当前蛋白身份：P04153
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AY9 WILD-TYPE UMUD' FROM E. COLI 提交 1997-11-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
32–139（108 aa）
链 B
32–139（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；100MM CACODYLATE BUFFER PH 6.0
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.287 |
| 1AY9 WILD-TYPE UMUD' FROM E. COLI 提交 1997-11-15 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
32–139（108 aa）
链 B
32–139（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；100MM CACODYLATE BUFFER PH 6.0
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.287 |
| 1I4V SOLUTION STRUCTURE OF THE UMUD' HOMODIMER 提交 2001-02-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
25–139（115 aa）
链 B
25–139（115 aa）
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突变：G25A 突变：G25A | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）150 mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成
0.9 mM UmuD' U-15N; 150 mM NaCl, 10 mM phosphate, pH 6.0, 1mM DTT, 0.1 mM EDTA | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1.3 mM UmuD' U-15N,13C; 150 mM NaCl, 20 mM phosphate, pH 6.0, 1 mM DTT, 0.1 mM EDTA | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
1.5 mM UmuD' unlabeled; 150 mM NaCl, 20 mM phosphate, pH 6.0, 1 mM DTT, 0.1 mM EDTA | 95% H20, 5% D2O
NMR样品组成
1.4 mM UmuD' unlabeled; 150 mM NaCl, 20 mM phosphate, pH 6.0, 1 mM DTT, 0.1 mM EDTA | 100% D2O
NMR样品组成
0.5 mM UmuD' U-10% 13C; 150 mM NaCl, 20 mM phosphate, pH 6.0, 1 mM DTT, 0.1 mM EDTA | 100% D2O
NMR样品组成
2.7 mM UmuD' U-100% 2H,15N and 2.7 mM unlabeled UmuD'; 150 mM NaCl, 20 mM phosphate, pH 6.0, 1 mM DTT, 0.1 mM EDTA | 95% H20, 5% D2O
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分辨率未提供 |
| 1UMU STRUCTURE DETERMINATION OF UMUD' BY MAD PHASING OF THE SELENOMETHIONYL PROTEIN 提交 1996-03-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
25–139（115 aa）
片段：;UMUD', RESIDUES 25 - 139
;
链 B
25–139（115 aa）
片段：;UMUD', RESIDUES 25 - 139
;
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突变：DEL(1-24), M138T, M61 AND M110 SUBSTITUTED BY SELENOMETHIONINE 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：DEL(1-24), M138T, M61 AND M110 SUBSTITUTED BY SELENOMETHIONINE 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.8；THE CRYSTALS WERE GROWN FROM 600MM LISO4, 20MM MGCL2, 100MM CACODYLATE BUFFER PH 5.8, 5MM DTT AT 20C WITH A PROTEIN CONCENTRATION OF 12-15 MG/ML. THE CRYSTALS WERE FROZEN AT 100K IN PARATONE FOR DATA COLLECTION AT THE NSLS X4A BEAMLINE.
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分辨率 2.50 Å R-free 0.303 |