当前蛋白身份：P02633
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1B1G SOLVATED REFINEMENT OF CA-LOADED CALBINDIN D9K 提交 1998-11-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4–78（75 aa）
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突变：P43G | CA CALCIUM ION × 2 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1BOC THE SOLUTION STRUCTURES OF MUTANT CALBINDIN D9K'S, AS DETERMINED BY NMR, SHOW THAT THE CALCIUM BINDING SITE CAN ADOPT DIFFERENT FOLDS 提交 1993-04-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4–78（75 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1BOD THE SOLUTION STRUCTURES OF MUTANT CALBINDIN D9K'S, AS DETERMINED BY NMR, SHOW THAT THE CALCIUM BINDING SITE CAN ADOPT DIFFERENT FOLDS 提交 1993-04-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4–78（75 aa）
|
突变：A15D,P20G,P43M | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1CDN Solution structure of (CD2+)1-calbindin D9K reveals details of the stepwise structural changes along the apo--> (CA2+)II1--> (CA2+)I,II2 binding pathway 提交 1995-08-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4–78（75 aa）
|
突变：INS(MET 1), P43G | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1CLB Determination of the solution structure of apo calbindin D9K by nmr spectroscopy 提交 1995-02-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4–78（75 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1D1O COOPERATIVITY IN EF-HAND CA2+-BINDING PROTEINS: EVIDENCE OF SITE-SITE COMMUNICATION FROM BINDING-INDUCED CHANGES IN STRUCTURE AND DYNAMICS OF N56A CALBINDIN D9K 提交 1999-09-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5–79（75 aa）
片段：CALBINDIN D9K
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突变：P43M, N56A | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 AMBIENT
NMR测量条件
pH 6；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 AMBIENT
NMR样品组成
4 MM N56A-CALBINDIN D9K
NMR样品组成
4 MM 15N-LABELED N56A-CALBINDIN D9K;
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分辨率未提供 |
| 1HT9 DOMAIN SWAPPING EF-HANDS 提交 2000-12-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
4–78（75 aa）
链 B
4–78（75 aa）
|
突变：YES 突变：YES | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；293 K；ammonium sulphate, calcium chloride, magnesium chloride, EVAPORATION, temperature 293K
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分辨率 1.76 Å R-free 0.192 |
| 1IG5 BOVINE CALBINDIN D9K BINDING MG2+ 提交 2001-04-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4–78（75 aa）
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.4；298 K；3M ammonium sulphate, 100 mM magnesium chloride, pH 6.4, EVAPORATION, temperature 298K
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分辨率 1.50 Å R-free 0.285 |
| 1IGV BOVINE CALBINDIN D9K BINDING MN2+ 提交 2001-04-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4–78（75 aa）
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未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.6；295 K；65 % ammonium sulphate, 600 mM MnCl2, pH 5.6, EVAPORATION, temperature 295K
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分辨率 1.85 Å R-free 0.272 |
| 1KCY NMR solution structure of apo calbindin D9k (F36G + P43M mutant) 提交 2001-11-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4–78（75 aa）
片段：contains EF-HAND 1 (LOW AFFINITY) and EF-HAND 2 (HIGH AFFINITY)
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突变：F36G, P43M | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；300 K；离子强度（mmCIF原始值）no added salts；压力 ambient
NMR样品组成
2.5 mM calbindin; 95% H2O; 5% D2O | 95% H20; 5% D2O
NMR样品组成
2.5 mM calbindin D9k U-15N; 95% H2O; 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
2.5 mM calbindin D9k; 100% D20 | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1KQV Family of NMR Solution Structures of Ca Ln Calbindin D9K 提交 2002-01-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
0–78（79 aa）
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突变：P43M | LA LANTHANUM (III) ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；300 K；离子强度（mmCIF原始值）water solution；压力 1
NMR测量条件
pH 6；283 K；离子强度（mmCIF原始值）water solution；压力 1
NMR样品组成
2.0 mM Ca Ln Cb | H2O/D2O 10:1
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分辨率未提供 |
| 1KSM AVERAGE NMR SOLUTION STRUCTURE OF CA LN CALBINDIN D9K 提交 2002-01-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
0–78（79 aa）
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突变：P43M | LA LANTHANUM (III) ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；300 K；离子强度（mmCIF原始值）WATER SOLUTION；压力 AMBIENT
NMR样品组成
1.5 MM [15N, 13C] - CA LN CALBINDIN, PH 6.0 | H20:D2O 90:10
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分辨率未提供 |
| 1N65 FAMILY OF NMR SOLUTION STRUCTURES OF CA CE CALBINDIN D9K IN DENATURATING CONDITIONS 提交 2002-11-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4–78（75 aa）
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突变：P43M | CE CERIUM (III) ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）2M Guanidinium Chloride (GmdHCl)；压力 1
NMR测量条件
pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）pure water；压力 1
NMR样品组成
Uniform labeling with 15N, H2O/D20 90/10 | H2O/D20 90/10
Denaturating Conditions
NMR样品组成
Uniform labeling with 15N, H2O/D20 90/10 | H2O/D20 90/10
|
分辨率未提供 |
| 1QX2 X-ray Structure of Calcium-loaded Calbindomodulin (A Calbindin D9k Re-engineered to Undergo a Conformational Opening) at 1.44 A Resolution 提交 2003-09-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4–78（75 aa）
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突变：L6I, I9A, K12V, Y13F, L23I, L31V, L32M, E35L, F36G, L49M, F50I, L53V, Q67L, L69M, V70M, P43M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；PEG 550 MME, MES, zinc sulfate, Tris-HCl, sodium chloride, calcium chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.194 |
| 1QX2 X-ray Structure of Calcium-loaded Calbindomodulin (A Calbindin D9k Re-engineered to Undergo a Conformational Opening) at 1.44 A Resolution 提交 2003-09-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
4–78（75 aa）
|
突变：L6I, I9A, K12V, Y13F, L23I, L31V, L32M, E35L, F36G, L49M, F50I, L53V, Q67L, L69M, V70M, P43M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；PEG 550 MME, MES, zinc sulfate, Tris-HCl, sodium chloride, calcium chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.194 |
| 1QX2 X-ray Structure of Calcium-loaded Calbindomodulin (A Calbindin D9k Re-engineered to Undergo a Conformational Opening) at 1.44 A Resolution 提交 2003-09-04 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
4–78（75 aa）
链 B
4–78（75 aa）
|
突变：L6I, I9A, K12V, Y13F, L23I, L31V, L32M, E35L, F36G, L49M, F50I, L53V, Q67L, L69M, V70M, P43M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：L6I, I9A, K12V, Y13F, L23I, L31V, L32M, E35L, F36G, L49M, F50I, L53V, Q67L, L69M, V70M, P43M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；PEG 550 MME, MES, zinc sulfate, Tris-HCl, sodium chloride, calcium chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.194 |
| 1QX2 X-ray Structure of Calcium-loaded Calbindomodulin (A Calbindin D9k Re-engineered to Undergo a Conformational Opening) at 1.44 A Resolution 提交 2003-09-04 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
4–78（75 aa）
链 B
4–78（75 aa）
|
突变：L6I, I9A, K12V, Y13F, L23I, L31V, L32M, E35L, F36G, L49M, F50I, L53V, Q67L, L69M, V70M, P43M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：L6I, I9A, K12V, Y13F, L23I, L31V, L32M, E35L, F36G, L49M, F50I, L53V, Q67L, L69M, V70M, P43M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；PEG 550 MME, MES, zinc sulfate, Tris-HCl, sodium chloride, calcium chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.194 |
| 1QX2 X-ray Structure of Calcium-loaded Calbindomodulin (A Calbindin D9k Re-engineered to Undergo a Conformational Opening) at 1.44 A Resolution 提交 2003-09-04 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
4–78（75 aa）
链 B
4–78（75 aa）
|
突变：L6I, I9A, K12V, Y13F, L23I, L31V, L32M, E35L, F36G, L49M, F50I, L53V, Q67L, L69M, V70M, P43M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：L6I, I9A, K12V, Y13F, L23I, L31V, L32M, E35L, F36G, L49M, F50I, L53V, Q67L, L69M, V70M, P43M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；PEG 550 MME, MES, zinc sulfate, Tris-HCl, sodium chloride, calcium chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.44 Å R-free 0.194 |
| 1RT0 12-mer from site II calbindin D9K (DKNGDGEVSFEE) coordinating Zn(II) 提交 2003-12-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
57–68（12 aa）
片段：residues 57-68 (SWS P02632)
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；288 K；离子强度（mmCIF原始值）aprox 0；压力 ambient
NMR样品组成
3mM Peptide and Zn(NO3)2. NaOH and HNO3 added for pH fixing to 7; 80% H2O, 20% D2O | 80% H2O, 20% D2O
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分辨率未提供 |
| 2BCA HIGH-RESOLUTION SOLUTION STRUCTURE OF CALCIUM-LOADED CALBINDIN D9K 提交 1993-08-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4–78（75 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 2BCB HIGH-RESOLUTION SOLUTION STRUCTURE OF CALCIUM-LOADED CALBINDIN D9K 提交 1993-08-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4–78（75 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 2MAZ Backbone 1H, 13C, and 15N Chemical Shift Assignments for Bovine Apo Calbindin 提交 2013-07-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
5–79（75 aa）
片段：UNP residues 5-79
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突变：P43M | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 ambient
NMR样品组成
1mM [U-100% 13C; U-100% 15N] D2O-1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
| 3ICB THE REFINED STRUCTURE OF VITAMIN D-DEPENDENT CALCIUM-BINDING PROTEIN FROM BOVINE INTESTINE. MOLECULAR DETAILS, ION BINDING, AND IMPLICATIONS FOR THE STRUCTURE OF OTHER CALCIUM-BINDING PROTEINS 提交 1986-09-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4–78（75 aa）
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未记录 | CA CALCIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å |
| 4ICB PROLINE CIS-TRANS ISOMERS IN CALBINDIN D9K OBSERVED BY X-RAY CRYSTALLOGRAPHY 提交 1991-08-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
4–78（75 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.60 Å |