当前蛋白身份:P04164 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1C52 THERMUS THERMOPHILUS CYTOCHROME-C552: A NEW HIGHLY THERMOSTABLE CYTOCHROME-C STRUCTURE OBTAINED BY MAD PHASING 提交 1997-06-23 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 18–148(131 aa)
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.2;PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 2.8 M AMMONIUM SULFATE, 100 MM TRIS/HCL, PH 8.2
分辨率 1.28 Å R-free 0.224
1FOC Cytochrome C557: improperly folded thermus thermophilus C552 提交 2000-08-27 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 17–148(132 aa)
链 B 17–148(132 aa)
未记录 HEC HEME C × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;297 K;42-46% MPEG 2K (w/v), 0.1M Na cacodylate pH 7.0, 50mM NaCl, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 24K
分辨率 3.00 Å R-free 0.423
1QYZ Characterization of the malformed, recombinant cytochrome rC552 提交 2003-09-12 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 18–148(131 aa)
未记录 HCO 2-ACETYL-PROTOPORPHYRIN IX × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.3;298 K;PEG 5K MME, imidazole-malate buffer, NaCl, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.40 Å R-free 0.260
1R0Q Characterization of the conversion of the malformed, recombinant cytochrome rc552 to a 2-formyl-4-vinyl (Spirographis) heme 提交 2003-09-22 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 18–148(131 aa)
未记录 HFM 2-FORMYL-PROTOPORPHRYN IX × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.3;298 K;MPEG 5K, imidazole-malate buffer, NaCl, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.61 Å R-free 0.255
2FWL The cytochrome c552/CuA complex from Thermus thermophilus 提交 2006-02-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–131(131 aa)
未记录 HEC HEME C × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6;298 K;离子强度(mmCIF原始值)20mM phosphate buffer;压力 ambient
NMR样品组成 0.5mM cytochrome c552 U-15N, 20mM phosphate buffer, 2mM CuA domain, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.5mM CuA domain U-15N, 20mM phosphate buffer, 2mM cytochrome c552, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
3VNW Crystal structure of cytochrome c552 from Thermus thermophilus at pH 5.44 提交 2012-01-18 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 3–131(129 aa)
未记录 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.44;298 K;0.2M Imidazole-Malate, 42% MPEG 5K, pH 5.44, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.97 Å R-free 0.232