当前蛋白身份：P03698
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6M9K Crystal structure of lambda exonuclease in complex with the Red beta C-terminal domain 提交 2018-08-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
194–260（67 aa）
链 E
194–260（67 aa）
链 F
194–260（67 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；298 K；PEG3350, LISO4, BIS-TRIS
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分辨率 2.30 Å R-free 0.254 |
| 7UJL Bacteriophage Lambda Red-Beta N-terminal domain helical assembly in complex with dsDNA 提交 2022-03-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 60 PDB 声明：180-meric（180） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–177（177 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-177)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample loading volume ranged between 2 and 3 microlitres. Samples were blotted for 5 seconds prior to vitrification.
|
分辨率 3.30 Å |
| 7UJL Bacteriophage Lambda Red-Beta N-terminal domain helical assembly in complex with dsDNA 提交 2022-03-31 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–177（177 aa）
片段：N-terminal domain (UNP residues 1-177)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Sample loading volume ranged between 2 and 3 microlitres. Samples were blotted for 5 seconds prior to vitrification.
|
分辨率 3.30 Å |
| 8TFU Structure of Red beta C-terminal domain in complex with SSB C-terminal peptide, Form 1 提交 2023-07-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
182–261（80 aa）
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突变：GSHM | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；0.48 M sodium phosphate monobasic monohydrate, 1.2 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.220 |
| 8TFU Structure of Red beta C-terminal domain in complex with SSB C-terminal peptide, Form 1 提交 2023-07-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
182–261（80 aa）
|
突变：GSHM | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；293 K；0.48 M sodium phosphate monobasic monohydrate, 1.2 M potassium phosphate dibasic
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.220 |
| 8TG7 Structure of Red beta C-terminal domain in complex with SSB C-terminal peptide, Form 2 提交 2023-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
182–261（80 aa）
|
突变：N-terminal GSHM | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.6；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.6
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.234 |
| 8TG7 Structure of Red beta C-terminal domain in complex with SSB C-terminal peptide, Form 2 提交 2023-07-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
182–261（80 aa）
|
突变：N-terminal GSHM | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.6；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 8.6
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.234 |
| 8TG8 Structure of Red beta C-terminal domain in complex with SSB C-terminal peptide, Form 3 提交 2023-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
182–261（80 aa）
|
突变：N-terminal GSHM | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.6；298 K；1.2 M sodium citrate tribasic dihydrate, 0.1 M Tris pH 8.6
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分辨率 1.58 Å R-free 0.232 |
| 8TGC Structure of Red beta C-terminal domain in complex with SSB C-terminal peptide, Form 4 提交 2023-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
182–261（80 aa）
|
突变：N-TERMINAL GSHM | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；2.4 M ammonium phosphate dibasic, 0.1M Tris pH 8.5
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.259 |
| 8TGC Structure of Red beta C-terminal domain in complex with SSB C-terminal peptide, Form 4 提交 2023-07-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
182–261（80 aa）
|
突变：N-TERMINAL GSHM | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；2.4 M ammonium phosphate dibasic, 0.1M Tris pH 8.5
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.259 |