当前蛋白身份：P03072
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4LIF Crystal structure of the JCV large T-antigen origin binding domain 提交 2013-07-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
132–261（130 aa）
片段：OBD (unp residues 132-261)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；273 K；0.1 M Tris, 0.2 M LiSO4, 30 % Peg 4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 273K, pH 8.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.223 |
| 4LMD Crystal structure of the JCV large t-antigen origin binding domain 提交 2013-07-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
132–261（130 aa）
片段：Origin Binding Domain (unp residues 132-261)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M sodium citrate, 30 % Peg 3350, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.202 |
| 4LMD Crystal structure of the JCV large t-antigen origin binding domain 提交 2013-07-10 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
132–261（130 aa）
片段：Origin Binding Domain (unp residues 132-261)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 FLC CITRATE ANION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M sodium citrate, 30 % Peg 3350, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.202 |
| 4NBP Crystal structure of the JCV large T-antigen origin binding domain 提交 2013-10-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
132–261（130 aa）
片段：Origin Binding Domain
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未记录 | TLA L(+)-TARTARIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.19 M sodium tartrate, 19 % Peg 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.31 Å R-free 0.178 |
| 5CYN JC Virus large T-antigen origin binding domain F258L mutant 提交 2015-07-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
132–261（130 aa）
片段：unp residues 132-261
|
突变：F258L | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris pH 8.5, 25-35% Peg 6000
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分辨率 2.70 Å R-free 0.227 |
| 5J40 The X-ray structure of JCV Helicase 提交 2016-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
261–628（368 aa）
片段：UNP residues 261-628
|
突变：E280A, D295N, N299A, Q301A, Q302A, K304A, K305A, E307A, K308A, K309A, I354L, D408E, R624A | ZN ZINC ION × 6 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 6 SO4 SULFATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；25-30% Peg400, 0.1 M LiSO4, 0.1M HEPES (pH 7.0), 0.2 M NaCl
|
分辨率 2.17 Å R-free 0.228 |
| 5J47 The X-ray structure of Inhibitor Bound to JCV Helicase 提交 2016-03-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
261–628（368 aa）
片段：UNP residues 261-628
|
突变：E280A, D295N, N299A, Q301A, Q302A, K304A, K305A, E307A, K308A, K309A, I354L, D408E, R624A | ZN ZINC ION × 6 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 6 6JJ 6-(2-phenoxyphenyl)[1,2,4]triazolo[3,4-b][1,3,4]thiadiazole × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；25-30% Peg400, 0.1 M LiSO4, 0.1M HEPES (pH 7.0), 0.2 M NaCl
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.221 |
| 5J4V The crystal structure of Inhibitor Bound to JCV Helicase 提交 2016-04-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
261–628（368 aa）
片段：UNP residues 261-628
|
突变：E280A, D295N, N299A, Q301A, Q302A, K304A, K305A, E307A, K308A, K309A, I354L, D408E, R624A | ZN ZINC ION × 6 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 6 SO4 SULFATE ION × 6 6JH 2-(2-phenoxypyridin-3-yl)[1,3]thiazolo[5,4-c]pyridine × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；25-30% Peg400, 0.1 M LiSO4, 0.1M HEPES (pH 7.0), 0.2 M NaCl
|
分辨率 2.94 Å R-free 0.247 |
| 5J4Y The crystal structure of N-(4-(2-(thiazolo[5,4-c]pyridin-2-yl)phenoxy)phenyl)acetamide bound to JCV Helicase 提交 2016-04-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
261–628（368 aa）
片段：UNP residues 261-628
|
突变：E280A, D295N, N299A, Q301A, Q302A, K304A, K305A, E307A, K308A, K309A, I354L, D408E, R624A | ZN ZINC ION × 6 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 6 SO4 SULFATE ION × 12 6JG N-{4-[2-([1,3]thiazolo[5,4-c]pyridin-2-yl)phenoxy]phenyl}acetamide × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；25-30% Peg400, 0.1 M LiSO4, 0.1M HEPES (pH 7.0), 0.2 M NaCl
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.238 |
| 8SUD JC Polyomavirus LTA NLS bound to importin alpha 2 提交 2023-05-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
111–133（23 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；0.85 M sodium citrate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.01 M DTT
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分辨率 2.10 Å R-free 0.218 |