当前蛋白身份：P04229
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AQD HLA-DR1 (DRA, DRB1 0101) HUMAN CLASS II HISTOCOMPATIBILITY PROTEIN (EXTRACELLULAR DOMAIN) COMPLEXED WITH ENDOGENOUS PEPTIDE 提交 1997-07-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
30–227（198 aa）
片段：SECRETED EXTRACELLULAR DOMAINS
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 3.5；CRYSTALS GREW AS NEEDLES FROM 10MG/ML HLA-DR1 / PEPTIDE COMPLEX, 15% PEG 4000, 100MM GLYCINE, PH 3.5, AT ROOM TEMPERATURE, OVER ONE WEEK.
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.279 |
| 1AQD HLA-DR1 (DRA, DRB1 0101) HUMAN CLASS II HISTOCOMPATIBILITY PROTEIN (EXTRACELLULAR DOMAIN) COMPLEXED WITH ENDOGENOUS PEPTIDE 提交 1997-07-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 H
30–227（198 aa）
片段：SECRETED EXTRACELLULAR DOMAINS
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 3.5；CRYSTALS GREW AS NEEDLES FROM 10MG/ML HLA-DR1 / PEPTIDE COMPLEX, 15% PEG 4000, 100MM GLYCINE, PH 3.5, AT ROOM TEMPERATURE, OVER ONE WEEK.
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.279 |
| 1AQD HLA-DR1 (DRA, DRB1 0101) HUMAN CLASS II HISTOCOMPATIBILITY PROTEIN (EXTRACELLULAR DOMAIN) COMPLEXED WITH ENDOGENOUS PEPTIDE 提交 1997-07-28 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
30–227（198 aa）
片段：SECRETED EXTRACELLULAR DOMAINS
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 3.5；CRYSTALS GREW AS NEEDLES FROM 10MG/ML HLA-DR1 / PEPTIDE COMPLEX, 15% PEG 4000, 100MM GLYCINE, PH 3.5, AT ROOM TEMPERATURE, OVER ONE WEEK.
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.279 |
| 1AQD HLA-DR1 (DRA, DRB1 0101) HUMAN CLASS II HISTOCOMPATIBILITY PROTEIN (EXTRACELLULAR DOMAIN) COMPLEXED WITH ENDOGENOUS PEPTIDE 提交 1997-07-28 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
30–227（198 aa）
片段：SECRETED EXTRACELLULAR DOMAINS
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 3.5；CRYSTALS GREW AS NEEDLES FROM 10MG/ML HLA-DR1 / PEPTIDE COMPLEX, 15% PEG 4000, 100MM GLYCINE, PH 3.5, AT ROOM TEMPERATURE, OVER ONE WEEK.
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.279 |
| 1BX2 CRYSTAL STRUCTURE OF HLA-DR2 (DRA*0101,DRB1*1501) COMPLEXED WITH A PEPTIDE FROM HUMAN MYELIN BASIC PROTEIN 提交 1998-10-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
3–193（191 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAINS BETA 1, BETA 2
链 E
3–191（189 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAINS BETA 1, BETA 2
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 3.5；15-18% PEG6000 100MM GLYCINE PH3.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.266 |
| 1BX2 CRYSTAL STRUCTURE OF HLA-DR2 (DRA*0101,DRB1*1501) COMPLEXED WITH A PEPTIDE FROM HUMAN MYELIN BASIC PROTEIN 提交 1998-10-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
3–191（189 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAINS BETA 1, BETA 2
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 3.5；15-18% PEG6000 100MM GLYCINE PH3.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.266 |
| 1BX2 CRYSTAL STRUCTURE OF HLA-DR2 (DRA*0101,DRB1*1501) COMPLEXED WITH A PEPTIDE FROM HUMAN MYELIN BASIC PROTEIN 提交 1998-10-12 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
3–193（191 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAINS BETA 1, BETA 2
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 3.5；15-18% PEG6000 100MM GLYCINE PH3.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.266 |
| 1FYT CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX OF A HUMAN ALPHA/BETA-T CELL RECEPTOR, INFLUENZA HA ANTIGEN PEPTIDE, AND MHC CLASS II MOLECULE, HLA-DR1 提交 2000-10-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
30–221（192 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；11% PEG 8000, 1 M NaCl, 100 mM HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 18K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.255 |
| 1HXY CRYSTAL STRUCTURE OF STAPHYLOCOCCAL ENTEROTOXIN H IN COMPLEX WITH HUMAN MHC CLASS II 提交 2001-01-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.1；291 K；0.05 mM mono-potassium dihydrogen phosphate, 20 % (w/v) polyethylene glycol 8000, pH 5.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.258 |
| 1JWM Crystal Structure of the Complex of the MHC Class II Molecule HLA-DR1(HA peptide 306-318) with the Superantigen SEC3 提交 2001-09-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；PEG 4000, Sodium Acetate, Ethylene Glycol, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.228 |
| 1JWS Crystal Structure of the Complex of the MHC Class II Molecule HLA-DR1 (HA peptide 306-318) with the Superantigen SEC3 Variant 3B1 提交 2001-09-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；PEG 4000, Sodium Acetate, Ethylene Glycol, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.232 |
| 1JWU Crystal Structure of the Complex of the MHC Class II Molecule HLA-DR1 (HA peptide 306-318) with the superantigen SEC3 Variant 3B2 提交 2001-09-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；PEG 4000, Sodium Acetate, Ethylene Glycol, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.237 |
| 1KG0 Structure of the Epstein-Barr Virus gp42 Protein Bound to the MHC class II Receptor HLA-DR1 提交 2001-11-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
32–219（188 aa）
片段：BETA CHAIN, EXTRACELLULAR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；300 K；PEG 4000, Ammonium Acetate, Sodium Chloride, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.247 |
| 1KLG Crystal structure of HLA-DR1/TPI(23-37, Thr28-->Ile mutant) complexed with staphylococcal enterotoxin C3 variant 3B2 (SEC3-3B2) 提交 2001-12-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
片段：residues 30-219
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；298 K；PEG 4000, sodium acetate, ethylene glycol, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.246 |
| 1KLU Crystal structure of HLA-DR1/TPI(23-37) complexed with staphylococcal enterotoxin C3 variant 3B2 (SEC3-3B2) 提交 2001-12-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
片段：residues 30-219
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；298 K；PEG 4000, sodium acetate, ethylene glycol, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION,
HANGING DROP at 298K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.220 |
| 1LO5 Crystal structure of the D227A variant of Staphylococcal enterotoxin A in complex with human MHC class II 提交 2002-05-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
片段：extracellular domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.2M (NH4)2SO4, 0.1M MES, 24%(w/v) polyethylen glycol monomethyl ether 5000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.339 |
| 1R5I Crystal structure of the MAM-MHC complex 提交 2003-10-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
片段：beta chain of class II MHC (residues 30-219)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；potassium sodium hosphate, HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.246 |
| 1R5I Crystal structure of the MAM-MHC complex 提交 2003-10-10 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
30–219（190 aa）
片段：beta chain of class II MHC (residues 30-219)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；potassium sodium hosphate, HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.246 |
| 1SEB COMPLEX OF THE HUMAN MHC CLASS II GLYCOPROTEIN HLA-DR1 AND THE BACTERIAL SUPERANTIGEN SEB 提交 1995-11-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 B
30–221（192 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
链 F
30–221（192 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.70 Å R-free 0.327 |
| 1SJE HLA-DR1 complexed with a 16 residue HIV capsid peptide bound in a hairpin conformation 提交 2004-03-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
片段：Extracelluar domain of HLA-DRB*0101
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；277 K；PEG-MME 5000, Ethylene Glycol, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.45 Å R-free 0.223 |
| 1SJH HLA-DR1 complexed with a 13 residue HIV capsid peptide 提交 2004-03-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
片段：Extracellular domain of HLA-DRB*0101
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.2；277 K；PEG 4000, Ethylene glycol, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.245 |
| 1T5W HLA-DR1 in complex with a synthetic peptide (AAYSDQATPLLLSPR) 提交 2004-05-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
片段：Extracellular domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；PEG 6000, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.255 |
| 1T5W HLA-DR1 in complex with a synthetic peptide (AAYSDQATPLLLSPR) 提交 2004-05-05 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
30–219（190 aa）
片段：Extracellular domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；PEG 6000, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.255 |
| 1T5X HLA-DR1 in complex with a synthetic peptide (AAYSDQATPLLLSPR) and the superantigen SEC3-3B2 提交 2004-05-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
片段：Extracellular domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；277 K；PEG 4000, Ethylene Glycol, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.241 |
| 2FSE Crystallographic structure of a rheumatoid arthritis MHC susceptibility allele, HLA-DR1 (DRB1*0101), complexed with the immunodominant determinant of human type II collagen 提交 2006-01-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
33–219（187 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% polyethylene glycol 3,350 and 200 mM ammonium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.295 |
| 2FSE Crystallographic structure of a rheumatoid arthritis MHC susceptibility allele, HLA-DR1 (DRB1*0101), complexed with the immunodominant determinant of human type II collagen 提交 2006-01-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
33–219（187 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% polyethylene glycol 3,350 and 200 mM ammonium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.295 |
| 2G9H Crystal Structure of Staphylococcal Enterotoxin I (SEI) in Complex with a Human MHC class II Molecule 提交 2006-03-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 2 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；10% dioxane, 1.2 mM (NH4)2SO4 and 100 mM Hepes pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.252 |
| 2IAM Structural basis for recognition of mutant self by a tumor-specific, MHC class II-restricted TCR 提交 2006-09-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
片段：residues 1-190 (30-219)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；8% PEG6000, 0.1M di-ammonium phosphate, 0.1M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.279 |
| 2IAN Structural basis for recognition of mutant self by a tumor-specific, MHC class II-restricted TCR 提交 2006-09-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
片段：residues 1-190 (30-219)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；10% PEG6000, 0.1M di-ammonium phosphate, 0.1M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.296 |
| 2IAN Structural basis for recognition of mutant self by a tumor-specific, MHC class II-restricted TCR 提交 2006-09-08 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 G
30–219（190 aa）
片段：residues 1-190 (30-219)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；10% PEG6000, 0.1M di-ammonium phosphate, 0.1M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.296 |
| 2IAN Structural basis for recognition of mutant self by a tumor-specific, MHC class II-restricted TCR 提交 2006-09-08 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 L
30–219（190 aa）
片段：residues 1-190 (30-219)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；10% PEG6000, 0.1M di-ammonium phosphate, 0.1M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.296 |
| 2IAN Structural basis for recognition of mutant self by a tumor-specific, MHC class II-restricted TCR 提交 2006-09-08 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 Q
30–219（190 aa）
片段：residues 1-190 (30-219)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；10% PEG6000, 0.1M di-ammonium phosphate, 0.1M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.296 |
| 2ICW Crystal structure of a complete ternary complex between TCR, superantigen, and peptide-MHC class II molecule 提交 2006-09-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
片段：residues 30-219
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.6；298 K；13-15% PEG 4000, 5% isopropanol, 0.1 M sodium citrate, 2 mM zinc acetate, pH 5.6, EVAPORATION, temperature 298K
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.288 |
| 2ICW Crystal structure of a complete ternary complex between TCR, superantigen, and peptide-MHC class II molecule 提交 2006-09-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
30–219（190 aa）
片段：residues 30-219
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 5.6；298 K；13-15% PEG 4000, 5% isopropanol, 0.1 M sodium citrate, 2 mM zinc acetate, pH 5.6, EVAPORATION, temperature 298K
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.288 |
| 2IPK Crystal Structure of the MHC Class II Molecule HLA-DR1 in Complex with the Fluorogenic Peptide, AcPKXVKQNTLKLAT (X=3-[5-(dimethylamino)-1,3-dioxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl]-L-alanine) and the Superantigen, SEC3 Variant 3B2 提交 2006-10-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
片段：Extracellular domain, residues 30-219
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.3；277 K；PEG 4000, Ethylene Glycol, Sodium Acetate, pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.224 |
| 2OJE Mycoplasma arthritidis-derived mitogen complexed with class II MHC molecule HLA-DR1/HA complex in the presence of EDTA 提交 2007-01-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
片段：extracellular domain, residues 30-219
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；1.7M potassium sodium phosphate, 0.1M HEPES, 2 mM EDTA, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.261 |
| 2OJE Mycoplasma arthritidis-derived mitogen complexed with class II MHC molecule HLA-DR1/HA complex in the presence of EDTA 提交 2007-01-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 F
30–219（190 aa）
片段：extracellular domain, residues 30-219
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；1.7M potassium sodium phosphate, 0.1M HEPES, 2 mM EDTA, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.261 |
| 2OJE Mycoplasma arthritidis-derived mitogen complexed with class II MHC molecule HLA-DR1/HA complex in the presence of EDTA 提交 2007-01-12 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
片段：extracellular domain, residues 30-219
链 F
30–219（190 aa）
片段：extracellular domain, residues 30-219
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；298 K；1.7M potassium sodium phosphate, 0.1M HEPES, 2 mM EDTA, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.261 |
| 2XN9 Crystal structure of the ternary complex between human T cell receptor, staphylococcal enterotoxin H and human major histocompatibility complex class II 提交 2010-07-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
30–219（190 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN, RESIDUES 30-219
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；15% W/V PEG 5000 MME, 0.1 M BIS-TRIS PH 7.0, 0.1 M NACL
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.272 |
| 3L6F Structure of MHC class II molecule HLA-DR1 complexed with phosphopeptide MART-1 提交 2009-12-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
30–221（192 aa）
片段：UNP residues 30-221
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；298 K；20% (w/v) PEG 8000 and 0.1 M sodium cacodylate, pH 6.5, EVAPORATION, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.249 |
| 3PDO Crystal Structure of HLA-DR1 with CLIP102-120 提交 2010-10-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
30–227（198 aa）
片段：extracellular domain
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 FMT FORMIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；PEG 3350, NaCitrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.240 |
| 3PGC Crystal Structure of HLA-DR1 with CLIP106-120, flipped peptide orientation 提交 2010-11-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
30–227（198 aa）
片段：UNP residues 30-227
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；PEG 1500, MIB buffer, pH 6.0, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.250 |
| 3PGC Crystal Structure of HLA-DR1 with CLIP106-120, flipped peptide orientation 提交 2010-11-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
30–227（198 aa）
片段：UNP residues 30-227
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；PEG 1500, MIB buffer, pH 6.0, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.250 |
| 3PGD Crystal Structure of HLA-DR1 with CLIP106-120, canonical peptide orientation 提交 2010-11-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
30–227（198 aa）
片段：UNP residues 30-227
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCitrate, BisTris propane, pH 6.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 277K
|
分辨率 2.72 Å R-free 0.242 |
| 3PGD Crystal Structure of HLA-DR1 with CLIP106-120, canonical peptide orientation 提交 2010-11-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
30–227（198 aa）
片段：UNP residues 30-227
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCitrate, BisTris propane, pH 6.5, vapor diffusion, sitting drop, temperature 277K
|
分辨率 2.72 Å R-free 0.242 |
| 3QXA HLA-DR1 bound with CLIP peptide 提交 2011-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
片段：UNP residues 30-219
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；PEG 4000, 10% Glycerol, 100mM Sodium Acetate pH 5.6, 5mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.235 |
| 3QXA HLA-DR1 bound with CLIP peptide 提交 2011-03-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
30–219（190 aa）
片段：UNP residues 30-219
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；PEG 4000, 10% Glycerol, 100mM Sodium Acetate pH 5.6, 5mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.71 Å R-free 0.235 |
| 3QXD F54C HLA-DR1 bound with CLIP peptide 提交 2011-03-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
片段：UNP residues 30-219
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；PEG 4000, 10% Glycerol, 100mM Sodium Acetate pH 5.6, 5mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 3QXD F54C HLA-DR1 bound with CLIP peptide 提交 2011-03-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
30–219（190 aa）
片段：UNP residues 30-219
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；PEG 4000, 10% Glycerol, 100mM Sodium Acetate pH 5.6, 5mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 3S4S Crystal structure of CD4 mutant bound to HLA-DR1 提交 2011-05-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
30–221（192 aa）
片段：UNP residues 30-221
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；PEG 8000, (NH4)SO4, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.286 |
| 3S4S Crystal structure of CD4 mutant bound to HLA-DR1 提交 2011-05-20 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
30–221（192 aa）
片段：UNP residues 30-221
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；PEG 8000, (NH4)SO4, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.286 |
| 4AEN HLA-DR1 with covalently linked CLIP106-120 in reversed orientation 提交 2012-01-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
30–227（198 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN, RESIDUES 30-227
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS, PH 8.0
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.221 |
| 4AH2 HLA-DR1 with covalently linked CLIP106-120 in canonical orientation 提交 2012-02-03 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
30–227（198 aa）
片段：EXTRACELLULAR DOMAIN, RESIDUES 106-120,30-227
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；0.2 M LICL, 20% (W/V) PEG6000, 0.1 M HEPES, PH 7.0
|
分辨率 2.36 Å R-free 0.240 |
| 4E41 Structural basis for the recognition of mutant self by a tumor-specific, MHC class II-restricted T cell receptor G4 提交 2012-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
片段：unp residues 30-219
|
未记录 | NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；298 K；20% (wt/vol) polyethylene glycol 1000, 0.2 M calcium acetate, 0.1 M imidazole, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.264 |
| 4E41 Structural basis for the recognition of mutant self by a tumor-specific, MHC class II-restricted T cell receptor G4 提交 2012-03-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 G
30–219（190 aa）
片段：unp residues 30-219
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8；298 K；20% (wt/vol) polyethylene glycol 1000, 0.2 M calcium acetate, 0.1 M imidazole, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.264 |
| 4FQX Crystal structure of HLA-DM bound to HLA-DR1 提交 2012-06-25 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
30–221（192 aa）
片段：unp residues 30-221
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.240 |
| 4FQX Crystal structure of HLA-DM bound to HLA-DR1 提交 2012-06-25 | Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
30–221（192 aa）
片段：unp residues 30-221
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.240 |
| 4GBX Crystal structure of an immune complex at pH 6.5 提交 2012-07-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
30–220（191 aa）
|
突变：S59C | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；0.1M MES, 6% PEG 20000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K, pH 6.5
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.250 |
| 4I5B Structure of human MHC class II protein HLA-DR1 carrying an influenza hemagglutinin peptide partially filling the binding groove 提交 2012-11-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
31–222（192 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.3；293 K；100 mM sodium acetate, 9% PEG 10000, pH 4.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.237 |
| 4I5B Structure of human MHC class II protein HLA-DR1 carrying an influenza hemagglutinin peptide partially filling the binding groove 提交 2012-11-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
31–222（192 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.3；293 K；100 mM sodium acetate, 9% PEG 10000, pH 4.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.12 Å R-free 0.237 |
| 4OV5 Structure of HLA-DR1 with a bound peptide with non-optimal alanine in the P1 pocket 提交 2014-02-20 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
片段：Secreted extracellular domain (UNP residues 30-219)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；4% PEG4000, 10% ethylene glycol, 100 mM sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.239 |
| 4OV5 Structure of HLA-DR1 with a bound peptide with non-optimal alanine in the P1 pocket 提交 2014-02-20 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
30–219（190 aa）
片段：Secreted extracellular domain (UNP residues 30-219)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；4% PEG4000, 10% ethylene glycol, 100 mM sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.239 |
| 4OV5 Structure of HLA-DR1 with a bound peptide with non-optimal alanine in the P1 pocket 提交 2014-02-20 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 H
30–219（190 aa）
片段：Secreted extracellular domain (UNP residues 30-219)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；4% PEG4000, 10% ethylene glycol, 100 mM sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.239 |
| 4OV5 Structure of HLA-DR1 with a bound peptide with non-optimal alanine in the P1 pocket 提交 2014-02-20 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 K
30–219（190 aa）
片段：Secreted extracellular domain (UNP residues 30-219)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；4% PEG4000, 10% ethylene glycol, 100 mM sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.239 |
| 4OV5 Structure of HLA-DR1 with a bound peptide with non-optimal alanine in the P1 pocket 提交 2014-02-20 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 N
30–219（190 aa）
片段：Secreted extracellular domain (UNP residues 30-219)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；4% PEG4000, 10% ethylene glycol, 100 mM sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.239 |
| 4OV5 Structure of HLA-DR1 with a bound peptide with non-optimal alanine in the P1 pocket 提交 2014-02-20 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Q
30–219（190 aa）
片段：Secreted extracellular domain (UNP residues 30-219)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；4% PEG4000, 10% ethylene glycol, 100 mM sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.239 |
| 4X5W HLA-DR1 with CLIP102-120(M107W) 提交 2014-12-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
30–227（198 aa）
片段：extracellular, UNP residues 30-227
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；0.2 M K/Na-tartrate, 20% (w/v) PEG3350, 0.1M BisTrisPropane, pH 8.5
|
分辨率 1.34 Å R-free 0.170 |
| 4X5X HLA-DR1 mutant bN82A with covalently linked CLIP106-120(M107W) 提交 2014-12-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
30–227（198 aa）
片段：extracellular, UNP residues 30-227
|
突变：N82A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2M Sodium nitrate, 20% w/v PEG 3350, 0.1M Bis Tris propane pH 7.5
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.262 |
| 4X5X HLA-DR1 mutant bN82A with covalently linked CLIP106-120(M107W) 提交 2014-12-06 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
30–227（198 aa）
片段：extracellular, UNP residues 30-227
|
突变：N82A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.2M Sodium nitrate, 20% w/v PEG 3350, 0.1M Bis Tris propane pH 7.5
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.262 |
| 5V4N Structure of HLA-DR1 with bound alpha3(135-145) peptide 提交 2017-03-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
29–219（191 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298.15 K；23% PEG 3350, 0.1M KNO3, and 0.1M bis-tris-propane (pH 7.0)
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.263 |
| 5V4N Structure of HLA-DR1 with bound alpha3(135-145) peptide 提交 2017-03-10 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
29–219（191 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298.15 K；23% PEG 3350, 0.1M KNO3, and 0.1M bis-tris-propane (pH 7.0)
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.263 |
| 6CQJ Crystal structure of DR1 presenting the RQ13 peptide 提交 2018-03-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
31–219（189 aa）
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；HEPES pH 7.5, Na acetate, PEG 4000
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.249 |
| 6CQJ Crystal structure of DR1 presenting the RQ13 peptide 提交 2018-03-15 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
31–219（189 aa）
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；HEPES pH 7.5, Na acetate, PEG 4000
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.249 |
| 6CQJ Crystal structure of DR1 presenting the RQ13 peptide 提交 2018-03-15 | Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 H
31–219（189 aa）
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；HEPES pH 7.5, Na acetate, PEG 4000
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.249 |
| 6CQR Crystal structure of F24 TCR -DR1-RQ13 peptide complex 提交 2018-03-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；Tris-HCl pH 8, NaCl PEG 3350
|
分辨率 3.04 Å R-free 0.254 |
| 6CQR Crystal structure of F24 TCR -DR1-RQ13 peptide complex 提交 2018-03-16 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 G
30–219（190 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；Tris-HCl pH 8, NaCl PEG 3350
|
分辨率 3.04 Å R-free 0.254 |
| 6HBY HLA class II peptide flanking residues tune the immunogenicity of a human tumor-derived epitope 提交 2018-08-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
30–219（190 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 PO4 PHOSPHATE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.02 M Sodium/potassium phosphate, 0.1 M Bis-Tris propane pH 7.5, 20 % PEG 3350
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.241 |
| 6HBY HLA class II peptide flanking residues tune the immunogenicity of a human tumor-derived epitope 提交 2018-08-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
30–219（190 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.02 M Sodium/potassium phosphate, 0.1 M Bis-Tris propane pH 7.5, 20 % PEG 3350
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.241 |
| 6QZA HLA-DR1 with GMF Influenza PB1 Peptide 提交 2019-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 BBB
30–219（190 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；Seeded with DR1-QAR crystals. 0.2M LiCl, 20% PEG 6K, 0.1M MES
|
分辨率 3.09 Å R-free 0.226 |
| 6QZA HLA-DR1 with GMF Influenza PB1 Peptide 提交 2019-03-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 EEE
30–219（190 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；Seeded with DR1-QAR crystals. 0.2M LiCl, 20% PEG 6K, 0.1M MES
|
分辨率 3.09 Å R-free 0.226 |
| 6QZC HLA-DR1 with the QAR Peptide 提交 2019-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 BBB
30–219（190 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；0.1 M Na Cacodylate,
0.2 M NH4 SO4,
20% PEG 8000
|
分辨率 1.64 Å R-free 0.240 |
| 6QZD HLA-DR1 with SGP Influenza Matrix Peptide 提交 2019-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 BBB
30–219（190 aa）
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；0.1 M Tris
0.2 M NH4 SO4
25% PEG 4000
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.254 |
| 6QZD HLA-DR1 with SGP Influenza Matrix Peptide 提交 2019-03-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 EEE
30–219（190 aa）
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；0.1 M Tris
0.2 M NH4 SO4
25% PEG 4000
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.254 |
| 6R0E Structure of F11TCR in complex with DR1 MHC Class II presenting PKYVKQNTLKLAT 提交 2019-03-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 BBB
30–219（190 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 SO4 SULFATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；0.1 M Na Cacodylate,
0.2 M NH4 SO4, 15 %
PEG 8000
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.233 |