当前蛋白身份:P06030
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1QLE CRYO-STRUCTURE OF THE PARACOCCUS DENITRIFICANS FOUR-SUBUNIT CYTOCHROME C OXIDASE IN THE COMPLETELY OXIDIZED STATE COMPLEXED WITH AN ANTIBODY FV FRAGMENT 提交 1999-08-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 C
1–273(273 aa)
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未记录 | HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8;pH 8.00
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分辨率 3.00 Å R-free 0.309 |
| 7ATE Cytochrome c oxidase structure in P-state 提交 2020-10-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
1–274(274 aa)
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未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 PEO HYDROGEN PEROXIDE × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 1 PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;4 second before plunging
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分辨率 2.40 Å |
| 7ATN Cytochrome c oxidase structure in R-state 提交 2020-10-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
1–274(274 aa)
|
未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;4 seconds before plunging
|
分辨率 2.66 Å |
| 7AU3 Cytochrome c oxidase structure in F-state 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
1–274(274 aa)
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未记录 | MN MANGANESE (II) ION × 1 HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 O OXYGEN ATOM × 1 2FK SUPEROXO ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;4 seconds before plunging
|
分辨率 2.56 Å |
| 7AU6 Cytochrome c oxidase structure in O-state 提交 2020-11-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
1–274(274 aa)
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未记录 | HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 OXY OXYGEN MOLECULE × 6 PEO HYDROGEN PEROXIDE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 CUA DINUCLEAR COPPER ION × 1 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;4 seconds before plunging
|
分辨率 2.40 Å |