–453（348 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.71 Å |
| 7Y0H Cryo-EM structure of human IgM-Fc in complex with the J chain and the P. falciparum VAR2CSA FCR3 提交 2022-06-05 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
106–453（348 aa）
链 B
106–453（348 aa）
链 C
106–453（348 aa）
链 D
106–453（348 aa）
链 E
106–453（348 aa）
链 F
106–453（348 aa）
链 G
106–453（348 aa）
链 H
106–453（348 aa）
链 K
106–453（348 aa）
链 L
106–453（348 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.56 Å |
| 7Y0J Cryo-EM structure of human IgM-Fc in complex with the J chain and the P. falciparum TM284VAR1 提交 2022-06-05 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
106–453（348 aa）
链 B
106–453（348 aa）
链 C
106–453（348 aa）
链 D
106–453（348 aa）
链 E
106–453（348 aa）
链 F
106–453（348 aa）
链 G
106–453（348 aa）
链 H
106–453（348 aa）
链 K
106–453（348 aa）
链 L
106–453（348 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.62 Å |
| 7YG2 Cryo-EM structure of human IgM-Fc in complex with the J chain and the DBL domain of DBLMSP2 提交 2022-07-09 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
106–453（348 aa）
链 B
106–453（348 aa）
链 C
106–453（348 aa）
链 D
106–453（348 aa）
链 E
106–453（348 aa）
链 F
106–453（348 aa）
链 G
106–453（348 aa）
链 H
106–453（348 aa）
链 K
106–453（348 aa）
链 L
106–453（348 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.32 Å |
| 7YSG Cryo-EM structure of human FcmR bound to sIgM 提交 2022-08-12 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
222–453（232 aa）
链 B
222–453（232 aa）
链 C
222–453（232 aa）
链 D
222–453（232 aa）
链 E
222–453（232 aa）
链 F
222–453（232 aa）
链 G
222–453（232 aa）
链 H
222–453（232 aa）
链 K
222–453（232 aa）
链 L
222–453（232 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.18 Å |
| 7YTC Cryo-EM structure of human FcmR bound to IgM-Fc/J 提交 2022-08-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
222–453（232 aa）
链 B
222–453（232 aa）
链 C
222–453（232 aa）
链 D
222–453（232 aa）
链 E
222–453（232 aa）
链 F
222–453（232 aa）
链 G
222–453（232 aa）
链 H
222–453（232 aa）
链 K
222–453（232 aa）
链 L
222–453（232 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 11 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å |
| 7YTD Cryo-EM structure of four human FcmR bound to IgM-Fc/J 提交 2022-08-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 A
222–452（231 aa）
链 B
222–452（231 aa）
链 C
222–452（231 aa）
链 D
222–452（231 aa）
链 E
222–452（231 aa）
链 F
222–452（231 aa）
链 G
222–452（231 aa）
链 H
222–452（231 aa）
链 K
222–452（231 aa）
链 L
222–452（231 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.71 Å |
| 8GZN IgM-var2CSA complex 提交 2022-09-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致 |
链 A
1–453（453 aa）
链 B
1–453（453 aa）
链 C
1–453（453 aa）
链 D
1–453（453 aa）
链 E
1–453（453 aa）
链 F
1–453（453 aa）
链 G
1–453（453 aa）
链 H
1–453（453 aa）
链 K
1–453（453 aa）
链 L
1–453（453 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8WYR Cryo-EM structure of human CD5L bound to IgM-Fc/J 提交 2023-10-31 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
106–453（348 aa）
链 B
106–453（348 aa）
链 C
106–453（348 aa）
链 D
106–453（348 aa）
链 E
106–453（348 aa）
链 F
106–453（348 aa）
链 G
106–453（348 aa）
链 H
106–453（348 aa）
链 K
106–453（348 aa）
链 L
106–453（348 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 CA CALCIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å |
| 8WYS Local map of human CD5L bound to IgM-Fc/J 提交 2023-10-31 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
106–453（348 aa）
链 L
106–453（348 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.41 Å |
| 9ARV CryoEM structure of AMETA-A3 提交 2024-02-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 A
106–453（348 aa）
链 B
106–453（348 aa）
链 C
106–453（348 aa）
链 D
106–453（348 aa）
链 E
106–453（348 aa）
链 L
106–453（348 aa）
链 M
106–453（348 aa）
链 N
106–453（348 aa）
链 O
106–453（348 aa）
链 P
106–453（348 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9UO3 Cryo-EM structure of the human IgM-Fc hexamer 提交 2025-04-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
106–446（341 aa）
链 B
106–446（341 aa）
链 C
106–446（341 aa）
链 D
106–446（341 aa）
链 E
106–446（341 aa）
链 F
106–446（341 aa）
链 G
106–446（341 aa）
链 H
106–446（341 aa）
链 I
106–446（341 aa）
链 J
106–446（341 aa）
链 K
106–446（341 aa）
链 L
106–446（341 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.17 Å |
| 9UO4 Cryo-EM structure of the chimeric human IgM-Fc hexamer 提交 2025-04-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
106–433（328 aa）
链 B
106–433（328 aa）
链 C
106–433（328 aa）
链 D
106–433（328 aa）
链 E
106–433（328 aa）
链 F
106–433（328 aa）
链 G
106–433（328 aa）
链 H
106–433（328 aa）
链 I
106–433（328 aa）
链 J
106–433（328 aa）
链 K
106–433（328 aa）
链 L
106–433（328 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å |