当前蛋白身份:P03697
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AVQ TOROIDAL STRUCTURE OF LAMBDA EXONUCLEASE DETERMINED AT 2.4 ANGSTROMS 提交 1997-09-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
1–226(226 aa)
链 B
1–226(226 aa)
链 C
1–226(226 aa)
|
突变:20 AMINO ACID N-TERMINAL HIS-TAG 突变:20 AMINO ACID N-TERMINAL HIS-TAG 突变:20 AMINO ACID N-TERMINAL HIS-TAG | PO4 PHOSPHATE ION × 3 ACT ACETATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.7;277 K;PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.2 M NH2SO4, 0.2 M NACL 0.1 M NAACETATE PH 4.7, AT 4 DEGREES CELSIUS., temperature 277K
|
分辨率 2.40 Å |
| 3SLP Crystal Structure of Lambda Exonuclease in Complex with a 12 BP Symmetric DNA Duplex 提交 2011-06-24 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–226(226 aa)
链 B
1–226(226 aa)
链 C
1–226(226 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;295 K;22% PEG3350, 0.3 M sodium acetate, 0.1 M Tris, 5 mM calcium chloride, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.281 |
| 3SM4 Crystal Structure of the K131A Mutant of Lambda Exonuclease in Complex with a 5'-Phosphorylated 14-mer/12-mer Duplex and Magnesium 提交 2011-06-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–226(226 aa)
链 B
1–226(226 aa)
链 C
1–226(226 aa)
|
突变:K131A 突变:K131A 突变:K131A | PO4 PHOSPHATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;295 K;19% PEG3350, 0.2 M sodium bromide, 5 mM magnesium chloride, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.186 |
| 4WUZ Crystal structure of lambda exonuclease in complex with DNA and Ca2+ 提交 2014-11-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致 |
链 A
1–226(226 aa)
链 B
1–226(226 aa)
链 C
1–226(226 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;295 K;23.4% PEG 3350, 0.3M sodium acetate, 0.1 M Tris
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分辨率 2.38 Å R-free 0.319 |
| 6M9K Crystal structure of lambda exonuclease in complex with the Red beta C-terminal domain 提交 2018-08-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 A
1–226(226 aa)
链 B
1–226(226 aa)
链 C
1–226(226 aa)
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 8;298 K;PEG3350, LISO4, BIS-TRIS
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分辨率 2.30 Å R-free 0.254 |