当前蛋白身份:P03485 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1AA7 INFLUENZA VIRUS MATRIX PROTEIN CRYSTAL STRUCTURE AT PH 4.0 提交 1997-01-24 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–158(158 aa)
链 B 1–158(158 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4;20% PEG 3350, 50MM NAH2PO4, PH 4.0
分辨率 2.08 Å R-free 0.280
1EA3 Influenza virus M1 protein 提交 2000-11-03 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 1–164(164 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN RESIDUES 1-164
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7;0.1M HEPES PH7.5, 5% V/V ISOPROPANOL,6-10% PEG4000, pH 7.00
分辨率 2.30 Å R-free 0.313
1EA3 Influenza virus M1 protein 提交 2000-11-03 Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 B 1–164(164 aa) 片段:N-TERMINAL DOMAIN RESIDUES 1-164
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7;0.1M HEPES PH7.5, 5% V/V ISOPROPANOL,6-10% PEG4000, pH 7.00
分辨率 2.30 Å R-free 0.313
1HHI THE ANTIGENIC IDENTITY OF PEPTIDE(SLASH)MHC COMPLEXES: A COMPARISON OF THE CONFORMATION OF FIVE PEPTIDES PRESENTED BY HLA-A2 提交 1993-06-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 58–66(9 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
1HHI THE ANTIGENIC IDENTITY OF PEPTIDE(SLASH)MHC COMPLEXES: A COMPARISON OF THE CONFORMATION OF FIVE PEPTIDES PRESENTED BY HLA-A2 提交 1993-06-30 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 58–66(9 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.50 Å
3VDX Structure of a 16 nm protein cage designed by fusing symmetric oligomeric domains 提交 2012-01-06 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 3–164(162 aa)
链 B 3–164(162 aa)
链 C 3–164(162 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 10.3;298 K;1.2M NaH2PO4, 0.8M K2HPO4, 0.1M CAPS, pH 10.3, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 3.00 Å R-free 0.281
4D9J Structure of a 16 nm protein cage designed by fusing symmetric oligomeric domains 提交 2012-01-11 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 3–164(162 aa)
链 B 3–164(162 aa)
链 C 3–164(162 aa)
链 D 3–164(162 aa)
链 E 3–164(162 aa)
链 F 3–164(162 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 10.3;298 K;1.2M NaH2PO4, 0.8M K2HPO4, 0.1M CAPS, pH 10.3, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 3.92 Å R-free 0.294
4D9J Structure of a 16 nm protein cage designed by fusing symmetric oligomeric domains 提交 2012-01-11 Assembly 2 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 G 3–164(162 aa)
链 H 3–164(162 aa)
链 I 3–164(162 aa)
链 J 3–164(162 aa)
链 K 3–164(162 aa)
链 L 3–164(162 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 10.3;298 K;1.2M NaH2PO4, 0.8M K2HPO4, 0.1M CAPS, pH 10.3, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 3.92 Å R-free 0.294
4IQ4 Structure of a 16 nm protein cage designed by fusing symmetric oligomeric domains, triple mutant, P21212 form 提交 2013-01-10 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 3–165(163 aa)
链 B 3–165(163 aa)
链 C 3–165(163 aa)
链 D 3–165(163 aa)
链 E 3–165(163 aa)
链 F 3–165(163 aa)
突变:K118A, L279Q, Q24T 突变:K118A, L279Q, Q24T 突变:K118A, L279Q, Q24T 突变:K118A, L279Q, Q24T 突变:K118A, L279Q, Q24T 突变:K118A, L279Q, Q24T 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.4;298 K;0.1M Na Citrate pH 4.4, 10% PEG 3,000, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 3.50 Å R-free 0.231
4ITV Structure of a 16 nm protein cage designed by fusing symmetric oligomeric domains, triple mutant, P212121 form 提交 2013-01-18 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 3–164(162 aa)
链 B 3–164(162 aa)
链 C 3–164(162 aa)
链 D 3–164(162 aa)
链 E 3–164(162 aa)
链 F 3–164(162 aa)
链 G 3–164(162 aa)
链 H 3–164(162 aa)
链 I 3–164(162 aa)
链 J 3–164(162 aa)
链 K 3–164(162 aa)
链 L 3–164(162 aa)
突变:K118A, L279Q, Q24T 突变:K118A, L279Q, Q24T 突变:K118A, L279Q, Q24T 突变:K118A, L279Q, Q24T 突变:K118A, L279Q, Q24T 突变:K118A, L279Q, Q24T 突变:K118A, L279Q, Q24T 突变:K118A, L279Q, Q24T 突变:K118A, L279Q, Q24T 突变:K118A, L279Q, Q24T 突变:K118A, L279Q, Q24T 突变:K118A, L279Q, Q24T 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.4;298 K;0.1M Na Citrate pH 4.4, 10% PEG 3000, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 3.60 Å R-free 0.240
4IVJ Structure of a 16 nm protein cage designed by fusing symmetric oligomeric domains, triple mutant, I222 form 提交 2013-01-23 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 3–165(163 aa)
链 B 3–165(163 aa)
链 C 3–165(163 aa)
突变:K118A, L279Q, Q24T 突变:K118A, L279Q, Q24T 突变:K118A, L279Q, Q24T 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.4;298 K;0.1M Na Citrate pH 4.4, 10% PEG 3000, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 7.35 Å R-free 0.288
4QES Structure of a 16 nm protein cage designed by fusing symmetric oligomeric domains, quadruple mutant, I222 form 提交 2014-05-18 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 3–164(162 aa) 片段:SEE REMARK 999
链 B 3–164(162 aa) 片段:SEE REMARK 999
链 C 3–164(162 aa) 片段:SEE REMARK 999
突变:K118A, L279Q, Q24T, Y51A 突变:K118A, L279Q, Q24T, Y51A 突变:K118A, L279Q, Q24T, Y51A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.4;298 K;0.1 M sodium citrate, pH 4.4, 11% PEG3000, 200 mM sodium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.19 Å R-free 0.295
4QF0 Structure of a 16 nm protein cage designed by fusing symmetric oligomeric domains, quadruple mutant, P21212 form 提交 2014-05-19 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 3–164(162 aa) 片段:SEE REMARK 999
链 B 3–164(162 aa) 片段:SEE REMARK 999
链 C 3–164(162 aa) 片段:SEE REMARK 999
链 D 3–164(162 aa) 片段:SEE REMARK 999
链 E 3–164(162 aa) 片段:SEE REMARK 999
链 F 3–164(162 aa) 片段:SEE REMARK 999
突变:K118A, L279Q, Q24T, Y51A 突变:K118A, L279Q, Q24T, Y51A 突变:K118A, L279Q, Q24T, Y51A 突变:K118A, L279Q, Q24T, Y51A 突变:K118A, L279Q, Q24T, Y51A 突变:K118A, L279Q, Q24T, Y51A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;0.1 M Tris, pH 7.0, 10% PEG8000, 0.2 M magnesium chloride, 3% trehalose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 6.49 Å R-free 0.324
4QFF Structure of a 16 nm protein cage designed by fusing symmetric oligomeric domains, quadruple mutant, P212121 form 提交 2014-05-20 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致
链 A 3–164(162 aa) 片段:SEE REMARK 999
链 B 3–164(162 aa) 片段:SEE REMARK 999
链 C 3–164(162 aa) 片段:SEE REMARK 999
链 D 3–164(162 aa) 片段:SEE REMARK 999
链 E 3–164(162 aa) 片段:SEE REMARK 999
链 F 3–164(162 aa) 片段:SEE REMARK 999
链 G 3–164(162 aa) 片段:SEE REMARK 999
链 H 3–164(162 aa) 片段:SEE REMARK 999
链 I 3–164(162 aa) 片段:SEE REMARK 999
链 J 3–164(162 aa) 片段:SEE REMARK 999
链 K 3–164(162 aa) 片段:SEE REMARK 999
链 L 3–164(162 aa) 片段:SEE REMARK 999
突变:K118A, L279Q, Q24T, Y51A 突变:K118A, L279Q, Q24T, Y51A 突变:K118A, L279Q, Q24T, Y51A 突变:K118A, L279Q, Q24T, Y51A 突变:K118A, L279Q, Q24T, Y51A 突变:K118A, L279Q, Q24T, Y51A 突变:K118A, L279Q, Q24T, Y51A 突变:K118A, L279Q, Q24T, Y51A 突变:K118A, L279Q, Q24T, Y51A 突变:K118A, L279Q, Q24T, Y51A 突变:K118A, L279Q, Q24T, Y51A 突变:K118A, L279Q, Q24T, Y51A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.8;298 K;0.1 M sodium/potassium phosphate, pH 5.8, 10% PEG8000, 0.2 M sodium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 7.81 Å R-free 0.339
5CQE 2.1 Angstrom resolution crystal structure of matrix protein 1 (M1; residues 1-164) from Influenza A virus (A/Puerto Rico/8/34(H1N1)) 提交 2015-07-21 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–164(164 aa)
链 B 1–164(164 aa)
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;295 K;Protein: 12.8 mg/mL 10 mM Tris-HCl pH 8.3 500 mM NaCl 0.5 mM TCEP Crsytallization: The JCSG+ Suite (B9: 100 mM Citric acid pH 4.0 20% (w/v) PEG 6000; final pH 5.0 Cryocondition: Crystallization condition + sucrose (50%)
分辨率 2.10 Å R-free 0.197
5EUO PF6-M1-HLA-A2 提交 2015-11-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 J 58–66(9 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;PEG3350, Imidazole
分辨率 2.10 Å R-free 0.281
5EUO PF6-M1-HLA-A2 提交 2015-11-18 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 I 58–66(9 aa)
未记录 IMD IMIDAZOLE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;PEG3350, Imidazole
分辨率 2.10 Å R-free 0.281
6Z5L Helical reconstruction of influenza A virus M1 in complex with nucleic acid. 提交 2020-05-26 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 80 PDB 声明:80-meric(80) 与蛋白数一致
链 A 1–252(252 aa)
突变:R134K 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 10
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;sample was applied 3 times each with 30s adsorption time
分辨率 3.80 Å