当前蛋白身份：P01902
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1VGK The crystal structure of class I Major histocompatibility complex, H-2Kd at 2.0 A resolution 提交 2004-04-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
22–295（274 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；PEG 2000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.240 |
| 2FWO MHC Class I H-2Kd heavy chain in complex with beta-2microglobulin and peptide derived from influenza nucleoprotein 提交 2006-02-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
22–304（283 aa）
片段：Extracellular domains
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；100 mM HEPES, 12% (w:v) PEG2000, 5% (w:v) MPD, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.269 |
| 4Z76 Weak TCR binding to an unstable insulin epitope drives type 1 diabetes 提交 2015-04-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
22–296（275 aa）
片段：UNP residues 22-296
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；291 K；G9V crystals were grown in 20% PEG 6000, 0.2 M calcium chloride, 0.1 M Tris propane pH 8.0
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.230 |
| 4Z76 Weak TCR binding to an unstable insulin epitope drives type 1 diabetes 提交 2015-04-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
22–296（275 aa）
片段：UNP residues 22-296
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；291 K；G9V crystals were grown in 20% PEG 6000, 0.2 M calcium chloride, 0.1 M Tris propane pH 8.0
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.230 |
| 4Z77 Weak TCR binding to an unstable insulin epitope drives type 1 diabetes 提交 2015-04-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
22–296（275 aa）
片段：UNP residues 22-296
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 15P POLYETHYLENE GLYCOL (N=34) × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；291 K；20% PEG 6000, 0.2 M calcium chloride, 0.1 M Tris propane pH 8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.253 |
| 4Z77 Weak TCR binding to an unstable insulin epitope drives type 1 diabetes 提交 2015-04-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
22–296（275 aa）
片段：UNP residues 22-296
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 15P POLYETHYLENE GLYCOL (N=34) × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；291 K；20% PEG 6000, 0.2 M calcium chloride, 0.1 M Tris propane pH 8.0
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.253 |
| 4Z78 Weak TCR binding to an unstable insulin epitope drives type 1 diabetes 提交 2015-04-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
22–296（275 aa）
片段：UNP residues 22-296
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；291 K；4% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate pH 4.6
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.233 |
| 4Z78 Weak TCR binding to an unstable insulin epitope drives type 1 diabetes 提交 2015-04-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
22–296（275 aa）
片段：UNP residues 22-296
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；291 K；4% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate pH 4.6
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.233 |
| 4Z78 Weak TCR binding to an unstable insulin epitope drives type 1 diabetes 提交 2015-04-06 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 G
22–296（275 aa）
片段：UNP residues 22-296
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；291 K；4% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate pH 4.6
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.233 |
| 5GR7 Mouse MHC class I H-2Kd with a MERS-CoV-derived peptide 37-1 提交 2016-08-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
22–295（274 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.5, 16% w/v Polyethylene glycol 8000
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.257 |
| 5GSB Mouse MHC class I H-2Kd with a MERS-CoV-derived peptide 37-3 提交 2016-08-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
22–295（274 aa）
片段：UNP RESIDUES 22-295
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.5 , 16% w v Polyethylene glycol 8000
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.222 |
| 5GSR Mouse MHC class I H-2Kd with a MERS-CoV-derived peptide I5A 提交 2016-08-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
22–295（274 aa）
片段：UNP RESIDUES 22-295
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium HEPES 7.5, 30 % v/v 2-Propanol
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.231 |
| 5GSR Mouse MHC class I H-2Kd with a MERS-CoV-derived peptide I5A 提交 2016-08-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
22–295（274 aa）
片段：UNP RESIDUES 22-295
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Sodium HEPES 7.5, 30 % v/v 2-Propanol
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.231 |
| 5GSV Mouse MHC class I H-2Kd with a MERS-CoV-derived peptide 142-5 提交 2016-08-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
22–295（274 aa）
片段：UNP RESIDUES 22-295
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；291 K；0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% w/v Polyethylene glycol 6000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.252 |
| 5GSX Mouse MHC class I H-2Kd with a MERS-CoV-derived peptide 142-2 提交 2016-08-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
22–295（274 aa）
片段：UNP RESIDUES 22-295
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；291 K；0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% w/v Polyethylene glycol 6000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.242 |
| 5GSX Mouse MHC class I H-2Kd with a MERS-CoV-derived peptide 142-2 提交 2016-08-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
22–295（274 aa）
片段：UNP RESIDUES 22-295
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；291 K；0.1M Sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.0, 10% w/v Polyethylene glycol 6000
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.242 |
| 5TRZ Crystal structure of MHC-I H2-KD complexed with peptides of Mycobacterial tuberculosis (YQSGLSIVM) 提交 2016-10-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
23–297（275 aa）
片段：UNP residues 23-297
链 C
23–297（275 aa）
片段：UNP residues 23-297
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14% PEG 4000, 0.1M MES buffer, 5% MPD
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.198 |
| 5TS1 Crystal structure of MHC-I H2-KD complexed with peptides of Mycobacterial tuberculosis (YYQSGLSIV) 提交 2016-10-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
23–297（275 aa）
片段：UNP residues 23-297
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14% PEG 4000, 0.1M MES buffer, 5% MPD
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.224 |
| 5TS1 Crystal structure of MHC-I H2-KD complexed with peptides of Mycobacterial tuberculosis (YYQSGLSIV) 提交 2016-10-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
23–297（275 aa）
片段：UNP residues 23-297
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14% PEG 4000, 0.1M MES buffer, 5% MPD
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.224 |
| 5TS1 Crystal structure of MHC-I H2-KD complexed with peptides of Mycobacterial tuberculosis (YYQSGLSIV) 提交 2016-10-27 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
23–297（275 aa）
片段：UNP residues 23-297
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14% PEG 4000, 0.1M MES buffer, 5% MPD
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.224 |
| 5TS1 Crystal structure of MHC-I H2-KD complexed with peptides of Mycobacterial tuberculosis (YYQSGLSIV) 提交 2016-10-27 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 G
23–297（275 aa）
片段：UNP residues 23-297
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；14% PEG 4000, 0.1M MES buffer, 5% MPD
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.224 |
| 6E1I HLA-A*0201 single chain trimer with murine H2K alpha 3 domain and HPV.16 E7 peptide YMLDLQPET 提交 2018-07-09 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
205–295（91 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M Hepes, 25% PEG 6000
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分辨率 1.99 Å R-free 0.233 |
| 8D5K The complex of Pre-mRNA-Processing Factor 19 (Prpf19) peptide KYLQVASHV Presented by H2-Kd 提交 2022-06-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
22–295（274 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277.15 K；10% w/v PEG8000, 200 mM magnesium acetate
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分辨率 2.07 Å R-free 0.234 |