当前蛋白身份:P03697 重新检索
本组结构的主要差异维度
突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1AVQ TOROIDAL STRUCTURE OF LAMBDA EXONUCLEASE DETERMINED AT 2.4 ANGSTROMS 提交 1997-09-18 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–226(226 aa)
链 B 1–226(226 aa)
链 C 1–226(226 aa)
突变:20 AMINO ACID N-TERMINAL HIS-TAG 突变:20 AMINO ACID N-TERMINAL HIS-TAG 突变:20 AMINO ACID N-TERMINAL HIS-TAG PO4 PHOSPHATE ION × 3 ACT ACETATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.7;277 K;PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 1.2 M NH2SO4, 0.2 M NACL 0.1 M NAACETATE PH 4.7, AT 4 DEGREES CELSIUS., temperature 277K
分辨率 2.40 Å
3SLP Crystal Structure of Lambda Exonuclease in Complex with a 12 BP Symmetric DNA Duplex 提交 2011-06-24 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 A 1–226(226 aa)
链 B 1–226(226 aa)
链 C 1–226(226 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;295 K;22% PEG3350, 0.3 M sodium acetate, 0.1 M Tris, 5 mM calcium chloride, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.30 Å R-free 0.281
3SM4 Crystal Structure of the K131A Mutant of Lambda Exonuclease in Complex with a 5'-Phosphorylated 14-mer/12-mer Duplex and Magnesium 提交 2011-06-27 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 A 1–226(226 aa)
链 B 1–226(226 aa)
链 C 1–226(226 aa)
突变:K131A 突变:K131A 突变:K131A PO4 PHOSPHATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;295 K;19% PEG3350, 0.2 M sodium bromide, 5 mM magnesium chloride, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.88 Å R-free 0.186
4WUZ Crystal structure of lambda exonuclease in complex with DNA and Ca2+ 提交 2014-11-04 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:pentameric(5) 与全部聚合物一致
链 A 1–226(226 aa)
链 B 1–226(226 aa)
链 C 1–226(226 aa)
未记录 CA CALCIUM ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9.5;295 K;23.4% PEG 3350, 0.3M sodium acetate, 0.1 M Tris
分辨率 2.38 Å R-free 0.319
6M9K Crystal structure of lambda exonuclease in complex with the Red beta C-terminal domain 提交 2018-08-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 A 1–226(226 aa)
链 B 1–226(226 aa)
链 C 1–226(226 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 16 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 8;298 K;PEG3350, LISO4, BIS-TRIS
分辨率 2.30 Å R-free 0.254