当前蛋白身份：P02743
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1GYK Serum Amyloid P Component co-crystallised with MOBDG at neutral pH 提交 2002-04-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
20–223（204 aa）
链 B
20–223（204 aa）
链 C
20–223（204 aa）
链 D
20–223（204 aa）
链 E
20–223（204 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 9 CDG METHYL 4,6-O-[(1R)-1-CARBOXYETHYLIDENE]-BETA-D-GALACTOPYRANOSIDE × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；pH 8.00
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.224 |
| 1LGN DECAMERIC DAMP COMPLEX OF HUMAN SERUM AMYLOID P COMPONENT 提交 1996-12-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
20–223（204 aa）
链 B
20–223（204 aa）
链 C
20–223（204 aa）
链 D
20–223（204 aa）
链 E
20–223（204 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 10 D5M 2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；3 + 3 UL HANGING DROPS AT 277K PROTEIN SOLUTION: 20 MG/ML PROTEIN, 10 MM TRIS-HCL, PH 8.0, 140 MM NACL, 20 MM DAMP, 0.02 % NA-AZIDE. RESERVOIR SOLUTION: 100 MM BIS-TRIS PROPANE- HCL PH 8.0, 20 MM CALCIUM CHLORIDE, 12-14 % (W/V) POLYETHYLENEGLYCOL 4000., vapor diffusion - hanging drop
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.252 |
| 1SAC THE STRUCTURE OF PENTAMERIC HUMAN SERUM AMYLOID P COMPONENT 提交 1994-01-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
20–223（204 aa）
链 B
20–223（204 aa）
链 C
20–223（204 aa）
链 D
20–223（204 aa）
链 E
20–223（204 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 10 ACY ACETIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 2A3W Decameric structure of human serum amyloid P-component bound to Bis-1,2-{[(Z)-2-carboxy-2-methyl-1,3-dioxane]-5-yloxycarbamoyl}-ethane 提交 2005-06-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
20–223（204 aa）
链 B
20–223（204 aa）
链 C
20–223（204 aa）
链 D
20–223（204 aa）
链 E
20–223（204 aa）
链 F
20–223（204 aa）
链 G
20–223（204 aa）
链 H
20–223（204 aa）
链 I
20–223（204 aa）
链 J
20–223（204 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 20 CPJ BIS-1,2-{[(Z)-2-CARBOXY-2-METHYL-1,3-DIOXANE]-5-YLOXYCARBAMOYL}-ETHANE × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；294 K；PEG 4000, PEG 400, sodium acetate, calcium acetate, sorbitol, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.229 |
| 2A3W Decameric structure of human serum amyloid P-component bound to Bis-1,2-{[(Z)-2-carboxy-2-methyl-1,3-dioxane]-5-yloxycarbamoyl}-ethane 提交 2005-06-27 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 K
20–223（204 aa）
链 L
20–223（204 aa）
链 M
20–223（204 aa）
链 N
20–223（204 aa）
链 O
20–223（204 aa）
链 P
20–223（204 aa）
链 Q
20–223（204 aa）
链 R
20–223（204 aa）
链 S
20–223（204 aa）
链 T
20–223（204 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 20 CPJ BIS-1,2-{[(Z)-2-CARBOXY-2-METHYL-1,3-DIOXANE]-5-YLOXYCARBAMOYL}-ETHANE × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；294 K；PEG 4000, PEG 400, sodium acetate, calcium acetate, sorbitol, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.229 |
| 2A3X Decameric crystal structure of human serum amyloid P-component bound to Bis-1,2-{[(Z)-2carboxy- 2-methyl-1,3-dioxane]- 5-yloxycarbonyl}-piperazine 提交 2005-06-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
20–223（204 aa）
链 B
20–223（204 aa）
链 C
20–223（204 aa）
链 D
20–223（204 aa）
链 E
20–223（204 aa）
链 F
20–223（204 aa）
链 G
20–223（204 aa）
链 H
20–223（204 aa）
链 I
20–223（204 aa）
链 J
20–223（204 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 20 CPK BIS-1,2-{[(Z)-2CARBOXY-2-METHYL-1,3-DIOXANE]-5-YLOXYCARBONYL}-PIPERAZINE × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；294 K；sodium acetate, calcium acetate, PEG 8000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.282 |
| 2A3Y Pentameric crystal structure of human serum amyloid P-component bound to Bis-1,2-{[(Z)-2carboxy-2-methyl-1,3-dioxane]-5-yloxycarbamoyl}-ethane. 提交 2005-06-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
20–223（204 aa）
链 B
20–223（204 aa）
链 C
20–223（204 aa）
链 D
20–223（204 aa）
链 E
20–223（204 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 10 CPJ BIS-1,2-{[(Z)-2-CARBOXY-2-METHYL-1,3-DIOXANE]-5-YLOXYCARBAMOYL}-ETHANE × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；294 K；sodium actetate, calcium acetate, PEG 8000, PEG 400, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.250 |
| 2W08 The structure of serum amyloid P component bound to 0-phospho- threonine 提交 2008-08-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
20–223（204 aa）
链 B
20–223（204 aa）
链 C
20–223（204 aa）
链 D
20–223（204 aa）
链 E
20–223（204 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 TPO PHOSPHOTHREONINE × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；0.06M TRIS-HCL PH8, 16% PEG 550MME, 0.01M CACL2, 0.08M NACL, 0.1% NAN3, 14.2MG/ML PROTEIN, 50MM LIGAND
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.176 |
| 3D5O Structural recognition and functional activation of FcrR by innate pentraxins 提交 2008-05-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
20–223（204 aa）
链 B
20–223（204 aa）
链 C
20–223（204 aa）
链 D
20–223（204 aa）
链 E
20–223（204 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 16 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；2.0 M NH4SO4, 5% iso-propanol, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.279 |
| 3KQR The structure of serum amyloid p component bound to phosphoethanolamine 提交 2009-11-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
20–223（204 aa）
链 B
20–223（204 aa）
链 C
20–223（204 aa）
链 D
20–223（204 aa）
链 E
20–223（204 aa）
|
未记录 | OPE PHOSPHORIC ACID MONO-(2-AMINO-ETHYL) ESTER × 5 CA CALCIUM ION × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.06M TRIS-HCL pH8, 16% PEG 550MME, 0.01M CaCl2, 0.14M NaCl, 0.1% NaN3,14.2mg/ml Protein, 0.05M Ligand, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.161 |
| 4AVS Structure of N-Acetyl-L-Proline bound to Serum Amyloid P Component 提交 2012-05-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
20–223（204 aa）
链 B
20–223（204 aa）
链 C
20–223（204 aa）
链 D
20–223（204 aa）
链 E
20–223（204 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CA CALCIUM ION × 10 N7P 1-ACETYL-L-PROLINE × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；0.06 M TRIS-HCL, PH 8, 16% PEG 550 MME, 0.01 M CACL2, 0.08 M NACL AND 0.1% NAN3
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.170 |
| 4AVT Structure of CPHPC bound to Serum Amyloid P Component 提交 2012-05-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
20–223（204 aa）
链 C
20–223（204 aa）
链 E
20–223（204 aa）
链 G
20–223（204 aa）
链 I
20–223（204 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 GHE (2R)-1-[6-[(2R)-2-carboxypyrrolidin-1-yl]-6-oxidanylidene-hexanoyl]pyrrolidine-2-carboxylic acid × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.6；60MM TRIS-HCL, 80MM NACL, 15% PEG550 MME, pH 7.6
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.197 |
| 4AVT Structure of CPHPC bound to Serum Amyloid P Component 提交 2012-05-29 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
20–223（204 aa）
链 D
20–223（204 aa）
链 F
20–223（204 aa）
链 H
20–223（204 aa）
链 J
20–223（204 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 10 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 GHE (2R)-1-[6-[(2R)-2-carboxypyrrolidin-1-yl]-6-oxidanylidene-hexanoyl]pyrrolidine-2-carboxylic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.6；60MM TRIS-HCL, 80MM NACL, 15% PEG550 MME, pH 7.6
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.197 |
| 4AVV Structure of CPHPC bound to Serum Amyloid P Component 提交 2012-05-29 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
20–223（204 aa）
链 B
20–223（204 aa）
链 C
20–223（204 aa）
链 D
20–223（204 aa）
链 E
20–223（204 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 8 GHE (2R)-1-[6-[(2R)-2-carboxypyrrolidin-1-yl]-6-oxidanylidene-hexanoyl]pyrrolidine-2-carboxylic acid × 5 CD CADMIUM ION × 35 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 SIA N-acetyl-alpha-neuraminic acid × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.6；PH 4.6
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.175 |
| 4AYU Structure of N-Acetyl-D-Proline bound to serum amyloid P component 提交 2012-06-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
20–223（204 aa）
链 B
20–223（204 aa）
链 C
20–223（204 aa）
链 D
20–223（204 aa）
链 E
20–223（204 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 10 N8P N-ACETYL-D-PROLINE × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 GOL GLYCEROL × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；60 MM TRIS-HCL PH 8.0, 10 MM CACL2, 84 MM NACL, 20% GLYCEROL V/V, 17% PEG550 MME V/V
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分辨率 1.50 Å R-free 0.168 |