当前蛋白身份：P04213
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1U3H Crystal structure of mouse TCR 172.10 complexed with MHC class II I-Au molecule at 2.4 A 提交 2004-07-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
11–122（112 aa）
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突变：G17E,H47Y,I75T,L78S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；21% PEG 3350, 0.1M Hepes and 0.2M LiSO4, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.274 |
| 1U3H Crystal structure of mouse TCR 172.10 complexed with MHC class II I-Au molecule at 2.4 A 提交 2004-07-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 F
11–122（112 aa）
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突变：G17E,H47Y,I75T,L78S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；21% PEG 3350, 0.1M Hepes and 0.2M LiSO4, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.42 Å R-free 0.274 |
| 2AQ1 Crystal structure of T-cell receptor V beta domain variant complexed with superantigen SEC3 mutant 提交 2005-08-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
9–122（114 aa）
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突变：G17E,A52V,S54N,K66E,E80V,L81S,T87S,G96V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 3350, 0.2M tri-ammonium citrate, 0.3% dioxane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.243 |
| 2AQ1 Crystal structure of T-cell receptor V beta domain variant complexed with superantigen SEC3 mutant 提交 2005-08-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
9–122（114 aa）
|
突变：G17E,A52V,S54N,K66E,E80V,L81S,T87S,G96V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 3350, 0.2M tri-ammonium citrate, 0.3% dioxane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.243 |
| 2AQ1 Crystal structure of T-cell receptor V beta domain variant complexed with superantigen SEC3 mutant 提交 2005-08-17 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
9–122（114 aa）
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突变：G17E,A52V,S54N,K66E,E80V,L81S,T87S,G96V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 3350, 0.2M tri-ammonium citrate, 0.3% dioxane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.243 |
| 2AQ1 Crystal structure of T-cell receptor V beta domain variant complexed with superantigen SEC3 mutant 提交 2005-08-17 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
9–122（114 aa）
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突变：G17E,A52V,S54N,K66E,E80V,L81S,T87S,G96V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 3350, 0.2M tri-ammonium citrate, 0.3% dioxane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.243 |
| 2AQ2 Crystal structure of T-cell receptor V beta domain variant complexed with superantigen SEC3 mutant 提交 2005-08-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
9–122（114 aa）
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突变：G17E,A52V,S54N,K66E,L81S | ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris, 0.3 % 1,6-diaminohexane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.80 Å R-free 0.213 |
| 2AQ2 Crystal structure of T-cell receptor V beta domain variant complexed with superantigen SEC3 mutant 提交 2005-08-17 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
9–122（114 aa）
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突变：G17E,A52V,S54N,K66E,L81S | ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；2.0 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris, 0.3 % 1,6-diaminohexane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.80 Å R-free 0.213 |
| 2AQ3 Crystal structure of T-cell receptor V beta domain variant complexed with superantigen SEC3 提交 2005-08-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
9–122（114 aa）
链 C
9–122（114 aa）
链 E
9–122（114 aa）
链 G
9–122（114 aa）
|
突变：G17E, L81S 突变：G17E, L81S 突变：G17E, L81S 突变：G17E, L81S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 3350, 0.2M tri-ammonium citrate, 0.3% dioxane, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 2.30 Å R-free 0.271 |
| 2ICW Crystal structure of a complete ternary complex between TCR, superantigen, and peptide-MHC class II molecule 提交 2006-09-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 J
9–88（80 aa）
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突变：G17E, G42E, L80S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.6；298 K；13-15% PEG 4000, 5% isopropanol, 0.1 M sodium citrate, 2 mM zinc acetate, pH 5.6, EVAPORATION, temperature 298K
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.288 |
| 2ICW Crystal structure of a complete ternary complex between TCR, superantigen, and peptide-MHC class II molecule 提交 2006-09-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 L
9–88（80 aa）
|
突变：G17E, G42E, L80S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.6；298 K；13-15% PEG 4000, 5% isopropanol, 0.1 M sodium citrate, 2 mM zinc acetate, pH 5.6, EVAPORATION, temperature 298K
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.288 |
| 5M00 Crystal structure of murine P14 TCR complex with H-2Db and Y4A, modified gp33 peptide from LCMV 提交 2016-10-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 H
11–102（92 aa）
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未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；19% PEG 6000, 0.1M Tris HCl pH 8.0
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分辨率 1.95 Å R-free 0.237 |
| 5M01 Crystal structure of murine P14 TCR/ H-2Db complex with PA, modified gp33 peptide from LCMV 提交 2016-10-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 H
11–102（92 aa）
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未记录 | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；280 K；19% PEG 6000, 0.1M Tris HCl pH 8.0
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.229 |
| 5M02 Crystal structure of murine P14 TCR / H-2Db with PF, modified gp33 peptide from LCMV 提交 2016-10-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 H
11–102（92 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；19% PEG 6000, 0.1M Tris HCl pH 8.0
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.214 |
| 5WLG Crystal Structure of H-2Db with the GAP501 peptide (SQL) 提交 2017-07-26 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
9–122（114 aa）
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未记录 | NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.2；277 K；18%PEG3350, 2% ethylen glycol, 0.2M CaCl2, 0.1M HEPES pH 7.2
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分辨率 2.10 Å R-free 0.249 |
| 5WLG Crystal Structure of H-2Db with the GAP501 peptide (SQL) 提交 2017-07-26 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 J
9–122（114 aa）
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.2；277 K；18%PEG3350, 2% ethylen glycol, 0.2M CaCl2, 0.1M HEPES pH 7.2
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分辨率 2.10 Å R-free 0.249 |
| 6G9Q Ternary complex of P14 TCR with murine MHC class I H-2 Db in complex with self-antigen derived from dopamine monooxygenase. 提交 2018-04-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 H
11–122（112 aa）
片段：UNP residues 11-122,UNP residues 1-127
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未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；Tris HCl pH 8.0 PEG 6000
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.248 |